[变异毒株] Omicron: 毒王族谱（2023年5月29日第四次更新）

大家晚上好~

由于超级奶爸Ben Murrell老师休完产假华丽回归，昨天咱们终于更新了中断了小半年的《天阶序论》，

今天咱们再接再厉，继续利用Murrell老师的东西，更新另外一个中断了小半年的《毒王族谱》系列呗。

本系列的上一集请见：《Omicron: 毒王族谱（2023年1月10日第三次更新）》。

顺便简单说一说这几个变异株相关系列的定位：

• 《巴塞尔报告》系列是搬运的巴塞尔大学Cornelius小哥的变异株报告，主要是针对整个益生菌19变异进度的综述；
  
• 《天阶序论》系列主要利用Murrell老师（或Gerstung老师）的变异株增速排行榜，用趋同突变天阶假说来介绍当前增速比较猛的种子选手们；
  
• 而《毒王族谱》系列则主要利用Cornelius小哥和Murrell老师两个版本的downsampled演化树来介绍Omicron大家族几大重点亚谱系或子分支的现状。

比如开局的两张图，就是Cornelius小哥利用Nextstrain平台撸出来的两棵演化树，

其中上图是2023年1月份版本，下图则是5月份版本…

是不是差别还挺大？

具体而言，在变异株数量方面：

• 2022年9月22日，即本系列第一集时，Omicron大家族（除了BA.1之外）总共298个子分支；
• 到了2022年10月15日，即本系列第二集时，这个数字飙到了464个；
• 再到2023年1月10日，即本系列第三集时，这个数字又跃升到673个；
• 截止2023年5月27日，即本次更新时，Omicron大家族（除了BA.1，但包含几个Deltacron重组株）一共有1266个子分支；
• Pango命名法的字母编码，已经排到了GG……最新命名毒株GG.1，是XBB.1.5.38.1的缩写。

这这这……说好的“逐渐进入稳定期”呢？

算了，回到主题啊，咱们先看看Murrell老师的演化树~

——请品鉴（可能需要点开大图）：

解说一下：

• 这棵树的每一个小圆点，代表一种子分支；
• 连接小圆点的枝干越长，则代表其相对于父系毒株的突变数量越多；
• 小圆点越靠右，则代表其相对于BA.2的累计突变数量越多；
  
• 小圆点的颜色越偏红，则代表其相对于XBB.1.5的增速越快。
  

所以一图秒懂啊，

当前的增速之王，也就是橙色或者红色的那些小圆点，主要包括：

• XBB2.3分支的XBB.2.3.3和XBB.2.3.11；
• XBB.1.18分支的FE.1.1和FE.1.2；
• XBB.1.16分支的XBB.1.16.1、XBB.1.16.2和FU.1；
• XBB.1.22分支的FY.2和FY.3（XBB.1.22最近刚刚喜提专属外号）
  
• XBB.1.9分支的EG.2和EG.5.1。
  

基本上可以说是XBB大家族内部的大乱斗了……

顺便一提……上面颜色最偏红的这些个小圆点里头，

有好几个……都是传说中的田园株

……

……

这算不算是……给世界一点小小的____震撼呢？

——请品鉴：

最后，为了避免各位看着这琳琅满目的Pango代码犯迷糊，

下面特意搬运从FA开始到GG截止的lineage note，

希望对大家有帮助。

——请品鉴：

以上，搬运完毕。

各位明天见啦。

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