【直播回放】FocuSCOPE靶向高通量单细胞测序原理及系列产品介绍
“众所周知,肺癌是人类第一大癌,目前各种针对肺癌的靶向药研发非常火热,由于靶向药的使用牵涉到基因突变的检测,因而当前有很多对肺癌相关基因突变的研究。我们新格元针对老师关注肺癌相关基因突变在单细胞方面的研究,开发了肺癌靶向突变基因检测试剂盒,此款试剂盒包含了肺癌中常见的6个基因突变……”
2022年1月7日,新格元“开启靶向捕获新思路 助力单细胞多维度分析”线上课程已圆满幕。本次课程向大家介绍了单细胞靶向技术及新格元两款单细胞靶向检测产品,引起了大家的广泛关注。
错过这次直播的老师们也不要担心,新格元在此特地为大家提供了一个观看通道,扫描下方二维码即可直接观看直播回放。
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问题汇总
Q:
1、FocuSCOPE靶向产品磁珠是否是两类磁珠?
不是,一类磁珠,我们Barcode磁珠上的序列一部分带有poly-T,一部分带有探针。
Q:
2、靶向产品核心优势是什么?
可以实现单细胞层面同时检测转录组和突变,今天给大家介绍的肺癌靶向基因突变检测就是这方面的应用,此外靶向产品是可定制化的,老师根据自己关注的基因或序列进行定制。
Q:
3、你们除了靶向基因的定制化还有其他定制方案吗?
除了靶向高通量单细胞测序,我们还可以对我们的芯片进行定制,我们有高密度芯片,可以实现单次操作捕获更多的细胞。我们新格元立足国内市场,对单细胞技术与应用持续性开发,非常欢迎老师与我们沟通,探讨单细胞技术的开发与应用。
Q:
4、EB病毒项目为什么设置这些基因?
我们选取的五个EB病毒基因可以实现EB病毒生命周期的全覆盖,可以提高EB病毒的检出率,当然如果老师关注其他方面基因,也可个性化定制。
Q:
5、靶向高通量单细胞测序定制,我们只提供基因区域序列信息就可以了吗?
序列信息提供给我们之后,我们研发同事需要进行评估的,比如序列的保守性,序列能否在细胞中正常表达等评估,老师对这方面的需求,我们需要具体项目,具体分析评估。
Q:
6、EBV项目,常规的单细胞转录组测序不能捕获这些基因吗?
常规的单细胞转录组测序基于mRNA 3’端Poly-A结构进行捕获,一方面病毒基因表达量较低,病毒RNA检出率较低;另一方面部分病毒基因表达为非Poly-A结构的RNA,常规单细胞转录组测序无法捕获,这些基因无法进行常规单细胞层面研究;新格元的EB病毒基因检测项目,基于定制的靶向探针磁珠,可对目标RNA进行靶向捕获,突破mRNA结构限制,此外,结合靶向富集文库的构建,可提高病毒RNA检出率。
Q:
7、如果做EBV的单细胞转录组测序,测序深度需要多少呀?
新格元EB病毒基因检测项目,构建两个文库,一个是转录组文库,一个是靶基因富集文库,转录组文库根据细胞捕获数进行测序每个细胞测10000~15000reads也就是1万细胞测PE150约30~45G。靶基因富集文库,我们建议先测10G,预分析,根据情况再进行加测。
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