科研 | Front. Pharmacol.:寻常型银屑病血瘀证患者血清特征代谢产物的代谢组学研究(国人佳作)
编译:微科盟张娜,编辑:微科盟Tracy、江舜尧。
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牛皮癣是一种难治的慢性、全身性炎症性皮肤病,而中医(TCM)在银屑病的辨证论治中显示出独特的优势。我们应用液相色谱-质谱联用的非靶向高通量代谢组学方法,研究不同中医证型的寻常型银屑病(PV)患者血清代谢特征,从内源性代谢产物的角度寻找其发病机制的潜在血清生物标志物。本研究共测定了45例健康对照者和124例PV患者(血瘀组50例,血热组30例,血燥组44例)的血清代谢谱;使用多元统计分析处理原始数据,筛选和鉴定了14种与银屑病中医证候分型相关的生物标志物,其中,血瘀组表现出脂质代谢异常,其特征为低磷脂酰胆碱(PC)、高溶血磷脂酰胆碱(LPC)。我们认为血小板活化因子可作为潜在的生物标志物用于PV血瘀证的临床诊断和鉴别诊断。不同证型寻常型银屑病患者与健康对照组血清代谢产物的差异,为银屑病中医证型提供了客观的物质基础。
论文ID
原名:Metabonomics Study on Serum Characteristic Metabolites of Psoriasis Vulgaris Patients With Blood-Stasis Syndrome译名:寻常型银屑病血瘀证患者血清特征代谢产物的代谢组学研究
期刊:Frontier in Pharmacology
IF:4.225发表时间:2020.11通讯作者:黎莉,韩凌,卢传坚
通讯作者单位:广州中医药大学第二临床医学院
实验设计
实验结果
1.使用UPLC/Q-TOF-MS研究不同中医证型的PV患者和健康对照者的代谢谱
不同中医证型PV患者和健康对照者的信息如表1所示,我们应用UPLC/TOF-MS研究不同中医证型PV患者和健康对照者的血清代谢谱。正离子模式下的总离子色谱图(TIC)如图1所示,其中,血瘀、血热、血燥的PV患者的代谢谱与健康对照组之间存在差异,这表明血清中存在多种与PV中医证型有关的代谢产物。
表1 具有不同中医证候的寻常型PV患者的临床特征和健康对照
图1 正离子模式下的总离子色谱图(TIC)
血瘀、血热、血燥的寻常型PV患者组与健康对照组的代谢谱差异。
2.方法学调查
样本池由各组各10μL血清混合而成。根据样品制备方法,我们制备了质量控制(QC)样品以进行精密度和稳定性研究,其中,每个样品进样6次,我们从TIC中选择10个峰,以评估保留时间和离子响应稳定。六次进样的峰强度和峰个数的相对标准偏差(RSD)均小于10%,表明该仪器的精密度良好,符合分析要求。
我们又制备了质控样品进行稳定性试验。每10-15个样品设置1个质控样品进样,所有代谢组学样品均连续注射,6次注射的峰强度和峰个数的RSD均小于15%,表明该仪器和方法稳定可靠。
3.不同中医证型PV患者的多元统计分析结果
我们使用MarkerView软件对各组的原始数据进行峰识别和匹配,对噪声过滤、数据归一化和3982个保留时间的质荷比(RT m/z)变量进行筛选,我们去除了同位素峰以避免重复计算,并将2454个变量加载到Simca-P软件中进行多元统计分析。我们采用PCA、PLS-DA和OPLS-DA对不同证候类型的样本进行了聚类分析,发现计量图中的代谢状态相似的样品聚集在一起,而不同的样本分布在不同的区域。因此,得分图可以根据代谢差异对实验组样品进行分类。如图2A所示,血瘀组、血热组、血燥组和健康对照组分别聚类,表明这些组之间代谢存在显着差异,而Loading图可以显示有助于分类的成分,离原点越远,有助于分类的成分数量越多,这些成分可以被认为是干扰正常生理代谢的潜在生物标志物。在图2C中,我们将远离Loading图中原点的点筛选为潜在的生物标记,而100次迭代的置换检验结果表明,该模型具有较好的预测能力(图2B)。
图2 多元数据分析和置换检验
(A) OPLS-DA得分图,(B) OPLS-DA的置换检验,(C)PLS-DA的Loading图。
4.潜在的生物标志物筛选和鉴定
根据PLS-DA模式识别结果,我们对VIP值进行排序,结合t检验,筛选了四组之间有显着性差异的代谢物(P <0.05),并从负荷图(图2C)中鉴定了候选化合物,而TOF-MS提供了所筛选代谢物的精确分子量。我们在人类代谢组学数据库(HMDB)中搜索这些化合物,结合同位素分子量、质谱电离片段化模式和生物学意义,确定了潜在的生物标记物。
如表2所示,具有不同中医证候的PV患者和健康对照组中的14种重要代谢物被认为是潜在的生物标志物,这些化合物主要与凝血、精神功能、炎症、抗菌作用和排毒有关,其中,脂质化合物在PV的发展中起重要作用。在本研究中,所有PV组均表现出脂质代谢异常,与健康对照组相比,其特征在于溶血磷脂酰胆碱(LPC)含量高、磷脂酰胆碱(PC)含量低(图3)。
表2 鉴定潜在的生物标志物
*与健康对照组相比,PV组有显著差异。
根据PLS-DA模型中预测的可变重要性(VIP)值,筛选出14种显著差异的代谢物作为潜在的生物标志物。
图3 有明显变化的典型代谢产物
四组血清中潜在生物标志物的峰面积。
5.ROC曲线
代谢组学研究的目标之一是发现生物标记物,鉴别出一种或一组能够对疾病进行分类的代谢物,并且有高灵敏度(真阳性率)和高特异性(真阴性率)。研究者们通常认为,ROC曲线分析是评估生物标志物性能的金标准。我们从Loading图(图2C)中筛选了一种化合物,经鉴定为血小板活化因子(PAF),然后用经典的ROC曲线分析评价PAF。图4显示了血瘀组PAF的ROC曲线结果,与健康对照组比较,曲线下面积为0.995(图4A-1),两组的箱线图如图4A-2所示;与血燥组相比,AUC为0.962(图4B-1),两组的箱线图如图4B-2所示;与血热组相比,AUC为0.9(图4C-1),两组的箱线图如图4C-2所示,AUC值均大于0.9,表明PAF对血瘀组和其他组有良好的预测能力,其中,PAF可能是PV血瘀证重要的生物标志物。
图4 ROC曲线图和PAF的箱线图
(A)血瘀组VS健康对照; (B)血瘀组VS血燥组;(C)血瘀VS血热组。
讨论
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