"亲，收快递！"肠道细菌影响宿主的独特机制被揭示 | 热心肠日报

今天是第1977期日报。

肠菌通过外膜囊泡向肠道和肠外的宿主细胞“发快递”

Journal of Extracellular Vesicles[IF:25.841]

① 设计表达Cre重组酶的大肠杆菌，将其引入荧光报告小鼠体内，利用Cre-LoxP系统来报告细菌外膜囊泡（OMV）在体内转移到宿主细胞中的情况；② 用这些大肠杆菌定植小鼠肠道，发现Cre重组酶诱导的荧光报告基因在肠上皮的多种细胞中表达，包括肠干细胞和粘膜免疫细胞（如巨噬细胞）；③ 还诱导了广泛的肠外组织中的报告基因表达，包括心脏、肝脏、肾脏、脾脏和大脑；④ 因此，细菌OMV可作为生物穿梭系统，向宿主细胞转移功能性生物分子。

Visualizing transfer of microbial biomolecules by outer membrane vesicles in microbe-host-communication in vivo
10-19, doi: 10.1002/jev2.12159

【主编评语】肠道菌群对宿主的影响不仅限于肠道内，也涉及肝脏和大脑等远端器官。细菌释放的细胞外囊泡（EV）或外膜囊泡（OMV）可作为生物穿梭系统，实现细菌与宿主的相互作用。然而，通过OMV将功能性生物分子从肠道菌群转移到单个宿主细胞的体内生理学相关证据还很少。Journal of Extracellular Vesicles近期发表的研究利用Cre-LoxP系统，为细菌通过OMV向宿主肠道和肠外细胞传递生物大分子的过程提供了新证据。（@mildbreeze）

Lancet：肝硬化（综述）

Lancet[IF:79.321]

① 肝硬化在世界范围内广泛流行，可由不同原因导致，如肥胖、非酒精性脂肪肝、高酒精摄入、乙型或丙型肝炎感染、自身免疫性疾病、胆汁淤积性疾病和铁或铜超载；② 肝硬化是在长期炎症后发展起来的，炎症导致健康肝实质被纤维化组织和再生结节替代，进而引起门脉高压；③ 该病由无症状期发展为症状期（失代偿性肝硬化）出现的并发症往往导致住院、生活质量下降和高死亡率；④ 肝硬化的处理主要是针对病因和并发症的治疗，甚至可能需要肝移植。

Liver cirrhosis
09-17, doi: 10.1016/S0140-6736(21)01374-X

【主编评语】近期发表于Lancet的一篇综述讨论了肝硬化及其并发症的疾病负担，病理生理学，诊断和治疗建议。此外指出，面对肝硬化，未来的挑战包括如何更好地筛查早期纤维化或肝硬化，早期识别和逆转致病因素，以及预防并发症。（@临床营养Dr.Chen）

NEJM：Lanifibranor可改善NASH

New England Journal of Medicine[IF:91.245]

① 247例非肝硬化、高度活动性NASH患者随机等分3组，分别每天接受1200mg或800mg的Lanifibranor或安慰剂治疗，为期24周；② 3组的SAF-A评分（疾病程度）降低至少2分且纤维化无恶化的患者比例分别为55%、48%和33%，高剂量组与安慰剂组差异显著；③ 药物组在NASH缓解/无恶化和纤维化逆转/无恶化方面的表现均优于安慰剂组，且高剂量组表现更好；④ 药物组肝酶水平下降，大多数血脂、炎症和纤维化生物标志物水平改善；⑤ 药物安全性良好。

A Randomized, Controlled Trial of the Pan-PPAR Agonist Lanifibranor in NASH
10-21, doi: 10.1056/NEJMoa2036205

【主编评语】Lanifibranor是一种泛PPAR激动剂，可调节非酒精性脂肪性肝炎（NASH）发病机制中的关键代谢、炎症和纤维化途径。NEJM近期报道了一项2b期双盲随机对照试验，检验了Lanifibranor用于NASH治疗的有效性和安全性，结果比较积极，支持在3期试验中进一步检验。（@mildbreeze）

NEJM：非酒精性脂肪肝预后的前瞻性研究

New England Journal of Medicine[IF:91.245]

① 纳入1773名非酒精性脂肪肝病成年患者进行前瞻性研究，按纤维化阶段（F0至F2[无-中度纤维化]、F3[桥接纤维化]和F4[肝硬化]）分为3组，随访中位数4年；② 3组的全因死亡率为每100人年0.32例、0.89例和1.76例；③ 3组的肝脏相关并发症发生率（每100人年）：静脉曲张出血0.00、0.06、0.70，腹水0.04、0.52、1.20，脑病0.02、0.75、2.39，肝细胞癌0.04、0.34、0.14；④ 与F0至F2期相比，F4期患者有更多的2型糖尿病和肾功能衰退。

Prospective Study of Outcomes in Adults with Nonalcoholic Fatty Liver Disease
10-21, doi: 10.1056/NEJMoa2029349

【主编评语】NEJM近期发表的一项美国的前瞻性研究，对非酒精性脂肪肝病不同纤维化阶段的患者进行了多年随访，发现肝脏相关并发症和全因死亡率都随着纤维化的恶化而增加。（@mildbreeze）

肝纤维化人群的肠道菌群特点

Hepatology[IF:17.425]

① 217位西班牙裔受试者中脂肪变性占66.7%，肝纤维化占13.0%；② 肝纤维化受试者的肠道菌群中免疫原性共生菌（如普雷沃菌属）丰度高，而粪拟杆菌、狄氏副拟杆菌、肠杆菌和海藻科丰度少；③ 肝纤维相关宏基因组特征为尿素循环、L-瓜氨酸生物合成、肌酐降解途径、B族维生素和硫辛酸合成发生改变；④ 宏基因组变化与菌群丰度、L-岩藻糖生物合成相关的细菌通路都有关；⑤ 普雷沃菌属的丰度既受饮酒的影响，也与NCK2基因中的单核苷酸多态性呈正相关。

Gut Microbiome Features Associated with Liver Fibrosis in Hispanics, a Population at High Risk for Fatty Liver Disease
10-11, doi: 10.1002/hep.32197

【主编评语】文章旨在探讨受肝纤维化困扰的西班牙裔人群的肠道微生物特点以及功能的改变，试图阐释其背后的环境和基因因素。研究结果显示，伴随肝纤维化的产生，肠道微生物的组成和功能改变，或促发氧化压力和炎症环境。鉴定出的这些微生物指标，和相关基因标志物，可能为肝纤维的干预或疾病模型提供应用参考。（@兵兵）

Cell子刊：肝脏多组学分析揭示遗传、饮食与衰老的联系

Cell Systems[IF:10.304]

① 对来自不同年龄（7至24个月）和饮食（低脂肪或高脂肪）的BXD小鼠群体的58个同基因品系的347 个个体的肝脏进行转录组、蛋白质组和代谢组分析；② 这些数据可以观察基因表达、饮食环境和年龄之间的关系；③ 数百个基因在转录物和蛋白质水平上受到饮食和/或年龄的影响；④ Ctsd和St7与小鼠衰老相关，在秀丽隐杆线虫中敲低其同源基因可缩短寿命；⑤ 稳定回归可以计算受两个或多个独立因果变量影响的关联的因果关系。

Multiomic profiling of the liver across diets and age in a diverse mouse population
10-18, doi: 10.1016/j.cels.2021.09.005

【主编评语】遗传和环境（GxE）因素相互作用，在不同群体中导致代谢表型和寿命的差异。Cell Systems近期发表的这项研究通过对不同年龄、不同饮食、不同基因型的几百只小鼠进行转录组、蛋白质组和代谢组的肝脏多组学分析，以探索GxE和衰老的分子基础，研究与代谢变化相关的基因和通路。（@mildbreeze）

甲硫氨酸酶或可促进健康长寿

PNAS[IF:11.205]

① 随着果蝇年龄的增长，甲硫氨酸（Met）代谢的不同分支的活性发生了显著变化；② 菌群是食物以外的重要的Met替代来源；③ 构建表达Met酶（降解Met的细菌酶）的转基因果蝇发现，该酶的全身性高表达会缩短寿命，而全身或组织特异性的低水平表达可显著延长健康和寿命，发挥与Met限制（MetR）相关的生理作用；④ Met酶表达引起的MetR的延寿作用，与食物中的氨基酸水平无关；⑤ 在阿尔茨海默模型果蝇中观察到与衰老类似的Met代谢重编程。

A genetic model of methionine restriction extends health- and lifespan
09-29, doi: 10.1073/pnas.2110387118

【主编评语】限制甲硫氨酸摄入在一些动物模型中具有促进健康长寿的作用。PNAS近期发表的研究对甲硫氨酸代谢随衰老的改变进行了研究，并在果蝇模型中表明，降解甲硫氨酸的甲硫氨酸酶是延长健康和寿命的潜在药物。（@mildbreeze）

Cell：可根除莱姆病且不扰乱肠道菌群的窄谱抗生素

Cell[IF:41.582]

① 筛选452种放线菌提取物中抗伯氏疏螺旋体（BB，即莱姆病病原体）的物质，发现至少6种选特性抑制物；② 其中吸水链霉菌产生的潮霉素A活性最高，选择性抑制螺旋体生长包括BB及梅毒螺旋体；③ 潮霉素A靶标核糖体，或可通过下调BB周质结合蛋白BmpD转运系统实现选择性抗菌；④ 通过不同小鼠实验发现，潮霉素A可有效清除BB感染且不造成显著肠道菌群失调；⑤ 但潮霉素A如何下调BmpD表达的机制尚不清晰，相关应用还处于临床前期，需审慎对待。

A selective antibiotic for Lyme disease
10-06, doi: 10.1016/j.cell.2021.09.011

【主编评语】广谱抗生素杀菌不但会造成宿主菌群紊乱，还会引发抗生素耐药性风险。Cell发表的文章，重新发现、定义了一种古老的窄谱抗生素潮霉素A的抗莱姆病病原体功能。莱姆病病例在国内相对少见，但是在美国是常见的蜱传病，很大程度上限制了人们的户外生活。（@solo）

生物气溶胶是猪场耐药基因的重要传播途径

Environment International[IF:9.621]

① 粪便样本中耐药基因(ARGs)和移动遗传元件(MGEs)丰度以及空气中ARGs和MGEs浓度皆为冬季高于夏季，高丰度MGEs(Is613)可以增强ARGs在空气环境中的传播；② 在夏季和冬季，猪场中粪便对空气传播细菌的贡献分别为 19.9% 和 59.4%，粪便传播是冬季猪场空气中细菌的主要来源；③ 水平基因转移在冬季猪场空气中起着重要作用，夏季空气样本中ARGs传播可能存在垂直转移；④ Prevotellaceae 、Ochrobactrum可能是空气样本中ARGs的潜在宿主。

Bioaerosol is an important transmission route of antibiotic resistance genes in pig farms
04-14, doi: 10.1016/j.envint.2021.106559

【主编评语】抗生素在猪场扮演的角色更让人值得关注，很多研究表明耐药基因在猪场含量高，传播广，那么耐药基因在猪场主要传播途径有哪些呢？本研究调查了规模化养猪场在冬季和夏季时空气和粪便样本的耐药基因（ARGs）、移动遗传元件(MGEs)和细菌群落的变化,研究了环境因素对空气传播 ARGs 传播的影响，描述了猪场中空气传播 ARGs 的传播途径和控制策略，其研究成果表明气溶胶是猪场耐药基因的重要传播途径。（@刘永鑫-中科院-宏基因组）

感谢本期日报的创作者：mildbreeze，临床营养Dr.Chen，拍了花宝贝，Dr.Smile，楸楸，solo，刘永鑫-中科院-宏基因组

点击阅读过去10天的日报：

点击阅读原文，查看更多热心肠日报的内容