[变异毒株] 疯狂的BA.6（BA.2！）
各位晚上好啊~
今天咱们又来八卦一个阴间变异株吧。
这个神神秘秘的变异株来自以色列，
前几天其实已经在星球那边小范围抢跑过了。
——请品鉴：
但由于当时序列还没上传到GISAID，所以不方便公开八卦。
不过刚才以色列卫生部终于把这个序列给公开了，
然后Shay桑也紧接着发了推~
——请再品鉴：
翻译成人话：
“这货到底能有多疯狂？”
“我们以色列某实验室刚刚上传了一条测序记录到GISAID”
“这条序列的宿主并不是长期感染者，传染给他的人也不是（也就是说这条序列对应的病毒具有人传人能力）”
“而且这条序列造型太阴间了，以至于让我不得不请教一些同行，来排除它是BA.6的可能性”
BA.6？
BA.6！
BA.6……
那么，这个让Shay桑这样见过大世面的人直呼BA.6的玩意儿，
它到底是什么造型呢？
下面咱就把星球那边的抢跑内容发到公众号来，
让更多朋友一起来品尝焦虑的感觉
事情原委是这样的：
以色列当地某病例因呼吸道感染症状（肺部感染、呼吸困难）住院，并检测阳性；
这位男性在本次发病之前没有持续症状，病历记录显示他也没有基础病和免疫失调——而目前以色列的测序策略，刚好是重点测这些没有基础病还重症住院的病例，所以才逮住了这个毒株（啧啧，以色列这检测和测序的准头，还可以啊）；
流调显示，病例没有出境旅行史，进一步流调显示，这个病例发病之前，同住人当中有两位也出现过症状；
更加进一步的流调又显示，病例刚好非常深入简出，上述两位同住人就是他几乎唯一的密接对象（啧啧，以色列这流调的本事，也还可以啊）
基于以上信息，Shay桑他们初步判断，这位病例不是长期感染突然发病，而是续发的急性感染。
或者说得更直白一点，是同住的两人之一传染了这位倒霉鬼。
并且，很不巧，对两位同住人的初步调查发现，她们之前的发病，很可能也是急性感染，而不是长期感染。
所以划重点了啊：不是长期感染不是长期感染不是长期感染~
这说明，今天将要八卦的这个阴间毒株，它很可能具有人传人能力。
那么这货到底长啥样，以至于让Shay桑他们大费周章呢？
下面解读解读。
这货相对于原始株有120个左右突变，相对于BA.2则有54个左右突变。
Nextclade跑分，按BA.2骨架来算的话，受体亲和度和免疫逃逸都不错， 其中：
免疫逃逸1.20，作为对比，EG.5.1.6得分也才1.02，BA.2.38得分更是只有0.25；
受体亲和度得分0.95（！），也算是非常高的水平了。
——两个跑分成绩请具体品鉴：
突变列表这是下面这种造型……
——请再品鉴：
复读一下刺突蛋白部分啊：
16MPLF插入，T19I, R21T, 24/26del, S:A27S, S:S50L, 60/70del, V127F, G142D, Y144del, F157S, R158G, N211del, L212I, V213G, L216F, H245N, A264D, I332V, G339H, K356T, S371F, S373P, S375F, T376A, R403K, D405N, K417N, N440K, V445H, G446S, N450D, L452W, N460K, S:S477N, T478K, N481K, V483del, E484K, F486P, Q498R, N501Y, Y505H, A570V, D614G, P621S, H655Y, I670V, N679K, P681R, N764K, D796Y, S939F, Q954H, N969K, P1143L
总之就是突出一个亲妈不认吧~
至于演化树就不放了……Usher显然不太能够处理阴间程度这么高的玩意儿，树完全撸歪了不说，还有很多突变都直接给屏蔽了。
总之，为啥Shay要把这货称作“BA.6”呢？
主要是因为，他认为这货相对于BA.2的回复突变实在太多了，不太可能发生这么多回复。同时它还带了个BA.1的特征突变ORF1a:A2710T，但又没有明显的重组痕迹。
另外，Shay被“急性感染”、“发生了续发感染”这些信息影响了思路，觉得这货不是持续感染养出来的。
不过仔细一看的话，绝大多数回复突变都在刺突蛋白S1，所以也不是不可能的事……
而附属基因部分，怎么看怎么像是BA.2。
最后，最新的流调发现：两位早期出现过症状的密接之一，也就这位病例家的保姆，是印度人，并有印度旅行史。
于是局面一下子就打开了……
这货的骨架基本就是BA.2的造型，甚至还依稀有一点BA.2.38的影子。而当初BA.2在印度可是一桶浆糊大半年（BA.2.38更是印度特产）。
所以更大的可能，是BA.2（或者BA.2.38）长期感染憋出了阴间子毒株，并且不知怎么搞的恢复了传染性，还制造了输出病例，最终辗转到以色列才被发现。
——Shay桑最后的总结陈词如下：
翻译成人话：
“如果姑且认为这货是BA.2的二代跃迁变异株的话，那么它就一口气憋出来了18个RBD结构域氨基酸突变（包括3个回复和1个缺失）、一段4个氨基酸长度的插入，一大堆NTD结构域突变，以及传说中的P681R——这货到BA.2的突变距离，比到原始株还要远。”
“所以，请各位牢记，Omicron也不过是原始株的二代跃迁变异株罢了。谁知道Omicron再发生一次跃迁将会是说明造型？只要这类疯狂的阴间变异株还在市面上冒头（哪怕数量很少），噩梦就还没有结束。”
至于Shay桑所谓的“Things are not over”，
具体是指的什么事情呢？
那当然是这件事啦：
以上，抢跑完毕。
各位明天见！
欢 迎关 注
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