点击蓝字“代谢组metabolome”轻松关注不迷路生科云网址：https://www.bioincloud.tech/蛋白质组公众号公开招聘微文编译兼职，薪资超高！更有无限学习资源！万般皆备，只等你来！带着批判、思考的态度、独创精神及新颖的观点，加入我们吧！岗位：蛋白质组学微文创作人员（兼职）工作内容（可选1或多个）：1

点击蓝字“代谢组metabolome”,轻松关注不迷路生科云网址：https://www.bioincloud.tech/蛋白质组学主要以全蛋白组（组织、细胞和器官）、线粒体蛋白组、叶绿体蛋白组和外泌体蛋白组为研究对象，通过对蛋白组进行定性、定量、分子功能分析、通路互作分析和蛋白互作分析，揭示生物学功能、作用机制、疾病诊断的标志物以及预测蛋白的上、下游变化关系。微科盟六周年大促销，蛋白质组检测分析，从样品前处理到无限次数生信分析全包，而且无限次数售后服务，最低只需2200元/样品。打开网址（https://bioincloud.tech/cloudir/reports/TMT_report/TMT_Report.html）或者点击文末“阅读原文”处即可查看结题报告模板，详情请咨询微科盟组学老师。另外，生科云所有云工具无限次数免费使用。打开网址（https://www.bioincloud.tech）或者扫描本文开篇处生科云二维码即可体验生科云。生科云（https://www.bioincloud.tech），是微科盟旗下生物信息云服务平台，易学易用，客户可以0代码参与个性化生信分析，微科盟保证客户能轻松快速学会。生科云不但有用于完成流程化生信分析的云流程，还有用于个性化生信绘图的云工具，以及用于修图的SVG编辑器。客户不但可以参与个性化生信分析，还可以根据学术期刊的要求个性化绘图和修图，次数无限。价格如下TMT蛋白质组（促销）【包含样本制备、样本检测（仪器使用QExactive

点击蓝字“代谢组metabolome”,轻松关注不迷路生科云网址：https://www.bioincloud.tech/16S等扩增子只能大致回答“样品中有什么菌”的问题，而宏基因组不但能回答“样品中有什么微生物”，更重要的是能回答“样品中的微生物有什么功能”。宏基因组学(Metagenomics)，是⼀种直接对微⽣物群体中包含的全部基因组信息进⾏研究的⼿段。它规避了对样品中的微⽣物进⾏分离培养，提供了⼀种对不可分离培养的微⽣物进⾏研究的途径，更真实的反应样本中微⽣物组成、互作情况，同时在分⼦⽔平对其代谢通路、基因功能进⾏研究。现开展宏基因组测序分析六周年优惠促销活动！DNA质检+建库+测序6G+生科云云流程无限次数交互式分析+无限次数售后服务，最低只需520元！而且，所有云工具无限次数免费使用。打开网址（https://www.bioincloud.tech/cloudir/reports/metagenome/Category2/index.html）或点击文末阅读原文即可查看结题报告模板。另外，生科云所有云工具无限次数免费使用。打开网址（https://www.bioincloud.tech）或者扫描本文开篇处生科云二维码即可体验生科云。生科云（https://www.bioincloud.tech），是微科盟旗下生物信息云服务平台，易学易用，客户可以0代码参与个性化生信分析，微科盟保证客户能轻松快速学会。生科云不但有用于完成流程化生信分析的云流程，还有用于个性化生信绘图的云工具，以及用于修图的SVG编辑器。客户不但可以参与个性化生信分析，还可以根据学术期刊的要求个性化绘图和修图，次数无限。活动价格如下宏基因组测序分析（促销）（DNA提取+建库+测序6G

点击蓝字“代谢组metabolome”，轻松关注不迷路会议背景及简介人体是一个复杂是生物网络系统，包括信号网络、代谢网络、蛋白质互作网络和基因调控网络等。由于生物网络的复杂性和稳定性，在药物研究过程中通常针对网络系统中的多个节点（靶点）同时进行调节，以期达到理想的治疗效果。实际上已有研究表明，药物与作用靶点之间倾向于组成富集的网络，而不是孤立的一一对应的关系。大多数药物通过多靶点发挥作用，且约半数药物的作用靶点与多种疾病相关，这样药物与疾病之间就形成了复杂的交叉网络。基因组学、蛋白组学、代谢组学，以及近年来发展起来的互作组学、疾病组学和中医症候组学等一系列组学技术的发展，为现代医学和药物研发带来了非常大的契机。为让各位研究人员更好地了解生物网络研究前沿知识、掌握新技术，北京市计算中心生物计算事业部特举办“生物网络构建及分析技术研讨班”。培训班由北京市计算中心的一线分析工程师授课，通过技术讲座结合实验操作，展示应用实例，现场解答技术疑问，帮助学员拓展研究思路，提升科研水平和竞争力。会务信息授课对象：生物信息学学员，高校生物、药学相关专业教师、学生，医学科研人员，医院从业人员，生物专业相关从业人员电脑要求：64位windows10操作系统，运行日常程序流畅。举办地：北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼课程安排：2021年8月28-29日

点击蓝字“代谢组metabolome”，轻松关注不迷路编译：微科盟胜寒，编辑：微科盟Tracy、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读饮食中过量的饱和脂肪酸和单糖是已知的阿尔茨海默氏病(AD)的环境风险因素，但这种饮食对于AD发病机制的作用过程尚不清楚。本文中，作者广泛分析了西方饮食(WD)对人类和实验动物中AD发生发展的影响。同时也回顾了WD诱导的系统改变，包括代谢变化、肥胖和脂肪组织炎症的诱导、肠道微生物菌群失调等。另外一个证据概述，表明WD相关的系统性改变导致血脑屏障(BBB)损伤和神经炎症的发展，同时伴有毒性淀粉样蛋白的积累。随后突触传递功能障碍、神经退行性变，最后是记忆和认知障碍。最后得出结论，WD可以通过炎症加速触发AD，而代谢性和全局性炎症诱导的血脑屏障损伤在这一过程中起着核心作用。此外，神经炎症和Aβ稳态失调通过相互作用驱动神经退行性变的恶性循环，与Aβ作为AD的主要触发因素相矛盾。鉴于2019年世界卫生组织建议关注AD预防中可改变的风险因素，本综述概述了WD引发的复杂病理机制，可为未来的预防策略提供支持。论文ID原名：Western

EVs中采取HSPME/GC-MS策略进行分析。因此，所选择的样品制备方法应该是非破坏性和非选择性的，以涵盖分析基质中存在的各种代谢物。此外，所得提取物应与用于后续分析的分析技术兼容。表2概述了用于

点击蓝字“代谢组metabolome”，轻松关注不迷路编译：微科盟草重木雪，编辑：微科盟Tracy、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读中草药具有多种靶点和特性，在多学科癌症治疗中的应用受到越来越多的关注。本文研究了参芪扶正注射液(SFI)中可能调节癌症相关疲劳(CRF)的活性成分。首先我们采用体外细胞模型检测SFI对CRF的调节作用，后通过代谢组学分析确定SFI处理C2C12小鼠成肌细胞中潜在的基因和通路，并通过网络药理学和分子对接分析预测化合物与CRF靶点的相互作用。免疫印迹法进一步验证了推测的途径。结果表明，SFI能显著抑制肌细胞凋亡，提高肌细胞线粒体膜电位。网络药理学分析结果鉴定出36个候选化合物，其中SFI获得244个潜在靶点，其中10个关键靶点与癌症相关疲劳有关。富集分析和实验验证表明，SFI可能通过激活AMPK和抑制PI3K/Akt信号通路来改善肌细胞线粒体功能，并触发线粒体代谢酶MnSOD和凋亡相关蛋白Bax、Bcl-2的表达变化。我们发现SFI在抗肿瘤相关疲劳中的作用和机制至少部分是由于其靶向AMPK和PI3K/Akt信号通路，该研究展现了网络药理学在中药研究中新的应用前景。论文ID原名：Network

点击蓝字“代谢组metabolome”，轻松关注不迷路编译：微科盟橙子，编辑：微科盟Tracy、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读牛肉的嫩度和口感可以通过干陈或湿陈或两者结合来改善。本研究的目的是建立一种有效的方法来检测干陈和湿陈牛肉在陈化过程中代谢组分极性部分的差异，并利用牛肉的1H-NMR谱对相关代谢产物进行定量。我们采用不同老化方式（湿老化、干老化）和不同老化时间（0、7、14、21、28

点击蓝字“代谢组metabolome”，轻松关注不迷路编译：微科盟路芳芳，编辑：微科盟Tracy、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读本研究评估了不同光源(白光：WL；蓝光：BL；红灯：RL)对草珊瑚根系形态特征及代谢产物积累和生物合成的影响。研究分别通过RNA-Seq和超高效液相色谱-电喷雾电离-串联质谱(UPLCESI-MS/MS)对草珊瑚幼苗的根部进行了转录组和代谢组分析。与WL相比，BL显著增加了地下鲜重、根长、根表面积和根体积，而RL抑制了这些指标。草珊瑚幼苗的根部共鉴定出433种代谢物，其中分别有40种、18种和68种化合物在WL根(WG)和BL根(BG)中、WG和RL根(RG)中以及RG和BG中差异积累。BG和RG中芥子醇、芥子酸、秦皮素和6-甲基香豆素的含量显著降低，而绿原酸、迷迭香酰葡萄糖苷、槲皮苷和槲皮素在BG和RG中显著升高，此外，BG中有8种萜类化合物的含量显著降低。转录组分析结果表明，幼苗根部中与苯丙素衍生物和萜类代谢物的生物合成相关的几个关键基因在不同光源下差异表达，比如咖啡酸3-O-甲基转移酶(COMT)、羟基肉桂酰辅酶a、莽草酸羟基肉桂酰转移酶(HCT)、O-甲基转移酶(OMT)和1-脱氧-木酮糖-5-磷酸合成酶(DXS)。综上所述，本研究的结果表明，BL条件更适合草珊瑚根组织中生物活性代谢物的生长和积累；暴露于含更高比例BL的光照条件，将有潜力提高草珊瑚幼苗的产量和质量。论文ID原名：Consequences

点击蓝字“代谢组metabolome”，轻松关注不迷路编译：微科盟橙子，编辑：微科盟Tracy、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读我们以前曾用磁共振波谱（MRS）、弥散张量成像（DTI）和功能磁共振成像（fMRI）研究了非脑震荡大学生橄榄球运动员大脑的长期变化。另一些人报告说，接触性运动运动员的认知缺陷不符合脑震荡的诊断标准。这些结果表明，重复性轻度创伤性脑损伤（rmTBIs）的严重程度不足以达到脑震荡的诊断阈值，会产生长期的后果。我们试图描述rmTBI小鼠模型的神经影像学、认知、病理学和代谢变化。我们使用一个闭合颅骨的mTBI模型，当将其按比例放大到类似于人体时，其旋转加速度和线性加速度远低于运动员的脑震荡，我们发现每天5次mTBI会触发两种不同类型的病理变化。首先，在损伤后的最初几天和几周内，rmTBI产生了弥漫性轴索损伤，一种短暂的炎症反应和弥散张量成像（DTI）的改变，随着时间的推移而消失。其次，rmTBI导致了损伤后数月内明显的病理变化，包括：磁共振波谱（MRS）的变化、突触蛋白水平的改变、注意力和空间记忆的行为缺陷、病理磷酸化tau的积聚，血液代谢谱改变和白质超微结构异常。这些结果表明，在小鼠中，极轻微的rmTBI会触发过程，并在最初损伤数月后观察到病理后果。论文ID原名：Repetitive

点击蓝字“代谢组metabolome”，轻松关注不迷路编译：微科盟宁宁宁，编辑：微科盟Tracy、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读炎症性肠病(IBD)是一种影响几乎全身组织的慢性炎症性疾病。从前的研究主要集中在IBD患者的呼吸、粪便和尿液样本上。然而，目前还没有对血清、结肠、心脏、肝脏、肾脏、皮质、海马体和棕色脂肪组织等生物样本开展系统代谢组学分析。因此，本研究的目的是通过靶组织代谢组学分析研究其与IBD发病机制的联系，为早期诊断和治疗IBD疾病寻找新的生物标志物。本研究将雄性SD小鼠随机分为对照组和葡聚糖硫酸钠（DSS）处理组，DSS连续口服6周进行造模。用气相色谱-质谱连用技术（GC-MS）测定代谢物，并采用多元统计分析进一步鉴定两组间差异代谢物。研究结果显示，DSS处理组大鼠与正常组大鼠相比，血清、结肠、心脏、肝脏、肾脏、皮质、海马体和棕色脂肪组织中分别有3、11、12、6、5、13、13和11种差异代谢物。变化最为显著的代谢物包括氨基酸(L-丙氨酸、L-谷氨酸、L-苯丙氨酸、L-脯氨酸、L-赖氨酸、L-异亮氨酸、L-色氨酸、L-去亮氨酸、L-缬氨酸、甘氨酸、丝氨酸、L-苏氨酸)、有机酸(柠檬酸、3-羟基丁酸、丙酸)、糖类(D-阿拉伯糖、D-果糖）及嘌呤（9H-嘌呤-6-醇，D-核糖）。这些代谢物主要参与了氨基酸代谢通路(如丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢、谷胱甘肽代谢)及嘌呤代谢通路(氨基酰tRNA生物合成)。本研究采用气相色谱-质谱联用技术对IBD代谢物变化进行分析，为IBD及其相关疾病提供更全面的认识，提高对IBD发病机制的认识。论文ID原名：Systematic

点击蓝字“代谢组metabolome”，轻松关注不迷路编译：微科盟大陈子，编辑：微科盟Tracy、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读空气污染相关的心血管不良影响的分子机制仍在很大程度上是未知的。在本研究中，我们在2014-2016年间对居住在中国北京的73名健康成年人进行了纵向随访，研究了环境空气污染对血管功能的影响以及氨基酸的潜在调节作用。我们利用线性混合效应模型预测了大气污染物与血清可溶性细胞间黏附分子1

点击蓝字“代谢组metabolome”，轻松关注不迷路编译：微科盟萌依依，编辑：微科盟Tracy、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读仙女环是由蘑菇子实体和其绿色植物刺激区域形成的一圈可见绿色环的生态现象。双孢蘑菇A.bisporus仙女环可以刺激青藏高原高寒草甸植物的生长，但其潜在的生态生理和分子机制尚不清楚。在这里，作者使用生理学和代谢组学分析表明，双孢蘑菇仙女环通过调节植物代谢来改善高寒草甸植物的叶片生长。双孢蘑菇仙女环诱导K.humilis（高寒草甸主要植物种之一）中某些类别的氨基酸如谷氨酰胺、天冬酰胺、色氨酸和脯氨酸等大量积累，从而调节氮代谢、植物生长和胁迫反应。双孢蘑菇仙女环还影响了K.humilis的糖积累和碳代谢途径。此外，双孢蘑菇仙女环改变了土壤中代谢物的积累。土壤中几种有机酸和脂质的积累增加，有利于促进植物对营养元素的吸收，调节土壤中微生物的生长和繁殖。综上所述，作者的研究结果表明，双孢蘑菇仙女环通过调节碳/氮代谢、胁迫反应、养分吸收以及土壤微生物与高山草甸植物之间的相互作用来影响高山草甸植物的生长。论文ID原名：Comparative

点击蓝字“代谢组metabolome”，轻松关注不迷路编译：微科盟一，编辑：微科盟Tracy、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读纳米零价铁（nZVI）在环境领域广泛用于降解有机污染物，但对作物造成的潜在风险尚不清楚，而这对于纳米零价铁的后续应用至关重要。该研究中，研究者在混合了0、50和500

点击蓝字“代谢组metabolome”，轻松关注不迷路编译：微科盟向阳而生，编辑：微科盟Tracy、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读非酒精性脂肪肝（NAFLD）的病理生理学是一个包括肝脏和其他器官在内的代谢性和炎症性变化的复杂过程，但是其发病机理仍然未完全阐明。本研究通过构建两个小鼠模型分别研究了非酒精性脂肪肝以及非酒精性脂肪肝炎的代谢变化，血清、肝脏和小肠内容物中的代谢物浓度通过AbsoluteIDQ®

花青素3-(6''-(E)-caffeylsambubioside）、3.飞燕草素3-龙胆二糖苷、4.天竺葵素3-lathyroside、5.天竺葵素3-(4'''-p-coumarylrut

点击蓝字“代谢组metabolome”，轻松关注不迷路编译：微科盟橙子，编辑：微科盟Tracy、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读我们采用以营养素和生物活性代谢为目标的质谱代谢组学方法，研究了不同腌制方式对埃及橄榄果实代谢组学的影响。分析的新鲜橄榄品种包括Manzanilo、Picual、Koroneiki和Coratina，而腌制样品包括Manzanilo和Picual品种。初级和次级代谢产物图谱检测到201个代谢物，品种间的变异主要发生在糖、糖醇、裂环烯醚萜和黄酮类化合物之间。我们将Picual和Manzanilo中丰富的碳水化合物和O-糖苷对比Picual和Coratina橄榄中富集的secoiridoids，发现不同品种之间的口感和保健效益存在差异。本文报道了13个新化合物，其中10个仅出现在腌制样品中。一般来说，分析腌制样品的特征，发现裂环烯醚萜类的相对丰度是腌制过程的重要标志。代谢物图谱提供了腌制过程这种保存方法的深入见解，并解释了腌制水果中改善的感官特性。论文ID原名：Metabolome

点击蓝字“代谢组metabolome”，轻松关注不迷路编译：微科盟橙子，编辑：微科盟Tracy、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读表面发生凹陷是甜樱桃采摘后的一种严重生理紊乱，在挫伤后表面凹陷发展时可观察到。本实验的目的是利用代谢组学分析不同发育阶段以及收获后贮藏期间的细胞壁糖特征，比较两个不同品种的甜樱桃（Kordia：相对抗性；Sweetheart：相对易感性）的凹陷敏感性。Kordia明显比Sweetheart更结实，酒精不溶性残留物（AIRs）是Sweetheart的1.4倍。AIRs与变形显著相关，表明细胞壁物质的最高产量与抗断裂能力呈正相关。此外，游离D-半乳糖醛酸在凹陷Sweetheart样品中更高，这可能表明这种易感品种的果胶降解更大。Sweetheart樱桃对香豆酸衍生物L-5-氧代脯氨酸和D-半乳糖含量较高，贮藏过程中的代谢变化和细胞壁组成可能影响其对表面凹陷的敏感性。论文ID原名：Cell

点击蓝字“代谢组metabolome”，轻松关注不迷路编译：微科盟路芳芳，编辑：微科盟Tracy、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读草珊瑚是一种具有抗氧化、抗菌、抗炎、抗肿瘤作用的常绿中草药。光照是影响药材生长和品质的主要因素之一。近年来，LED

点击蓝字“代谢组metabolome”，轻松关注不迷路编译：微科盟北越城主，编辑：微科盟Tracy、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读具有紫色的茶品种引起了全球的关注。为了更好地了解紫色来源的主要化学成分，我们应用广泛靶标代谢组学对冻干紫色茶叶(PTLs)和绿色茶叶(GTL)的色素黄酮进行了研究，共鉴定出33种花青素，其中飞燕草色素3-O-半乳糖苷和花青素3-O-半乳糖苷含量最高。接着我们鉴定出226种其他化学成分，包括193个黄酮类化合物和33个单宁酸，其中PTLs和GTL在甲基化、酰化和糖基化黄酮类化合物差异显著。此外，花青素、类黄酮、叶绿素和儿茶素的平均含量也存在显著差异(p

点击蓝字“代谢组metabolome”，轻松关注不迷路编译：微科盟大陈子，编辑：微科盟Tracy、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读紫锥菊是一种重要的药用植物，具有显著的治疗潜力，在医药工业中有着广泛的应用。不同种类的紫锥菊表现出不同的化学成分和生物活性。本研究对紫锥菊的化学成分、抗氧化成分及其多样性机制进行了研究。我们采集了6种不同紫锥菊的地上部分和根进行研究。我们通过非靶标代谢组学分析发现紫锥菊的主要不同成分是菊苣酸、咖啡酸和紫锥花苷。同时，通过化学成分含量与体外抗氧化活性的相关性分析，发现这三种化学成分也是紫锥菊提取物的主要抗氧化成分。通过对已鉴定菊苣酸生物合成基因的克隆、测序和测定，我们确定紫锥菊属植物间菊苣酸和咖啡酸的多样性，并根据关键生物合成基因的表达水平来确定紫锥菊属植物的多样性。这些结果阐明了紫锥菊属植物的化学差异、可能的机理以及生物活性成分，可指导不同工业应用条件下紫锥菊种类的选择。论文ID原名：Diversity

点击蓝字“代谢组metabolome”，轻松关注不迷路编译：微科盟大陈子，编辑：微科盟Tracy、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读类风湿关节炎（RA）是一种慢性自身免疫性疾病，以关节炎症和疼痛为特征。在类风湿关节炎患者中，代谢组学方法，即血浆或血清中小分子代谢物的高通量分析，已使临床亚组、危险因素和治疗反应预测因子的生物标记物的发现成为可能。尽管最近取得了这些进展，但在RA精确治疗中，确定反映疾病活动的血液代谢物仍然是一个重要的挑战。在此，我们使用全球血浆代谢组学分析来检测与类风湿关节炎患者的定量疾病活动相关的代谢物，并预测其活性。我们采用超高效液相色谱-串联质谱（UPLC-MS/MS）对64例RA患者的128份血浆样品进行了研究，并对12例RA患者的12份血浆样品进行了验证。我们也采用两种不同的策略分析代谢组学特征，以发现与RA疾病活动相关的代谢物，这些代谢物通过C反应蛋白计算28关节疾病活动指数（DAS28-CRP）来确定。更具体地说，混合效应回归模型用于确定两个疾病活动组之间差异丰富的代谢物（较低，DAS28-CRP

点击蓝字“代谢组metabolome”，轻松关注不迷路编译：微科盟大陈子，编辑：微科盟Tracy、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读发酵和热处理可以改善食品的感官特性。我们采用脂质组学和代谢组学相结合的方法研究发酵棕色山羊奶的化学成分，并探讨化学成分的变化对感官品质的影响。发酵后，棕色山羊奶样品中的有机酸、多肽和中、长链脂肪酸含量显著增加。我们共鉴定出与感官品质相关的108种代谢物和174种脂质。杂环化合物作为美拉德反应的中间体，改变了色、味、香，改变了甘油三酯含量，降低了异味的影响，大大提高了发酵棕色山羊奶的感官品质。本研究为检验山羊奶感官品质提供了新的方法，并深入了解如何对这些品质进行改良，以进一步丰富市场上的乳制品。论文ID原名：Integrated

点击蓝字“代谢组metabolome”，轻松关注不迷路编译：微科盟萌依依，编辑：微科盟Tracy、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读酶促褐变会对包装好的鲜切生菜的质量和保质期产生负面影响。生菜的代谢物谱受褐变过程的影响。本研究的目的是筛选基于代谢组学的标记化合物来预测生菜褐变，可用于辨别适合商业生产和工业育种的生菜种质。作者在两个独立的试验和生长季节中评估了具有不同褐变敏感性的长叶莴苣，并使用超高效液相色谱结合高分辨率质谱

-哌啶酸和苹果酸在GDM组初乳和成熟乳中均降低。此外，79种代谢物中，有42种只在过渡性牛奶中不和谐，而19种代谢物只在成熟时有差异。此外，GDM组过渡乳和成熟乳中5种代谢物泛酸、核黄素、吡哆醛、4

点击蓝字“代谢组metabolome”，轻松关注不迷路编译：微科盟橙子，编辑：微科盟Tracy、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读结直肠癌（CRC）是最常见的恶性肿瘤之一，以往的代谢组学研究在确定肿瘤表型的特异性小分子方面显示出巨大的潜力。在本研究中，我们通过气相色谱-质谱（GC-MS）分析切除组织的代谢物，发现CRC组织中牛磺酸的浓度降低，而亚牛磺酸的浓度升高。体外实验结果表明，牛磺酸能显著抑制CRC细胞的增殖、转移和集落形成，而诱导CRC细胞凋亡。此外，牛磺酸以剂量依赖的方式调节上皮间充质转化（EMT）相关基因的表达水平。牛磺酸也减轻了亚牛磺酸诱导的CRC进展，这与ERK/RSK信号通路的抑制和细胞亚牛磺酸的减少有关。牛磺酸还可以抑制亚牛磺酸诱导的肿瘤生长和转移。CRC患者血清牛磺酸水平较低，暗示牛磺酸可能是反映CRC预后不良的一个有前景的生物标志物。总的来说，我们的研究结果表明，牛磺酸减毒，亚牛磺酸诱导的CRC进展提供了一个潜在的CRC治疗的目标。论文ID原名：Taurine

-5)，在HNT-和HDT处理的胚乳(即白背水稻的形成)之间观察到一些相似之处，包括氧化还原调控。我们未检测到GA、ABA等候选激素，然而，这些差异可能是由于阶段的差异，这有待于未来的研究。图6

点击蓝字“代谢组metabolome”，轻松关注不迷路编译：微科盟橙子，编辑：微科盟Tracy、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读脂类包括对膜的结构和性质非常重要的多种化合物，如高能燃料源和信号分子。因此，这些不同种类脂质的周转率是细胞功能的基础。然而，它们巨大的化学多样性和细胞内的动态范围使得详细的分析非常复杂。此外，尽管稳定同位素示踪剂能够测定复杂脂质的合成和降解，但可分辨分子的数量却大大增加，这加剧了问题的严重性。尽管液相色谱-串联质谱（LC-MS-MS）是脂质组学的标准，核磁共振（NMR）可以增加全球脂质分析和完整脂质同位素分布的价值。在这里，我们描述了NMR分析的新进展，用13C6葡萄糖和13C5谷氨酰胺示踪剂评估两个细胞系（PC3和UMUC3）的总脂质含量和复杂脂质混合物的同位素富集。论文ID原名：NMR

点击蓝字“代谢组metabolome”，轻松关注不迷路编译：微科盟橙子，编辑：微科盟Tracy、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读线粒体参与多种代谢途径，其失调导致多种疾病，包括衰老相关疾病。然而，线粒体疾病的代谢变化和机制尚不完全清楚。在这里，我们发现来自线粒体肌病、脑病、乳酸酸中毒和卒中样发作（MELAS）患者的诱导多能干细胞（iPSCs）在糖酵解被抑制时显示增殖和存活减弱的现象，牛磺酸可以挽救这些减弱的现象。代谢组学分析显示，在MELAS-iPSCs中，还原型谷胱甘肽（GSH）与氧化型谷胱甘肽（GSSG）的比值降低；而GSH底物半胱氨酸和氧化应激标记物的水平上调。牛磺酸使这些变化正常化，表明MELAS-iPSCs受到氧化应激的影响，牛磺酸降低了氧化应激的影响。我们还利用三维培养系统分析了从MELAS-iPSCs分化而来的视网膜色素上皮（RPE），发现其具备上皮-间充质转化（EMT），但可以被牛磺酸抑制。因此，线粒体功能障碍导致代谢改变，氧化应激的积累导致GSH的耗竭，而RPE中的EMT可能参与视网膜的发病机制。由于这些现象对牛磺酸治疗敏感，我们认为牛磺酸的应用可能是线粒体相关视网膜疾病的一种潜在的新治疗方法。论文ID原名：Taurine

点击蓝字“代谢组metabolome”，轻松关注不迷路编译：微科盟大陈子，编辑：微科盟Tracy、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读详细了解糖尿病肾病(DN)的组织特异性代谢重编程对于更准确地理解分子病理特征和开发新的治疗策略至关重要。在本研究中，基于空气动力辅助解吸电喷雾质谱成像(AFADESI)和基质辅助激光解吸电离(MALDI)集成质谱成像(MSI)的空间分辨代谢组学方法，我们研究了高脂饲料喂养和链脲霉素(STZ)治疗DN的肾脏组织特异性代谢改变，并且探究了潜在的抗糖尿病药物黄芪甲苷对DN的治疗效果。因此，广泛的功能代谢物包括糖、氨基酸、核苷酸及其衍生物、脂肪酸、磷脂、鞘脂、甘油酯、肉碱及其衍生物、维生素、肽、识别与DN相关的金属离子，并以高化学特异性和高空间分辨率显示其在大鼠肾脏内的独特分布模式。通过反复口服黄芪甲苷(100

点击蓝字“代谢组metabolome”轻松关注不迷路编译：微科盟橙子，编辑：微科盟Tracy、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读丙烯酰胺（ACR）是富含碳水化合物的食物在高温热加工过程中产生的，可通过摄食、吸入和皮肤接触直接进入人体。ACR的毒性已被广泛研究。这些研究的主要结果表明，暴露于ACR可引起动物和人类的神经毒性，并在啮齿类动物模型中显示出生殖毒性和致癌性。然而，ACR的毒性机制尚未被代谢组学方法所研究，ACR对自噬的影响尚不清楚。在这里，我们用ACR处理U2OS细胞6

点击蓝字↑↑↑“代谢组metabolome”轻松关注不迷路编译：微科盟红烧大肥鸥，编辑：微科盟Tracy、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读衰老和新陈代谢过程是紧密交织在一起的；因此，开发与新陈代谢相关的生物标志物是延缓衰老的关键。然而，很少有基于机器学习的研究能发现衰老轨迹的可靠标记物。我们利用超高效液相色谱/质谱技术从大鼠尿液中生成代谢谱，而代谢谱是在训练组和试验组大鼠年龄的四个阶段(20、50、75和100周)动态生成的。偏最小二乘判别分析得分曲线图表明训练组和测试组随着年龄的增长，在一个方向上呈现出完美的分离轨迹。在训练组中，我们通过结合四种算法(VIP、时间序列、LASSO和SVM-RFE)进一步筛选出25个与衰老相关的生物标志物。本研究最后鉴定出6种与衰老相关的代谢物（已知或新的），包括肾上腺素、戊二酰肉碱、L-犬尿氨酸、牛磺酸、3-羟基十二碳二酸和N-乙酰瓜氨酸。我们还发现除N-乙酰瓜氨酸外(p0.05)。我们的发现揭示了衰老的代谢轨迹，并为潜在的抗衰老治疗靶点提供了新的生物标志物。论文ID原名：Aging-related

点击蓝字↑↑↑“代谢组metabolome”轻松关注不迷路编译：微科盟花卷小丸子，编辑：微科盟Tracy、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读玉米籽粒是糖、蛋白、油分和关键营养物质的贮藏器官，是提高玉米产量改善品质的主要研究对象，也是进行遗传和分子生物学研究的模式组织。国内广泛应用的关联群体和5个重组自交系已经在基因组、转录组、代谢组、表型组水平应用全基因组关联分析（GWAS）和连锁定位，获得了与玉米籽粒品质和大小相关的数量性状遗传位点（QTL）上的一些候选基因。目前，在群体范围上，对玉米籽粒蛋白组的研究鲜有报道。蛋白组QTL（pQTL）分析已经在多种人类疾病诊断上应用，并构建了应用于临床的基因组-蛋白组网络。阐明现代玉米育种过程中基因表达变异的功能背景十分必要，但是pQTL如何调控玉米籽粒发育还未报道。论文ID原名：Mining

点击蓝字↑↑↑“微科享”，轻松关注不迷路编译：微科盟大陈子，编辑：微科盟Tracy、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读全氟辛酸(PFOA)是工业中最常用的全氟化学品之一。近年来，全氟辛烷磺酸的毒性引起了广泛关注。然而，关于全氟辛烷磺酸免疫毒性的报道相当有限。本研究旨在研究PFOA暴露对巨噬细胞RAW264.7的免疫毒性。我们评估了PFOA暴露对巨噬细胞活力、细胞凋亡和细胞ROS水平的影响，并检测到RAW264.7中细胞因子显著性释放。结果表明，PFOA能显著降低RAW264.7巨噬细胞的活力，且呈剂量和时间依赖性。其中，200

AD)的特征是认知能力下降，这是由于脑内细胞外β-淀粉样蛋白(Aβ)斑块和神经纤维缠结的积累，损害了谷氨酸(Glu)代谢。小牛血去蛋白提取物注射液(Deproteinized

点击蓝字↑↑↑“微科享”，轻松关注不迷路编译：微科盟草重木雪，编辑：微科盟Tracy、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读炎症性肠病(IBD)是一种难以诊断和分类的疾病。本研究的目的是建立基于粪便多组学数据的人工智能模型，用于IBD及其亚型的多分类诊断。本研究共纳入299项临床队列研究，其中健康者86例，CD患者140例，UC患者73例。基于分层建模的思想，我们分别对总体和自我评价非常好和略低于par的群体进行建模。原始的总特征为粪便多组学数据，包括宏基因组学、宏转录组学、蛋白质组学、代谢组学、病毒组学、粪便钙卫蛋白，我们采用重要性、共线性等特征工程方法对特征进行评价，最后，得到了3个特征较少、准确率较高的个性化诊断模型。首先，我们筛选111个特征构成总体的最优特征集，建立了AUC为0.83的三分类个体诊断模型，该模型可同时诊断健康、CD和UC。其次，根据总体的层次模型，我们建立了两种不同自我评价的总体模型。对于非常好的人群，我们筛选了59个特征，建立了AUC为0.85的三分类诊断模型。对于略低于par的自我评价人群，我们最终纳入22个特征，建立AUC为0.84的三分类诊断模型。最优特征集仅包含代谢组学和元转录组学特征。本研究为IBD患者的高准确性、无创诊断和亚型识别提供了一种有价值的方法。研究者可以根据患者的不同自我评价在不同的模型中选择生物标志物。简单的无创粪便取样可用于检测代谢组学和元转录组学数据，从而替代临床冗长而痛苦的结肠镜检查和活检程序。论文ID原名：Application

点击蓝字↑↑↑“微科享”，轻松关注不迷路编译：微科盟橙子，编辑：微科盟Tracy、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读滑膜炎、痤疮、脓疱病、骨质增生和骨炎（SAPHO）综合征是一种罕见的慢性炎症性疾病，其发病机制尚不清楚。在本研究中，88名SAPHO患者和118名健康对照者被招募来研究血清细胞外囊泡（SEVs）在SAPHO综合征中的作用。基于串联质量标记的SAPHO-SEVs定量蛋白质组学分析揭示了参与骨代谢的差异表达蛋白。其中，血清淀粉样蛋白A-1（SAA1）和C反应蛋白（CRP）上调，酶联免疫吸附试验证实SAPHO患者SAA1水平较高。此外，SAA1水平与CRP呈正相关，CRP是一种与患者病情相关的炎症标志物。体外细胞研究证实SAPHO-SEVs主要在疾病活动期抑制破骨细胞（OC）的生成。进一步分析表明，在SAPHO-SEVs刺激下，活动期患者的破骨细胞中核仁素表达上调。在这项研究中，我们确定SAA1是一个额外的炎症标志物，可能有助于SAPHO综合征的诊断，并推测核仁素是活动期患者破骨细胞生成的关键调节因子。论文ID原名：Serum-derived

点击蓝字↑↑↑“微科享”，轻松关注不迷路编译：微科盟橙子，编辑：微科盟Tracy、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读低级别浆液性卵巢癌（LGSOC）是一种罕见的肿瘤亚型，在转移性疾病患者中病死率很高。目前迫切需要开发有效的治疗方法，利用新的临床前模型进行治疗发现和药物评价。在这里，我们使用全基因组测序、RNA测序和基于质谱的蛋白质组学在14个LGSOC细胞系上的多组学整合来阐明新的生物标记物和治疗漏洞。比较LGSOC细胞系数据和LGSOC肿瘤数据可以预测MEK抑制剂（MEKi）的疗效，我们发现KRAS突变仅见于MEKi敏感细胞系，NRAS突变主要见于MEKi耐药细胞系。我们在MEKi敏感细胞系和MEKi耐药细胞系中发现了不同的体细胞突变模式。CDKN2A/B和MTAP基因的缺失在细胞系中比在肿瘤样本中更为频繁，并且可能代表在没有KRAS/NRAS/BRAF突变情况下的关键驱动事件。这些LGSOC细胞系是LGSOC肿瘤分子畸变的典型模型。对于体外MEKi疗效的预测，蛋白质组学数据提供了比基因表达数据更好的鉴别。凝聚素、微染色体维持和复制因子C蛋白复合物被确定为MEKi耐药细胞系的潜在治疗靶点。这项研究表明，CDKN2A/B或MTAP缺乏症可通过综合致死治疗策略加以利用，强调了利用蛋白质组学数据作为分子药物预测工具的重要性。多组学方法对于提高我们对LGSOC分子基础的理解以及应用这些信息开发新的治疗方法至关重要。论文ID原名：Multiomics

点击蓝字↑↑↑“微科享”，轻松关注不迷路编译：微科盟三金，编辑：微科盟Tracy、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读暴露于热应激下会触发以热休克蛋白HSF1依赖性转录上调为特征的明确的急性反应。恢复的细胞将具有耐热性，但人们对这种适应性机制了解甚少。通过定量蛋白质组学，作者发现在获得耐热性的MCF7乳腺癌细胞中，HSP70家族伴侣HSPA1及其辅因子HSPH1和DNAJB1选择性上调。HSPA1在热应激反应中具有双重功能：（i）在急性应激中，它促进26S蛋白酶体募集到翻译的核糖体中，从而为细胞快速降解蛋白质和恢复时合成蛋白质奠定基础；（ii）在耐热性期间，HSPA1与HSPH1一起将泛素化的新生/新合成蛋白质维持在蛋白酶体有效清除所需的可溶状态。HSPH1的缺失同样会阻碍小鼠的耐热性和食道肿瘤的生长，从而为高HSPH1的消化道癌预后不良和试图将HSPH1作为癌症药物靶点提供了可能的解释。作者阐述了HSPA1单独或与HSPH1、DNAJB1结合时在促进新生/新合成蛋白质的质量控制和细胞耐热性中的双重作用。论文ID原名：Dual

点击蓝字↑↑↑“微科享”，轻松关注不迷路编译：微科盟大陈子，编辑：微科盟Tracy、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读重度激素抵抗型哮喘(SSRA)是在哮喘治疗的一个严重临床问题，受影响的患者有严重的临床症状，生活质量恶化，并且对类固醇无反应，因此，迫切需要有效的治疗。由间充质干细胞(MSC-Exo)衍生的外泌体通过其免疫调节作用成为治疗肺部炎症疾病的有效方法。在本研究中，我们探讨了MSC-Exo对SSRA的治疗作用，并明确了MSC-Exo的治疗机制。我们成功分离并鉴定了hUCMSCs的外泌体，也验证MSC-Exo气管内给药逆转了SSRA小鼠的AHR、组织病理学改变和炎症反应。巨噬细胞的系统性耗竭减弱了MSC

点击蓝字↑↑↑“微科享”，轻松关注不迷路编译：微科盟Echo，编辑：微科盟Tracy、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读众所周知，心脏再生始终是各国研究人员高度关注的重要领域之一。与成年心脏相比，新生哺乳动物的心脏表现出一种短暂的心脏再生能力，而其心肌细胞在出生后不久，能量代谢从糖酵解转变为氧化磷酸化，加之出生后代谢底物利用率的变化，这种变化增加了线粒体活性氧的产生，最终导致肌细胞退出细胞周期。之前的研究表明丙二酸具有心脏保护作用，研究者通过pH3(磷酸组蛋白H3)和极光激酶B染色观察，发现丙二酸处理的心脏中增殖心肌细胞的数量明显增加，表明丙二酸作为一种心脏再生疗法中的潜在物质，其可致代谢重编程，在心脏再生临床应用上的迈出了重要一步。论文ID原名：From

点击蓝字↑↑↑“微科享”，轻松关注不迷路编译：微科盟橙子，编辑：微科盟Tracy、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读SUMO化在调节包括核糖体生物合成在内的多种细胞过程中起着关键作用。蛋白质组学分析和实验证据表明，SUMO修饰了许多参与核糖体生物合成的核仁蛋白。然而，这些蛋白质在细胞中是如何被SUMO化的还不清楚。在这里，我们报告USP36，一种核仁去泛素化酶（DUB），促进核仁SUMO化。USP36的过度表达增强了核仁SUMO化，而其敲除或基因缺失降低了SUMO化的水平。USP36与SUMO2和Ubc9相互作用，在细胞和体外直接介导SUMO化。我们发现USP36在细胞和体外促进小核仁核糖核蛋白（snoRNP）组分Nop58和Nhp2的SUMO化，并促进它们与snoRNAs的结合。它还促进snoRNP组分Nop56和DKC1的SUMO化。在功能上，我们发现USP36的敲除明显损害了rRNA的加工和翻译。因此，USP36促进snoRNP基团SUMO化，对核糖体生物发生和蛋白质翻译至关重要。论文ID原名：The

点击蓝字↑↑↑“微科享”，轻松关注不迷路编译：微科盟陌陌谦行，编辑：微科盟Tracy、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读体细胞DNA拷贝数变异（CNV）在癌症中很普遍，尽管在改变细胞信号状态方面通常没有明显的特征，但可以驱动癌症的进展。在这里，我们整合了5598个肿瘤样品的基因组和蛋白质组数据，以识别导致异常信号转导的CNV。对数据结果进行关联分析，我们概括了已知的激酶与底物的关系，并且对有因果关系的基因进行进一步的系统分析。在全肿瘤分析中我们确定了303个重要关联基因，其中43％的基因在癌细胞系中复制，包括在多种肿瘤类型中被发现的44个磷酸化位点关联基因。我们预测的多个Hippo信号调节基因也在实验中得到证实。通过RNAi、CRISPR和药物筛选获得的数据，我们发现了癌细胞系中激酶成瘾的证据，从而确定了针对激酶依赖型细胞系的抑制剂。我们认为，基因的拷贝数可作为激酶抑制影响差异的预测指标，该策略在未来可能用于抗癌治疗。论文ID原名：Copy

点击蓝字↑↑↑“微科享”，轻松关注不迷路编译：微科盟李可爱，编辑：微科盟Tracy、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读宫颈癌是一种严重威胁人类健康的常见女性恶性肿瘤，本研究探讨了蔓荆子天然产物罗通定(RTF)的抗宫颈癌作用及其潜在机制。研究结果显示，罗通定可通过体外诱导细胞凋亡来抑制宫颈癌细胞系的增殖，随后我们在接种HeLa细胞的异种移植模型上进一步证实了罗通定的抗肿瘤作用。此外，我们的结果还证明了RTF的抗肿瘤作用可能与活性氧通过MAPK和PI3K/Akt信号通路诱导线粒体依赖性凋亡有关。并且我们利用蛋白质组学分析和药物亲和反应靶标稳定性结合质谱(DARTS-MS)，表明Cyr61是宫颈癌细胞中RTF的潜在靶标。我们目前的研究将有助于开发未来宫颈癌治疗的候选药物RTF。论文ID原名：The

点击蓝字↑↑↑“微科享”，轻松关注不迷路编译：微科盟三金，编辑：微科盟Tracy、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读本文回顾了在持续的全球医疗危机中，基于多种质谱对SARS-CoV2冠状病毒的分析。尽管RT-PCR是最流行的基于分子的监测方法，但质谱检测高灵敏度结合快速分析，高分子精度，高通量以及现场测试的潜力在表征病毒和研究其感染宿主细胞的分子途径上有着巨大优势。目前对病毒的研究与表征主要包括以下方法：MALDI-TOF质谱法检测生物标志物；使用蛋白质分型策略研究病毒肽；靶向

点击蓝字↑↑↑“微科享”，轻松关注不迷路编译：微科盟李可爱，编辑：微科盟Tracy、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读研究表明探讨非典型蛋白质功能可以识别新的组织稳态途径。本研究中，我们描述了Bcl-2家族成员BAD在乳腺形态发生中的作用。在BAD3SA敲入小鼠中，BAD不能在3个关键丝氨酸残基上磷酸化，导致青春期腺体发育因导管上皮异常小管的发生而延迟。蛋白质组学和RPPA分析确定BAD可调节局部粘连和mRNA翻译阻遏物4E-BP1。研究结果表明，BAD可调节驱动粘着斑成熟和细胞运动的局部翻译。与此相一致，含BAD3SA器官内的细胞包含不稳定的突起，其间隔的mRNA翻译和粘着斑减少，伴有细胞迁移和肾小管生成减少，表明稳定性可通过4E-BP1衰竭得以挽救。我们的结果证实了BAD在乳腺发育过程中控制局部翻译和细胞迁移的作用。论文ID原名：BAD

点击蓝字↑↑↑“微科享”，轻松关注不迷路编译：微科盟橙子，编辑：微科盟Tracy、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读皮质基底节变性（CBD）是一种慢性进展性神经变性疾病。其临床表现与进行性核上性麻痹（PSP）、阿尔茨海默病（AD）、额颞叶痴呆和帕金森病重叠。我们对经病理证实的CBD和PSP病例以及对照组的脑脊液（CSF）进行了蛋白质组学分析。与对照组相比，CBD患者脑脊液中的16种蛋白质显著增加，PSP患者中的3种蛋白质显著改变，CBD患者和PSP患者之间有18种蛋白存在显著差异。一项针对细胞定位富集中显著改变的蛋白质分析（支持信息表S5），显示了与细胞外空间和囊泡的关联，两者均适用于CBD和PSP。总之，利用蛋白质组学和免疫印迹法，我们在脑脊液中鉴定了一系列潜在的CBD蛋白标志物。论文ID原名：Cerebrospinal

点击蓝字↑↑↑“微科享”，轻松关注不迷路编译：微科盟大陈子，编辑：微科盟Tracy、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读编码线粒体蛋白超长链酰基辅酶A脱氢酶（VLCAD）和线粒体三功能蛋白（TFP）的核基因突变导致罕见的常染色体隐性遗传疾病。我们对VLCAD和TFP突变患者来源的成纤维细胞进行研究并发现细胞线粒体缺陷。为了深入了解导致线粒体缺陷的病理变化，我们对来自三种不同VLCAD和三种不同TFP突变的受试者的成纤维细胞进行了定量蛋白质组学、生化和形态计量学分析。经抗体检测证实的蛋白质组学数据表明，VLCAD和TFP突变细胞中VLCAD和TFP蛋白水平分别降低，这在一定程度上解释了脂肪酸氧化能力降低的原因。结果表明，在葡萄糖去除后，VLCAD和TFP突变细胞线粒体呼吸容量下降，TFP突变细胞糖原水平较低。尽管存在这些能量缺陷，但VLCAD和TFP突变的细胞在线粒体形态、分布、融合和裂变方面没有表现出变化，这些变化可以通过共聚焦或透射电子显微镜进行量化，并通过蛋白质组学和基于抗体的蛋白质分析得到证实。VLCAD成纤维细胞和TFP突变细胞线粒体呼吸链蛋白和促进呼吸复合体组装的蛋白水平增加。除了TFP突变细胞中过氧化氢酶和谷胱甘肽S-转移酶θ-1水平降低外，VLCAD和TFP突变细胞与非疾病对照组之间所有主要细胞内抗氧化网络中45种蛋白质的水平相似。总体数据表明，尽管存在代谢缺陷，但携带VLCAD和TFP突变的细胞仍能保持蛋白质组的完整性，以保护细胞和线粒体的结构，支持能量生产，并保护氧化应激。论文ID原名：Mitochondrial

点击蓝字↑↑↑“微科享”，轻松关注不迷路编译：微科盟橙子，编辑：微科盟Tracy、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读凋亡诱导因子（AIF）作为一种线粒体黄素蛋白，在线粒体生物能量学中起着重要的作用，在缺血性中风或神经退行性疾病时，它一旦从线粒体释放并转运到细胞核，即介导caspase非依赖性细胞死亡。尽管AIF的选择性剪接调控已被证实，但在病理条件下AIF剪接亚型的诱导以及它对成年脑线粒体功能和神经退行性疾病的影响尚不清楚。本研究中，我们鉴定了一种缺失外显子2和3的天然剪接AIF亚型，命名为AIF3。AIF3在生理条件下是无法检测到的，但在小鼠和人中风后的死脑中表达增加。AIF3在小鼠脑内的剪接导致脑室扩大和前脑严重的神经退行性疾病，这些AIF3剪接小鼠在出生后24个月死亡。AIF3剪接引发了神经退行性疾病涉及线粒体功能障碍和AIF3核易位。我们发现AIF3抑制NADH氧化酶活性、ATP生成、氧消耗和线粒体生物发生。此外，AIF3的表达显著增加染色质浓缩和核收缩，导致神经细胞死亡。然而，在花斑眼镜蛇中单独缺失AIF或在AIF3基因敲除小鼠中单独获得AIF3并没有像在AIF3剪接小鼠中观察到的那样引起强烈的神经退行性疾病。我们确定AIF3是一种疾病诱导的亚型，并建立了AIF3剪接小鼠模型。AIF3剪接诱导的神经退行性疾病的分子机制包括线粒体功能障碍和AIF3核易位，这是AIF丢失和AIF3获得的协同作用结果。我们的研究为理解AIF3剪接在大脑中的作用提供了一个有价值的工具，同时也为预防/延缓神经退行性疾病的进展提供了一个潜在的治疗靶点。论文ID原名：AIF3

点击蓝字↑↑↑“微科享”，轻松关注不迷路编译：微科盟向阳而生，编辑：微科盟Tracy、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读释放各种类型细胞外囊泡（EV）的细胞，可将复杂的信号转导至周围细胞中，但用于鉴别不同EVs的特定（例如：外泌体，细胞和外粒体，HIV样的包装病毒）标记仍然缺乏。我们开发了一种蛋白质组学方法用于鉴别EV亚型的组成并将其应用于人类JuratT细胞。我们建立了一个交互的数据库对具有相似特征的蛋白组进行定义，定义的依据是释放相似的EVs。生物化学验证证实了在EVs中通常优先使用的EVs中伴侣分子的外泌体标记物：CD81/ADAM10/ITGB1，以及CD63/细胞内衔接蛋白。我们接着比较了来自对照组和HIV-1感染的细胞中的EVs。HIV感染改变了几个细胞内蛋白的EV谱，包括MOV10和SPN，这两种蛋白可整合到HIV病毒颗粒中，同时SERINC3，可以以一种Nef依赖的方式改道进入非病毒性的EVs中。我们进一步发现SERINC3控制了EVs的表面组成。我们的工作流程提供了鉴别候选标记和EV亚型潜在调节因子的无偏方法。这可以被广泛的应用于体外试验系统，以研究EV生理或病理变化。论文ID原名：Unbiased