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新毒株点燃下,美国新冠感染日近百万人?!我们需要怎么做?

Dr. Henry Hanson临床科研
2024-09-05

用数据,来辨清事实。
关键词:COVID;KP.3.1.1;新冠病毒;监测

在全球普遍放开的情况下,新冠的主流毒株也越来越趋向一致。美国尽管也已经取消了全面监测,但仍有持续的数据更新,故对其他国家仍有借鉴意义。
本次推送:
1)继续按照每两周更新的频率,报告美国最新的COVID疫情变化 - 新一轮大规模感染
2)Weiland根据废水检测结果,推测最近一周美国每天新增新冠病例高达98.2万人,远超去年;
3)美国新冠检测阳性率高达18.1%,为近两年来最高;
4)2024年美国夏季疫情如此严重,主要是由于JN.1突变株,其发生于S蛋白上的有意义氨基酸突变数是仅次于Omicron突变数的进化。
5)但美国额外死亡人数并没有显著增加;进一步显示了新冠新毒株维持“传染性更强、致死性较弱”特征。


一,美国新冠疫情的最新情况

1,JN.1系在美国和中国都是主流毒株

2024年8月17日,美国CDC更新的数据显示,新一代新冠毒株KP.3.1.1的占比达36.8%,成为最新的赌王;同时,KP.3占比降低到了16.8%,KP.2.3占比为14.4%,LB.1占比14.1%【1】。

(美国新冠病毒最新流行毒株。图源:美国CDC)

从进化看,KP.2和KP.3都是JN.1后代、后者来自于BA.2.82;为Omicron毒株的后代。
尽管BA.2.86及其家族的KP.2、KP.3等新毒株有非常多的突变,且具有明显的传播优势;但由于仍属Omicron突变株大家族,故其临床特点依然是:传染性极强、致病性较弱

(新冠病毒进化数。图源:美国CDC)

2,2024年美国COVID-19夏季病例数远超去年!

检测指标中最早反映疫情变化的是废水中新冠病毒浓度和新冠检测阳性率,这两项指标都显示,美国新冠感染都出于高峰期【2】。

2.1 废水中新冠病毒浓度大幅增长
根据美国CDC报告的废水中新冠病毒监测更新到2024年8月10日的数据【3】,美国废水新冠病毒浓度为8.82(非常高),而6月27日仅为2.59;2023年同期仅为3.92。
结果提示,2024年美国新冠疫情远超2023年同期水平、且已超过去年夏天最严重程度。


2.2 新冠检测阳性率继续增长
仅从美国CDC更新到8月10日的数据显示,最近2周美国新冠病毒检出阳性率稍微增加17.1%(橙线所示),最新一周检出阳性率为18.1%;这也是最近两年来的新高【4】。
(美国新冠死亡(蓝色柱状图)和检出阳性率(橙线)变化。图源:美国CDC)

2.3 新冠占急诊就诊比例稍有降低
这是疫情流行状况的重要指标。美国CDC更新到8月10日的数据显示,最近2周美国新冠感染占急诊就诊比例降低了2.4%(橙线所示)

(美国新冠死亡(蓝色柱状图)和急诊就诊阳性率(橙线)变化。图源:美国CDC)

3,新冠住院人数和病死人数稍有降低

新冠住院和病死人数是疫情严重程度的关键指标,相对比感染、变化时间晚2周左右时间。
美国已经取消对新冠住院患者上报的要求。但根据美国CDC截止到8月10日的抽样模型,过去一周美国因新冠住院人数稍有降低(红线)【5】。
且从6月份开始,美国因新冠住院患者首次超过了之前一年的同期水平;这个变化也与美国目前感染人数超过去年同期相对应。

(美国新冠住院变化。图源:美国CDC)

按照COVID-19病程,这一波新冠疫情最晚的波峰是因新冠感染而病死的人数。持续的病例增加,使得美国因新冠死亡人数较之前一周增长18.7%(蓝色柱状图所示)【4】。
(美国新冠病死人数(蓝色柱状图)变化。图源:美国CDC)

4,美国新冠疫苗的接种率稍微增长

截止到2024年8月10日,美国成年人针对新冠的更新疫苗(针对XBB.1.5抗原)接种率为22.9%【6】,疫苗接种率较前稍有增加。
与此同时,成年人接种流感疫苗的比例为48.2%另有24.9%的老年患者接种了RSV疫苗。
(疫苗接种率)

二,KP.3.1.1突变株,对我们意味着什么?

1,个体对新毒株的免疫活性至关重要

根据2024年发表于新英格兰医学杂志的研究,新冠病毒所致长期后遗症大幅降低,与两个因素相关:28.1%是因为新冠病毒突变株毒力及其他因素造成的,71.9%是由于疫苗接种/既往感染保护了人群【7】。

2,新冠病毒不会停止进化的脚步,KP.3.1.1突变株有更多的突变位点

Eric Topol博士在分析已有数据后指出,KP.3.1.1 在目前所有流通变体中具有最显著的增长优势,证据主要来源于日本佐藤实验室的研究,其将 KP.3.1.1 描述为在源自 JN.1 毒株中、具有最高的免疫逃避能力和传染性的突变株。
KP.3.1.1 突变株的主要突变包括:F 456 L突变、Q493E 突变、S31 缺失【7】。

Eric博士指出,病毒正在不断进化,作为抗原,KP.3.1.1与大流行初期的病毒株之间的距离越来越远。
▼ 下面的抗原距离图反映了这种进化。
JN.1 与臭名昭著的 Omicron BA.1 的距离比 BA.1 与 2020 年和 2021 年的主要变种(祖毒株、D614G、Alpha、Delta、Beta)的距离还要远。KP.3 和 KP.3.1.1. 位于 JN.1 右侧(未显示),距离更远。
所以Eric博士的结论是:尽管人类希望新冠病毒能够消失,但它不会就此止步。在我们先前免疫的选择压力下(无论是感染、接种疫苗还是组合),它会继续找到新的方式来感染和重新感染人类。

Weiland则用一个更为简明的图来展示JN.1毒株的进化。
▼ 如果按照S蛋白上有意义的氨基酸突变数来说,JN.1的突变数仅次于Omicron突变株。
而在Omiron突变发生后,导致了几乎席卷全人类的感染。


3,美国2024年美国的超额死亡人数并没有显著增加。

COVID-19的疾病负担,除了住院/病死等指标,还有一个关键的指标是“超额死亡”。
科学家Weiland在推特(先称X)发布的数据显示,2024年美国的超额死亡并没有大幅增加。


编者按:
简单小结美国新冠疫情的最新特点:
1,新冠病毒已是大流感,即在病死率持续降低的同时、仍因为其突变活跃而导致高感染率;
2,2023年美国因新冠死亡人数为7.6万人,仍大幅高于流感所致死亡人数;
3,对于老年人或免疫力低下人群,及时接种针对新毒株的更新疫苗,仍是重要而必要的手段。

我们会继续保持关注,提供最新的新冠相关科学报告和数据。
也祝您和家人都健健康康!

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参考文献
【1】 https://covid.cdc.gov/covid-data-tracker/#variant-proportions
【2】 https://caitlinrivers.substack.com/p/outbreak-outlook-aug-12
【3】 https://www.cdc.gov/nwss/rv/COVID19-nationaltrend.html
【4】 https://covid.cdc.gov/covid-data-tracker/#maps_positivity-week
【5】 https://covid.cdc.gov/covid-data-tracker/#covidnet-hospitalization-network
【6】 https://www.cdc.gov/respiratory-viruses/data-research/dashboard/vaccination-trends-adults.html
【7】 https://caitlinrivers.substack.com/p/outbreak-outlook-aug-12
【8】 https://x.com/JPWeiland

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美国Healsan Consulting(恒祥咨询),专长于Healsan医学大数据分析(Healsan™)、及基于大数据的Hanson临床科研培训(HansonCR™)和医学编辑服务(MedEditing™)。主要为医生科学家、生物制药公司和医院科研处等提供分析和报告,成为诸多机构的“临床科研外挂”。

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