快讯|康奈尔大学华健教授揭示染色质重塑因子CHR5参与植物抗病
iNature:染色质重塑因子CHR5正调节细胞内免疫受体基因SNC1的表达,并在拟南芥中,影响全基因组核小体的占有。
植物免疫由几层防御反应组成,每层由植物受体对病原体特征的特异识别诱导。 其中之一,就是称为效应器触发免疫(ETI),主要由直接或间接检测病原体效应物的抗性(R)蛋白质介导。 大多数R基因编码由核苷酸结合和富含亮氨酸的重复结构域组成的Nod样受体(NLR)蛋白。 NLR表达的微调对于有效的防御反应和防御激活与植物生长之间的平衡至关重要。 虽然在植物中相当详细地研究了NLR介导的免疫,但其表达调控的基因分子机制尚未完全了解。
ETI途径
ATP依赖性染色质重塑因子使用ATP水解的能量来改变染色质的结构,并且是真核基因表达的重要调节剂。以前发现拟南芥中的一个这样的因子CHR5(染色质重塑因子5)参与生长和发育调节。
chr5的生理学表型
美国康奈尔大学华建研究组揭示CHR5是上调细胞内免疫受体基因SNC1 (SUPPRESSOR OF npr1-1, CONSTITUTIVE1)所必需的,因此是由SNC1上调引起的自身免疫。
snc1中自身免疫反应需要CHR5
CHR5与另一种染色质重塑基因DDM1具有拮抗作用,独立地用组氨酸单泛素酶HUB1在SNC1调节中起作用。此外,CHR5是针对细菌病原体丁香假单胞菌,独立正调控植物免疫的SNC1因子。
CHR5影响全基因组核小体的占有
有趣的是,相对于基因体区,chr5突变体在整个基因组水平上启动子区域中增加了核小体占有率,这表明CHR5在重构核小体占有中具有全基因组范围的重要作用。因此,华建研究组的实验结果表明CHR5是植物免疫应答的正调节因子,包括促进SNC1的表达,并揭示CHR5在核小体占有中的作用,这可能影响基因组全基因表达。
原文链接
https://academic.oup.com/pcp/article/doi/10.1093/pcp/pcx155/4557152/The-Arabidopsis-Chromatin-Remodeling-Factor-CHR5
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