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第一届灵长类动物脑影像数据处理班

杨晓飞 思影科技 2022-04-16

请点击上面“思影科技”四个字,选择关注我们,思影科技专注于脑影像数据处理,涵盖(fMRI,结构像,DTI,ASL,EEG/ERP,FNIRS,眼动)等,希望专业的内容可以给关注者带来帮助,欢迎留言讨论,也欢迎参加思影科技的其他课程。(文末点击浏览)

    思影科技将于2019年9月17日-- 2019年9月22日(周二--周日)在南京举办第一届灵长类动物脑影像数据处理班(详见课表安排)。

1、培训简介

    中国脑计划已具备雏形,认识脑、研究脑对于脑疾病研究具有重大意义,非人灵长类动物与人类基因组同源性非常高,是神经系统疾病研究中重要的实验模型,且我国在非人灵长类动物资源有着得天独厚的优势,利用高场磁共振,科研人员可以无创地对非人灵长类动物脑功能(BOLD)及脑结构进行研究,但很多想开展这方面研究的医生及神经科学研究者却受制于数据处理技术不足。扎实掌握相关非人灵长类磁共振脑影像数据处理技术是开展研究的关键,为此,思影科技拟举办灵长类动物脑影像数据处理班(基于猕猴脑影像数据),通过手把手教学,帮助临床医生与初入门的科研人员快速掌握脑影像数据处理分析操作技能,从而提高专业人员开展非人灵长类动物神经影像研究工作的水平。

2、培训对象与内容

    此次培训的对象是希望利用磁共振脑影像技术进行非人灵长类动物脑科学研究的医生、高校教师与在校学生等,思影科技一直坚持小班教学的方式,并配备教辅人员,后续提供在线支持,及时解决学员数据处理中存在的问题。

    内容主要包括:猴脑静息态数据预处理与统计检验(初步、高级统计及多重比较校正),软件作图,脑结构数据处理,SPM-VBM操作,DTI数据预处理和基于ROI的猴脑影像分析,猴脑概率性纤维束跟踪分析等。

    注:如方便,请于会议开始前一天到达会场(10:00 - 20:00)熟悉场地及安装软件、拷贝资料等事宜。

3、培训课程安排

时间

课程名

主要内容

第一天

9.17

杨田雨

上午

软件、数据准备

  • 静息态磁共振功能图像基础

  • 功能磁共振数据处理软件包的介绍与安装:格式转换、图像查看等

下午

数据预处理

  • MATLAB软件与内部指令集一览

  • 猴脑fMRI数据预处理方法与常用预处理流程

  • 猴脑静息态数据的预处理实操(SPM

晚上

数据批处理与图像小工具

  • 数据批处理软件介绍

  • 图像小工具的使用

第二天

9.18

杨田雨

上午

静息态功能指标

计算

  • 功能指标的计算:ALFF(低频振幅)、FC(功能连接)、ReHo

下午

统计初步

  • SPM统计:单样本T检验、双样本T检验、配对T检验

晚上

统计初步

  • SPM统计实操



第三天

9.19

龙治良

上午

Advanced统计&多重比较

  • 单因素方差分析

  • 双因素方差分析

  • 多重比较矫正

下午

软件画图

  • 猴子数据统计结果汇总,做表

  • 统计结果画图(mricroncaret

第四天

9.20

龙治良

上午

VBM讲解

  • dartel-VBM原理介绍

  • 猴脑Dartel-VBM分析流程

下午

VBM演示

  • 猴脑Dartel-VBM操作演示:包括数据转换、图像检查、预处理、指标提取、统计分析

第五天

9.21

谢桑马

上午

DTI数据预处理

和基于ROI的猴脑影像分析

  • 扩散磁共振成像基本原理介绍

  • DTI数据基本分析方法概述

  • 基于DTI的猴脑应用研究简介

  • 猴脑DTI数据的预处理

下午

  • 扩散张量及相关指标计算

  • 猴脑ROI的勾画和提取

  • 猴脑ROI的配准和空间转换

  • 基于ROIDTI相关指标统计分析

第六天

9.22

谢桑马

上午

猴脑概率性纤维束跟踪分析

  • 概率性纤维束跟踪的基本原理

  • 概率性纤维束跟踪的模型构建

  • 猴脑概率性纤维跟踪的实现

下午

  • 猴脑脑区间概率性纤维连接的计算

  • 猴脑概率性纤维束跟踪结果查看

  • 猴脑概率性纤维束跟踪结果统计分析

4、培训人数

此次培训限定人数28人左右,报名敬请从速。

5、培训地点

南京市秦淮区中山南路315号瑞华大厦2404,具体见会议指南。

6、培训费用

所有参会人员3500/人(含资料费、培训费,交通及食宿费自理)。

7、报名方式

       请将报名回执发送至:syfmri@163.com,我们会第一时间联系您。

8、缴费方式

银行转账(转账信息见回执表)或者支付宝(18580429226,户名:杨晓飞),如需其他缴费方式,请与我们联系,联系方式见下文,谢绝录像,主办方提供发票。

9、联系方式

联系人:杨晓飞。

电话:18580429226/025-86703770。

10、备注

请各位培训学员自带笔记本电脑((推荐win10)、i5及以上、8G内存、50G剩余存储空间等基本配置;如无特殊情况请不要带苹果电脑,如确实只能用苹果电脑,苹果Mac电脑请提前使用Bootcamp加装Windows64位系统);学员自己有数据的可以带3-5例进行现场处理;并在9月2日前进行缴费及将回执表发送至syfmri@163.com,便于培训安排。

报名回执表

单位名称、税号

(发票抬头)


姓名


性别


邮箱


电话号码


科室/专业


缴费方式

转帐  支付宝 (请选择在□打

银行信息

名:南京思影科技有限公司

账号:125909558210401

开户银行:招商银行股份有限公司南京中山南路支行

汇款备注

第一届灵长类动物脑影像数据处理班

注:请完整填写回执表后回传给我们,以便给你发送确认函,谢谢支持!

11、在线支持服务

思影科技将为参加培训的学员提供免费的在线支持与合作,确保学员能够熟练掌握脑影像数据处理方法。

12、培训人员简介:

龙治良,博士,西南大学,讲师。具有应用数学(本科,硕士)和生物医学工程(博士)交叉学科背景。研究方向为基于多模态脑网络水平的脑疾病病理机制研究。在英国牛津大学做访问学者一年。目前参与多项国家自然科学基金项目,发表学术论文10余篇,第一作者论文5篇,包括MovementDisorders等。论文被引537次(googlescholar)。擅长脑形态学分析、功能连接分析和脑网络分析。

谢桑马,博士,2017年1月毕业于中国科学院自动化研究所。主要研究方向为扩散磁共振成像的计算理论和方法、脑影像数据分析软件开发以及扩散磁共振成像在精神疾病中的应用。扩散磁共振成像分析软件DiffusionKit的主要开发者,获得软件著作权一项。熟练掌握扩散磁共振成像领域的主流方法,精通相关软件的操作使用。目前,已在PLOS ONE、Journal of Neuroscience Methods、Translational Psychiatry等国际杂志以第一作者发表SCI论文3篇,参与多项国家自然基金项目,同时担任国际期刊IEEE Transactions onMedical Imaging等杂志审稿人。

杨田雨,硕士,拥有数学与计算机学科背景,擅长脑成像领域方法学,思影科技技术总监。


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思影数据处理业务一:功能磁共振(fMRI)


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