批驳有关新冠病毒起源的六个错误假说
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本文经授权转载自 l 微信公众号“秦朔朋友圈”
ID l qspyq2015
作者 l 悟00000空
新冠病毒从去年12月开始浮现，搅得人类不得安宁。中国刚刚控制住，国外又暗潮汹涌。目前全球40多个国家9万多人感染。2月27日宁夏确诊了一个从伊朗回国的新冠感染者。3月1日深圳确诊了一个从英国回国的新冠感染者。这样国与国“交叉感染”，来回输入，没完没了。
关于这个病毒的起源，坊间出现了不少假说。至少有六个是明显错误的，“美国承认说”、“起源于伊朗说”、“七年前就有了”、“军运会输入说”、“美国今年的流感其实是新冠说”、“病毒基因单倍型辈份说”。我们一起来看一下。
首先，错得最低级的是翻译错误。前两天看到群里铺天盖地发一个美国电视新闻节目截图，配的文字是“美国终于承认，新冠起源于美国，中国不能再背锅了”。
然后一看英文，是这么说的：
Breaking News: CDC confirms first coronavirus case of ‘unknown’ origin in U.S.
中文的正确翻译是：
“突发消息：CDC确诊美国首例无法溯源的新冠病毒患者。”
严格来讲，英文只说是coronavirus冠状病毒，都没有说是新型冠状病毒。
冠状病毒早就有，它是一个大型病毒家族。1937年，冠状病毒首次从一种鸟类传染性支气管炎病毒中分离出来，人类第一次知道了这种病毒。它可以感染鼠、狗、猫、鸡、马、猪和牛等家禽和牲畜，造成严重破坏。
感染人类的冠状病毒在20世纪60年代首次在普通感冒患者的鼻子中发现，因其表面皇冠状的突起物而得名Coronavirus“冠状病毒”。Corona就是冠状物、皇冠的意思。有个来自墨西哥的啤酒品牌就叫Corona Beer，本来挺贵气的一个名字，不小心和病毒撞车了，成了不少段子的梗。谷歌上“corona beer virus”的搜索量暴增，CEO紧急出面澄清也无济于事，公司估计将损失1.32亿英镑。
到目前为止，人类发现的感染鸟类和哺乳动物的冠状病毒毒株有15种，感染人的冠状病毒毒株有7种，包括2019年最新发现的这一株。这7种中的4种会引起普通的感冒症状，分别为:
229E、NL63、OC43、HKU1，
剩下的两种比较厉害
2003年发现的SARS（非典）
以及2013年发现的MERS-CoV（中东呼吸综合征）
病死率分别为10%和35%
所以，虽然美国这则新闻用的词只是coronavirus（冠状病毒），但是结合背景可以知道它指的就是2019年新发现的这种冠状病毒。不管怎么样，它的意思肯定不是说这个病毒起源于美国，而是说美国首次发现无法追踪传染链的患者。
这其实是很正常的，因为“这是个很有个性的病毒”（张文宏）。这个病毒潜伏期就能传染，而且潜伏期很长，到底多长其实谁也不知道，14天只是局部经验数字，到底多少天要等疫情结束后研究得出。发病后可以无症状，继续传染。传染值R0在2-3之间（当然确定的数字也要等疫情结束后研究得出），就是一个感染者可以传染给两到三人。
这就意味着这个病毒比SARS和MERS难控制得多，因为SARS和MERS只通过已经出现症状的患者传播，且传染力低很多。而新冠在短短四分之一的时间内就已经造成了十倍于SARS的确诊病例。
传播渠道既有飞沫、气溶胶，还有接触传染。可以多代传染，目前已经发现至少四代传染，也就是A传给B，B传给C，C传给D。无法溯源其实是不奇怪的。美国的第一例是从武汉输入的，此后出现无法溯源的情况实属正常。
总之有关病毒起源的这个流派纯粹是无稽之谈，要么英文没有学好，要么别有用心。
有关病毒起源的第二个流派是说这个病毒起源于伊朗，因为伊朗当局到现在也没有找到病毒的源头，不能证明是中国输入的。
伊朗是除中国、韩国、意大利以外疫情最严重的国家，伊朗有三个特点很要命，一是缺水导致清洁困难，二是基础医疗条件差，三是经常聚集祷告。伊朗当局怀疑病毒的来源是一些前往库姆的朝觐者，而他们是被在库姆建造太阳能发电厂的中国工人感染。但是无法核实。给定我们前面介绍的这个病毒的特性，无法溯源很正常，在伊朗这样一个爱聚集祷告的国家就更正常了。韩国也是同样原因。
其实以后他们可以考虑云祷告，在虚拟空间聚集祷告，就像现在中国喝酒、夜总会蹦迪、婚礼、合同签约、公司上市仪式等等活动都搬到了虚拟空间中了。祷告应该也可以，特别是现在这种特殊时期，神应该不会怪罪的。当然如果他们认为他们的目的就是死亡，是天主在通过这个病毒招唤他们，那就没办法了。
世卫组织对伊朗表示很担心，怀疑伊朗瞒报了疫情的严重性。因为伊朗驻梵蒂冈大使、伊斯兰议会国家安全与外交政策委员会主席、议会议员、卫生部副部长、副总统都被感染了。大使已经在库姆死亡。副总统本人是免疫学博士。卫生部副部长前一天还上电视说可防可控，第二天就确诊了。世卫组织担心，这么多高级政府官员感染，很可能普通民众已经感染很多了，大大超过伊朗报告的数字。除非这个病毒有幽默感。
总之关于“伊朗起源说”也实属无稽之谈。
有关病毒起源的第三个流派是，“这个病毒七年前就有了”。世卫组织对这种新冠状病毒早就很清楚，早就知道不是起源于中国，所以要求全球防疫。甚至有人拿出2013年2月21日的《济南时报》，称当时全球已经确诊12例，3例英国，5例沙特阿拉伯，2例卡塔尔，2例约旦，2012年9月首次出现，死了5例，3个在沙特，2个在约旦。而且报纸上讲得很清楚叫新冠状病毒。
这个流派的错误其实也是很明显的，相信大家看了前面介绍的有关冠状病毒的历史以及家族的成员介绍，就能不难猜出，2013年2月《济南时报》报道的实际上是MERS（中东呼吸综合征）。这个病毒导致的传染病于2012年9月从沙特开始，早期因与SARS临床症状相似得名“类SARS病毒”，也成为继非典之后的第6种已知的人类冠状病毒，也是过去10年内被分离出来的第3种冠状病毒。2013年5月世卫组织将其命名为MERS（中东呼吸综合征）。截止到2015年5月，世界卫生组织公布的数据显示，全球累计1139确诊病例，431例死亡。
至于2013年的报纸上讲当时这个病毒也叫“新冠状病毒”，只是当时还没有给它取名字，暂时叫新冠状病毒，就是新发现的冠状病毒的意思，和去年新发现的这个冠状病毒暂称为“新型冠状病毒”一样。其实不是同一株冠状病毒，只是同一个家族而已，都姓“冠状”，但一株是“六弟”一株是“七弟”。
2020年2月8日我们为这个七弟取了个名字叫“新型冠状病毒肺炎”，简称“新冠肺炎”，英文名称为Novel Coronavirus Pneumonia，简称NCP。老实说这个名字取得不太科学，一是这个“新”字太笼统，如果以后再出现一个更新的冠状病毒该怎么叫呢？新新冠吗？
二是称为肺炎不太科学，这个病毒攻击的不仅仅是肺。张文宏医生日前接受采访说：“它不仅仅是个肺炎，因为很多病人并没有肺炎的表现。没有肺炎的表现，你就不能叫它肺炎，实际上就是一个冠状病毒感染。有一些重症病人，它的损害也不单单是一个肺的损害，它还有心脏的损害，还有多脏体的损害，所以它是一个整体的病。”
国际病毒分类委员会将这种病毒命名为“SARS-CoV-2”（非典冠状病毒2），也不太科学，因为这个病毒尽管和SARS非典是同一个家族，好比SARS非典是“五弟”，它是“七弟”，但是习性还是很不一样的，前面已经提到，病死率、传染率、潜伏期、发病进程等等都很不一样，目前看来病死率比非典低很多，传染性比非典高不少。对肺的攻击也不一样，之前的解剖报告显示，死于这个病毒的患者气道有大量黏稠分泌物引起远端肺泡损伤，而不是像非典那样的纤维化。所以把它称为非典冠状病毒2误导性太强了。
世界卫生组织取的名字叫“COVID-19”，是“Corona Virus Disease 2019”的简称，即“2019冠状病毒”。
这个名字比较好，既没有“新”字的困扰，也没有“肺炎”和“非典”的误导。世卫组织取名字要很小心，之前2009年的新流感命名为“猪流感”，结果导致埃及等地30万头无辜的猪被宰杀。MERS（中东呼吸综合征）又被中东地区投诉。
总之有关新冠病毒起源的这第三个流派也是明显的无稽之谈。
第四个流派是军运会输入论，主要的证据是在2019年10月18日-27日于武汉召开的军运会期间，前后有五名外籍运动员因身患输入性传染病，在比赛期间被送往了武汉市金银潭医院。
但是这个证据很快被金银潭医院院长张定宇推倒了：“这都是不需要辟谣的内容。这五名外籍运动员所患的输入性传染病都是疟疾，与新冠肺炎病毒毫无关系。疟疾是一种蚊虫叮咬或患者输入带有疟原虫血液引起的传染性疾病，主要症状为发热畏寒，食欲不振。”
而且，如果是从军运会传进来的，那么军运会后各国应该差不多同时都出现感染者，而不只是中国一个。特别是如果是美国通过军运会传进来的，那么美国自己总该先有一定数量的感染者，至少到了社区感染的阶段吧。不排除美国有新冠患者没有被及时确诊识别的情况，但是如果都传到这里来了，这个病毒10月之前肯定在美国蔓延了。如果四个月前就开始蔓延了，那么给定美国淡定的佛系抗疫风格和这个病毒的超强传染力，四个月后的今天，美国肯定已经爆发得一塌糊涂了。然而直到现在美国也没有发生社区性传染和医务人员感染。
所以这第四个流派也是无稽之谈。
第五个流派，说今年美国所谓流感目前死了1.8万人，怎么会死这么多人？这中间有不少其实就是新冠患者，美国人没有发现而已。日本人都这么说。
这个流派也明显缺乏常识。美国流感季死1.8万人根本不算多的。据美国疾控中心（CDC）估计，自2010年以来，每年美国流感导致900万至4500万人感染，14万人至81万人住院，1.2万人至6.1万人死亡。
据世卫组织估算，全球每年流感感染率成人可达5%至10%，儿童更高达20%。每年全球流感可导致300万至500万重症病例，并导致25万至65万人死亡。
如果真有患者死于新冠，美国不可能不知道。2009年的H1N1（猪流感）就起源于美国，看看美国的反应过程。
2009年4月15日，第一例出现，完成基因组测序。
第三天出现第二例
第四天就向世卫组织报告了
第七天，就要求美国各州公共卫生实验室将所有不能分型的甲型流感样本全部送到CDC，并开始准备生产疫苗。
第八天，CDC启动了紧急行动中心（EOC）
第九天，举行了第一次正式的全面新闻发布会，向媒体通报情况，向全世界宣布疫情。
第十天，CDC将2009年H1N1病毒的完整基因序列上传到国际流感数据库，供全世界科学家研究。
第十一天，根据《国际卫生条例》的规定，世卫组织（WHO）总干事宣布2009年H1N1疫情为国际关注的突发公共卫生事件；美国政府确定全国范围内存在公共卫生紧急情况。CDC的国家战略储备开始释放25%的战略储备物资。
第十二天，世卫组织将流感大流行疫情警戒级别从3级提高到4级。
第十三天，世卫组织将流感大流行的警戒级别从4级提高到5级。
2009年6月11日，世卫组织将全球流感大流行警戒级别升至6级。这是世卫组织40年来第一次把传染病警戒级别升至最高级别。
2010年8月10日，世界卫生组织宣布甲型H1N1流感大流行结束，六级警报解除。甲型H1N1流感病毒在很大程度上已到了尽头，其危害性已不超过各种季节性流感。
2012年6月26日美国CDC的研究人员在《柳叶刀·传染病》杂志发表报告说，在2009年4月至2010年8月间，H1N1流感死亡人数为15.17万人至57.55万人，约为世界卫生组织所公布确诊死亡人数的8倍至31倍。
截至2009年12月22日，中国内地一共确诊12.3万例新型H1N1患者，死亡714例。
从美国应对2009年H1N1的情况来看，如果新冠首先发生在美国，它到现在自己还不知道的概率是零。伊朗、意大利等国家有可能，但是美国，不可能。
至于“日本人都这么说”的证据是这样的，日本朝日电视台2月21日报道，美国CDC发布消息称，之前美国发生的流感很可能是新冠。日本人翻译英文就走样了。实际上，美国CDC发布的消息是说，在新冠从中国输入之前，他们就一直在密切监控美国国内出现类似流感症状的患者中是否其实有新冠患者。而且他们明确说了：目前还没有发现。
当然现在美国的输入疫情已经到了无法溯源阶段，这种监控也就没有意义了。总之这第五个流派也是无稽之谈。
接下来讲最后一个流派，也是最厉害的一个流派。最近刷屏的主要有两个来源，一个是叫魔都囡的公众号发的一篇文章，另一个是后来台湾一个所谓讲科学的节目。
张文宏医生说：“科普有两种，一种是把真的事情告诉你，另外一种是故弄玄虚把你带到沟里去。”
魔都囡说的那篇学术论文是2月21日发表在中国科学院科技论文预发布平台上的一篇preprint预印版论文，全英文的，题目是Decoding the evolution and transmissions of the novel pneumonia coronavirus (SARS-CoV-2) using whole genomic data，翻成中文就是《运用完整基因组数据解码新冠病毒的演变和传播》，是三位中国研究员和一位美国研究员共同撰写的。
其实2月24日就有“科学大院”发表文章介绍这篇论文的研究和结论，但是因为“科学大院”是一个正经的科普自媒体，实事求是，没有断章取义，而且取的标题也很合乎情理《华南海鲜市场不是病毒来源地？新型冠状病毒到底源自何处? 》，没有弹眼落睛，所以没有怎么引起大家的关注。一直到魔都囡和台湾的那个节目，才引起大家的热烈讨论。
这个流派可以称之为“病毒基因单倍体辈份流派”，用直白的话来讲，这个流派的推理根据是有篇论文说这个病毒的爷爷在美国，儿子、孙子在中国，所以这个病毒是从美国输入的。
接下来我们一起来看一下这篇论文到底讲了什么。
论文讲的这个研究从一个名为GISAD EpiFlu的病毒数据库中用了93个完整的基因组数据（complete genomes），其中中国54个，包括武汉的22个以及广东、台湾、重庆、浙江等地的32个，中国以外有39个，包括美国的13个。这些基因组来自的病毒样本涵盖了4大洲12个国家。从这些基因组中他们发现了58个haplotypes（单倍型）。
什么是单倍型? 单倍型是单倍体基因型（genotype）的简称，是指若干个决定同一性状的紧密连锁的基因构成的基因型。简单说就是决定同一性状的基因的组合。病毒的特性由很多基因决定。
不同的基因单倍型之间有的是平行关系，有的是上下游的关系，形成一个演变进化的网络（evolutionary network of haplotypes）。居于中间的是超级传播者单倍型（super-spreader haplotype），居于边缘的是最近的晚辈（recent descendant haplotype）。为了便于理解，我们可以用家庭关系比拟基因单倍型之间的演变、衍生关系，爷爷辈、儿子辈、孙子辈这样。
这58个单倍型的关系是这样的，最开始的单倍型是mv1，它可能来自中间宿主或者第一个被感染的人。mv1衍生了H38，和它同一辈分的还有H13。H38和H13是病毒的第一代创始人，我们可称之为爷爷辈单倍型。之后的H3称为病毒的第二代掌门人，我们称其为父辈。H3衍生出孙子辈H1，是病毒的第三代掌门人。
如下图：
接下来是这个研究发现的一些情况：
1、在武汉病毒样本中发现一个父辈单倍型H3和12个孙子辈H1，并没有发现爷爷辈单倍型（H13，H38）；
2、中国的爷爷辈单倍型H13仅在深圳病毒样本中发现；
3、另一个爷爷辈单倍型H38在一名美国患者携带的病毒中发现；
4、武汉的那例父辈单倍型H3并不是来自华南海鲜市场；
5、来自华南海鲜市场的病毒中的单倍型都是孙子辈的单倍型H1以及它的衍生型(H2， H8-H12)。
6、美国的单倍型最多，有爷爷辈的H13和H38，也有父辈单倍型H3，还有孙子辈单倍型H1，还有H19、H35、H41、H42、H58等等衍生型单倍型。
看到这里，是不是可以得出以下两个结论：病毒不是起源于中国，而是起源于美国；中国的病毒不是起源于武汉而是起源于深圳呢？
不可以！因为还要追踪患者的感染时间和活动轨迹。中国的这个爷爷辈单倍型H13的深圳患者，和美国这位爷爷辈的单倍型H38的患者（美国的第一例），都是于2019年12月底到1月初在武汉活动期间被感染的。那么为什么在武汉的样本中却没有找到这两种单倍型呢？
原因和采集病毒样本的时间有关。武汉的样本采集时间是2019年12月24日和2020年1月5日，采集时间较晚，此时爷爷辈的单倍型很有可能已经被父辈、孙子辈的单倍型替换。当前，如果能在武汉找到更早期的病毒，对于寻找病毒来源有很多帮助。
这个研究所用的基因组来自的样本的采集时间并不是同时的，所以很显然，如果只看单倍型是无法得出这个病毒起源于美国的结论。然而这就是魔都囡和台湾的节目误导大家得出的结论。
实际上，论文接下来又专门分析了传播路径 ，如上图。早期有两条路径，武汉至深圳，武汉至美国。亚洲五个国家分别从武汉和深圳传入。大洋洲的都从武汉传入。比利时和德国的从武汉传入。英国和武汉间接相关。法国的单倍型来自重庆、武汉和一个中间传播者。
美国的传播途径比较复杂，存在多条路线，包括武汉-美国（H1，H19，H38），广东-美国（H19，H35，H42，H41，H58），越南-美国（H54），澳大利亚-美国（H56）。美国最早的这13例，基本上都是从中国过去的学生和刚刚从中国探亲回去的华人。
可见，武汉以外地方的感染，包括美国，全部是输入型感染，直接或间接从武汉输入。
当然这只能反映截止到这篇论文研究日期之前的情况。现在世界各地的情况已经和前一阶段大不相同了，国外本地人传人已经出现，甚至已经出现无法溯源的病例。之前美国报道了第一例。伊朗、意大利等国从一开始就不知道源头，之前已经分析过了，给定这个病毒的特性以及这些国家的特性，这也并不奇怪。
这个研究还推论得出，新冠病毒曾出现过两次明显种群扩张。根据研究样本中的基因组数据推算，12月8日和1月6日，新冠病毒基因曾有过两次明显的种群扩张。论文认为，如12月8日的这次扩张确实存在，则可在一定程度上能够证实该病毒在12月初，甚至11月下旬就已经开始人际传播。另外，这个病毒目前没有出现基因重组。
在病毒源头方面，这个研究得出的结论是，根据病毒样本基因组分析，新冠病毒起源于武汉，但并不在华南海鲜市场。由于华南海鲜市场人流量大，拥挤的市场促进了病毒传播，但不是病毒的源头。那么源头究竟在哪里，还有待进一步研究。
日前，张文宏医生接受China Daily专访时被问及新冠病毒是否最早从外国传入，他的判断是：“No。中国只有武汉最先出现了这个新冠传染，如果是外面传到中国来，应该是几个中国城市同时发病，而不是有时间先后。”
对于病毒起源的寻找，对于“零号病人”的寻找，一方面很重要，因为对于新发传染病来说，这能够为病因分析、传染链分析、控制措施、预测预警机制的建立提供关键的信息。
但是另一方面，香港大学李嘉诚医学院教授金冬雁认为：“SARS、Zika病毒也没有查出什么零号病人。如果零号病人死亡，以我国的情况很少可能留下可供检测的样本，如健在，病毒也已清除，基本上是无法查明。”
有关新冠病毒起源的这六种错误假说就分析到这里，希望能够帮助大家在纷扰中看清真相，避免被带到沟里去。
作者毕业于复旦大学，曾留校任教，后在中欧国际工商学院供职近20年。个人号：悟00000空。
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