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重磅推荐|高彩霞在高保真CRISPR-Cas9基因组编辑方法研究中取得新进展

2017-10-13 iNature iNature

iNature:高彩霞研究团队将水稻tRNAGlu序列融合到U3启动子和sgRNA之间,利用细胞內源的RNase P和RNase Z将未成熟的sgRNA中的向导序列加工成为与靶序列精确匹配的20个碱基,通过这一策略能够将eSpCas9(1.0)、eSpCas9 (1.1)和SpCas9-HF1的活性保持在与野生型SpCas9相当的水平,并且还保持其特异性。 




基于序列特异性核酸酶的基因组编辑技术的出现及发展,正在彻底改变基础和应用生物学。特别是CRISPR-Cas9的发现及应用,基因组编辑技术已经广泛应用于植物基因组的编辑和作物的性状改良。基因编辑技术主要是通过在特定位点产生双链断裂(DSBs),进而通过差错率较高的非同源末端连接(NHEJ)的方式进行修复,在这个过程中会导致碱基的缺失或者插入,从而造成基因突变。通过基因编辑技术对植物中进行精确的基因替换或修饰在植物研究及应用中有更多的用途,也是目前植物编辑面临的挑战之一。


基因组编辑是生命科学新兴的颠覆性技术,特别是基于CRISPR-Cas9系统的基因组编辑工具近几年迅猛发展,在医疗、农业等领域得到广泛应用。然而,Cas9脱靶现象是目前限制其发挥巨大潜力的最主要问题之一,提高该系统的特异性一直是基因组编辑方法研究的焦点。 



通过蛋白质工程的方法,美国两个课题组前期分别对Cas9蛋白进行定向改造,获得了三种特异性显著提高的Cas9蛋白变体:eSpCas9(1.0)、eSpCas9 ( 1.1 )   和 SpCas9-HF1。中国科学院遗传与发育生物学研究所高彩霞研究组近期的研究发现,这三种高保真的SpCas9核酸酶的基因组编辑活性会严格受到sgRNA向导序列(guide sequence)长度的影响。



将向导序列设为与靶位点精确匹配的20个碱基,是确保三种高保真SpCas9核酸酶的活性的重要前提。为此,高彩霞研究团队将水稻tRNAGlu序列融合到U3启动子和sgRNA之间,利用细胞內源的RNase P和RNase Z将未成熟的sgRNA中的向导序列加工成为与靶序列精确匹配的20个碱基,通过这一策略能够将eSpCas9 (1.0) 、eSpCas9(1.1)和SpCas9-HF1的活性保持在与野生型SpCas9相当的水平,并且还保持其特异性。 


该研究成果于2017年10月11日在线发表于Genome Biology杂志上(DOI:10.1186/s13059-017-1325-9)。高彩霞研究组硕士生张定波和副研究员张华伟为该论文的并列第一作者,该研究得到科技部,农业部,中科院以及国家自然基金委的资助。 



延伸阅读

重磅推荐|CRISPR技术在植物的应用及进展


原文链接

https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-017-1325-9


原文解析

http://www.genetics.ac.cn/xwzx/kyjz/201710/t20171012_4872462.html




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