讲到miRNA，想必做分子机理研究的小伙伴们并不陌生，miRNA的功能不断被人类发掘，就在2020年5月3号，Nishiwada S 研究团队在Gastroenterology （IF=19.233）杂志中发表了关于miRNA的另一项重大功能——miRNA表达谱特征识别胰腺导管癌患者淋巴结转移风险性。让我们一起看看如此重要的研究成果，其文章思路又是怎样的。。。
作者的出发点很明确，针对胰腺导管腺癌（PDACs）经常性淋巴结转移的坏毛病，寻找可以预测PDACs患者是否发生淋巴结转移的靶基因。作者首先以来自三个公共数据库（TCGA、GSE24279和GSE32688）中PDACs 样本的miRNA表达谱，筛选与转移相关的miRNA，并挑选关键miRNA分别初步构建logistic回归预测模型。为了确定以上初步构建诊断模型的准确性，收集来自日本的、具有高风险的淋巴结转移PDACs患者的组织样本，分别以157份PPDAs(83份淋巴转移和74分无淋巴转移)和107份PDACs(63份淋巴转移和44分无淋巴转移)作为训练样本和验证样本进行logistic回归预测模型构建。为了再次验证模型的准确性和灵敏性，因此作者又收集来自以上两组的小样本量活检标本47例（22转移和25未转移）再次分析验证。旁白：：如此严密的逻辑思维不发高分都难。。。再验证就要怀疑有强迫症了。。。。但是嘛，这种品质就是科研人员应该具备的，膜拜膜拜！！！！3.1. 公共数据库miRNA表达谱分析在PDACs 淋巴结转移检测中的应用作者先通过三个公共数据库（TCGA、GSE24279和GSE32688）筛选到了7个与PDACs 淋巴结转移密切相关的miRNA (miR-155-5p, miR-196b-5p, miR-365a-5p,miR-629-5p, miR-675-3p,miR-92b-3p and, let-7d-5p)。并针对这7个miRNA进行logistic回归诊断模型构建，结果如下：
图1 TCGA、GSE24279和GSE32688 中的风险回归模型旁白：：看到这个结果是不是有人就想发文章，告诉你，千万别，要么高分文章又要与你擦肩而过了。。不断探索和求证的精神坚持住。。。为了验证公共数据库中得到的风险诊断模型的可靠性，作者通过收集157 PDACs 样本 (83 LNP and 74 LNN)作为训练数据集验证最初筛选的结果，发现let-7d-5p分析结果不一致，最终确定6 miRNAs (miR-155-5p, miR-196b-5p, miR-365a-5p,miR-629-5p, miR-675-3p and miR-92b-3p)作为候选对象。再次通过107个PDACs 样本(63 LNP and 44 LNN cases)作为验证数据集验证以上6个miRNA的准确性。全部的结果确定了6个miRNA在PDACs淋巴结转移的诊断中具有重要的临床价值。
3.2. miRNA标记物联合CA19-9联合诊断分析众所周知，CA19-9是PDACs中重要的生物标记物，因此，作者将筛选到的6个miRNA与CA19-9联合分析，结果发现，诊断模型的准确性大幅度提高。如图2所示。
旁白：：这是个亮点，无论黑猫还是白猫，能抓到老鼠就是好猫。在此，无论是什么方法，只要能提高诊断效率就是好方法，大家说是不是？？？3.3. miRNA靶标对PDACs患者预后的影响作者根据Youden index（约登指数），对6个miRNA特征模型得到的临界阈值分别将训练集和验证集样本分为高低风险组并通过logistic方法进行生存预后及单因素多因素分析。结果发现，高风险组是PDACs的独立风险指标。这一结果进一步强调了，6个miRNA不仅可以作为PDACs是否发生淋巴结转移的重要诊断指标，还具有显著的预后潜力。如下图所示：
旁白：：结果到了这一步是不是挺有诱惑性？千万把持住，继续验证真理可行性。。。3.4. 47例PDACs 活检标本验证miRNA预测模型可靠性活检标本的验证结果得到了令人满意的结果，联合CA19-9也能大幅度提高了诊断模型的准确性和灵敏性。与训练集和验证集的分析结果相一致。
3.5. 新辅助治疗后，活检标本预测病理性淋巴结受累（yPN）的miRNA特征验证病理性淋巴结受累一直是PDACs术后最重要的预后因素之一，作者为了探讨在治疗前，6个miRNA是否可作为yPN的预测指标，因此，收集了接受治疗后的62例样本（9例ypN阳性，53例ypN阴性），进行预测模型构建。再次成功地证实了风险模型在预测淋巴结转移阳性患者方面的稳健性。在评估风险评分和ypN状态的分布时，作者发现ypN阳性患者的风险评分明显高于ypN阴性患者。在多因素分析中，miRNA表达特征也是yPN的独立风险因素。
是不是看起来很简单啊？？你没有看错，方法就是很简单！！纯属生信分析，文章贵就贵在逻辑严谨性和结果优秀，有价值！！！思路已经给了你，是不是特别心动？？？心动还不快点行动？？？？[1] Nishiwada S, Sho M, Banwait JK et al. A microRNA Signature Identifies Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Patients at Risk for Lymph Node Metastases. Gastroenterology, 2020, S0016-5085(20)30576-X.
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