新鲜出炉!全新一代4D蛋白组技术在临床微量样本分析中的应用测评
随着质谱技术的飞速发展,蛋白质组学技术在临床方向的研究和应用正在成为精准医学新的发展趋势,相关研究成果接连发表在在Cell、Cancer Cell、Nature Communications等一系列高水平期刊上,拥有极其重要的研究价值。
获取生物样本是临床蛋白质组学研究的基础和前提,临床样品来源非常广泛,包括血清/血浆、手术切除的组织样品、穿刺样品、福尔马林固定和石蜡包埋(FFPE)样品以及激光显微切割的组织样品(LCM)等。这些生物样本是病理分子生物学和蛋白质组学研究的重要材料,对肿瘤等疾病研究具有极高的应用价值。
尽管临床样本来源丰富,但是目前临床蛋白质组学的样本主要为血清/血浆或者冰冻组织,而活检、穿刺等操作获得的组织样本往往量很少。样本经过复杂的前处理后不能获取足量的蛋白,进而限制了该类微量样本在多个医学研究领域的应用。
图1. 临床来源微量样本
随着蛋白质组学技术的快速发展,引入离子淌度的全新一代4D蛋白质组学已经成为复杂样本研究的利器,其相关研究成果接连发表。4D新技术在临床微量样本的蛋白质组学分析中的表现同样备受瞩目。根据我们最新的实验测评数据,对于微量的小鼠穿刺样本用传统方法能检测到4047个蛋白,而等量样本基于4D蛋白质组平台可以检测到5349个蛋白,鉴定深度提高30%。
鼠肝FFPE样本的实验数据显示,4D蛋白质组平台在极微量的情况下可以检测3797个蛋白,和传统方法相比,鉴定深度提高35%。除了蛋白鉴定深度提高,4D技术平台还有样本需求量少、重复性高,定量更加准确等诸多优势,为临床微量蛋白质组学的研究和应用带来更多可能。
图2. 微量样本蛋白质组学流程
4D技术微量样本蛋白组分析1. 更少送样量;2. 更高蛋白鉴定深度;3. 重复性好,定量更加准确。
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参考文献
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6. Carolina Moretto Carnielli, et al. (2018) Combining discovery and targeted proteomics reveals a prognostic signature in oral cancer. Nature Communications.
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