和你“同居”多载、最熟悉的陌生菌有啥小心思？
有这么一群有趣的小生物
——微生物
它们和你“同居”多年，却素未谋面。
它们可能是小天使，
也可能是小恶魔，
它们的存在为我们的身体或外界环境
提供了至关重要的生态系统。
作为身体主人的你是否了解
微生物是如何维持体内平衡的？
它们与疾病有什么千丝万缕的联系？
如何通过调节微生物群进行
疾病预防与维持健康状态？
目前微生物组的研究
有哪些实用方法和应用前景？
来看看本期小G为大家准备的“新料”吧！
本期主题为:
微生物组与健康
（Microbiome and Health）
2篇综述、7篇原创性研究
让你一次看个够~
北京化工大学童贻刚博士和
华中科技大学宁康博士特别作序
为大家简单介绍微生物组研究现状及
本期内容要点，
方便大家快速找到感兴趣的小生物哦~
体内肠道微生物的豪宅构造（肠型）
有啥讲究？
华中科技大学宁康博士等的综述总结了
目前关于肠型的观点及其多种影响因素，
描述了目前进行肠型分析的计算方法等
小宝贝体内的肠道菌群对其健康有啥影响？
八一附属儿童医院李秋平、封志纯博士等
为大家介绍了
在人发育早期肠道菌群与儿童疾病的关联，
探讨了操纵肠道菌群“对症下药”的方法和
进展
母后大人的肠道菌群紊乱可能会引发
后代的孤独症？
山东大学齐鲁儿童医院的
张磊、盖中涛、李桂梅博士等
发现自闭症儿童肠道内独特的细菌标志物，
具有潜在的自闭症风险评估的价值
抗生素对肠道菌群也有影响？
香港城市大学Gianni Panagiotou博士和
丹麦Novo Nordisk的
Morten O.A. Sommer博士等基于
宏基因组公共数据分析和多组学深度研究，
全面解析了抗生素对肠道菌群失衡和
抗药性的影响
关掉 “闸门”质子泵的这种治疗方法
会影响胃食管反流病（GERD）
胃肠道微生物？
解放军总医院杨云生博士等研究发现
GERD患者使用质子泵抑制剂
会显著影响胃粘膜及粪便微生物群
菊粉益生元如何通过肠道菌群
改善代谢紊乱？
中科院微生物所朱宝利、
中国农业大学胡永飞博士等
为我们讲述了
菊粉如何通过肠道菌群介导
恢复部分leptin基因相关信号通路，
改善糖脂代谢紊乱
湖里的“小水怪”
可以作为田园生活的响应器？
美国芝加哥大学Jack A. Gilbert博士
（现单位为加州大学圣地亚哥分校）和
华中科技大学宁康、王智博士等
解析了中国第七大淡水湖洪湖区域
农业生产中水样和泥样的
微生物群落组成和功能组成
构建了微生物共出现网络等
这项研究对环境监测、维持湖泊环境
起到了重要作用~
想不想看看微生物“朋友圈”咋运作的？
北京大学朱怀球博士等
建立了一种研究微生物群落的新方法
FCP模型
它能够预测微生物群落结构
并鉴定到了对其相当重要的功能性基因
脸盲吗？
有种方法能够帮你分辨临床复杂菌群
首都医科大学北京地坛医院
陈晨、曾辉博士等
建立了一套基于贝叶斯模型的
复杂细菌菌群特定基因型检测工具GPA
这种方法可用于
临床样本中非培养的细菌的鉴定
及其耐药基因的定量分析
再附上本期的可爱小生物们的“正经”清单：
Preface |
The Fast Track for Microbiome Research |
Kang Ning, Yigang Tong （童贻刚、宁康） |
Review |
Stereotypes About Enterotype: the Old and New Ideas |
Mingyue Cheng, Kang Ning（宁康） |
Intestinal Microbiota in Early Life and Its Implications on Childhood Health |
Lu Zhuang, Haihua Chen, Sheng Zhang, Jiahui Zhuang, Qiuping Li, Zhichun Feng（李秋平、封志纯） |
Original Research |
Correlation of Gut Microbiome Between ASD Children and Mothers and Potential Biomarkers for Risk Assessment |
Ning Li, Junjie Yang, Jiaming Zhang, Cheng Liang, Ying Wang, Bin Chen, Changying Zhao, Jingwen Wang, Guangye Zhang, Dongmei Zhao, Yi Liu, Lehai Zhang, Jun Yang, Guimei Li, Zhongtao Gai, Lei Zhang, Guoping Zhao （李桂梅、盖中涛、张磊） |
Antibiotic Treatment Drives the Diversification of the Human Gut Resistome |
Jun Li, Elizabeth A. Rettedal, Eric van der Helm, Mostafa Ellabaan, Gianni Panagiotou, Morten O.A. Sommer |
Effects of Proton Pump Inhibitors on the Gastrointestinal Microbiota in Gastroesophageal Reflux Disease |
Yi-Chao Shi, Shun-Tian Cai, Ya-Ping Tian, Hui-Jun Zhao, Yan-Bing Zhang, Jing Chen, Rong-Rong Ren, Xi Luo, Li-Hua Peng, Gang Sun, Yun-Sheng Yang （杨云生） |
Inulin Can Alleviate Metabolism Disorders in ob/ob Mice by Partially Restoring Leptin-related Pathways Mediated by Gut Microbiota |
Xiaofeng Song, Liang Zhong, Na Lyu, Fei Liu, Boxing Li, Yanan Hao, Yong Xue, Jing Li, Yuqing Feng, Yue Ma, Yongfei Hu, Baoli Zhu （胡永飞、朱宝利） |
Agricultural Risk Factors Influence Microbial Ecology in Honghu Lake |
Maozhen Han, Melissa Dsouza, Chunyu Zhou, Hongjun Li, Junqian Zhang, Chaoyun Chen, Qi Yao, Chaofang Zhong, Hao Zhou, Jack A Gilbert, Zhi Wang, Kang Ning （王智、宁康） |
How Microbes Shape Their Communities? A Microbial Community Model Based on Functional Genes |
Xiaoqing Jiang, Xin Li, Longshu Yang, Chunhong Liu, Qi Wang, Weilai Chi, Huaiqiu Zhu （朱怀球） |
GPA: A Microbial Genetic Polymorphisms Assignments Tool in Metagenomic Analysis by Bayesian Estimation |
Jiarui Li, Pengcheng Du, Adam Yongxin Ye, Yuanyuan Zhang, Chuan Song, Hui Zeng, Chen Chen （曾辉、陈晨） |
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Genomics， Proteomics & Bioinformatics（基因组蛋白质组与生物信息学报， 简称GPB）：创刊于2003年，是由中国科学院主管，中科院北京基因组所与中国遗传学会共同主办的英文版核心期刊。目前GPB为双月刊，由Elsevier以开放获取（Open Access）的模式出版，刊载来自世界范围内组学、生物信息学及相关领域的优质稿件。2017年被SCIE、JCR和CSTPCD数据库收录，连续六年获得“中国最具国际影响力学术期刊”称号（2013–2018），连续两期获得“中国科技期刊国际影响力提升计划”项目资助（2013–2018）。2018年，在基于Scopus数据库的CiteScore期刊影响力榜单中，位于“计算数学”、“遗传学”、“生物化学”、“分子生物学”四个学科领域Q1区；JCR报告公布的官方影响因子为6.615，位于“基因遗传学”学科领域Q1区；中科院期刊分区，位于“生物大类”学科领域Q1区。入选2018年“中国最美期刊”；获中科院出版基金科技期刊择优支持（2019）。