软件应用 | Python实现CSV文件的合并与拆分
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Part1引言
CSV
(逗号分隔值文件格式,有时也称为字符分隔值,因为分隔字符也可以不是逗号)是一种通用的、相对简单的文件格式,被用户、商业和科学广泛应用。CSV
最广泛的应用是在程序(软件)之间转移表格数据。
假设有以下场景,张三从Oracle数据库中导出一张数据表格发送给王五,王五使用Stata软件对该表格数据进行计量分析。从数据库中导出的数据可以保存为txt
、csv
、xls
、json
等常见的文件格式,但一般不支持保存为Stata的dta格式,所以张三导出数据库中表格时,选择了Stata支持的csv
格式。
某次计量分析时,王五发现接收到的CSV
文件很大,整个CSV
文件大小约为16GB,数据量达到1500万行,变量有20个以上。遗憾的是,王五的计算机只有16GB内存,如果将这个CSV
文件完整得导入到Stata中进行处理,可能会发生内存不足的报错。
Part2处理大CSV文件的思路
王五与张三沟通后,设计了如下的解决方案:
将这个大
CSV
文件拆分成多个小CSV
文件;依次处理小
CSV
文件,删除不需要的数据,缩减文件大小;将处理后的小
CSV
文件重新合并。
王五用上面的思路处理大CSV
文件,处理得到的CSV
文件大约为1GB,变量8个,数据量为20万行,已经可以用Stata进行分析。
王五乐于分享,他把第1步和第3步的python代码分享给大家。
Part3Python代码
python代码如下(若要测试代码请准备好python3.7环境并安装pandas模块):
类PyCSV中有两个主要的方法:
merge_csv()
,用于合并csv文件split_csv()
,用于拆分csv文件
import pandas as pd
import os
import warnings
warnings.filterwarnings('ignore')
class PyCSV:
def merge_csv(self, save_name, file_dir, csv_encoding='utf-8'):
"""
:param save_name: 合并后保存的文件名称,需要用户传入
:param file_dir: 需要合并的csv文件所在文件夹
:param csv_encoding: csv文件编码, 默认 utf-8
:return: None
"""
# 合并后保存的文件路径 = 需要合并文件所在文件夹 + 合并后的文件名称
self.save_path = os.path.join(file_dir, save_name)
self.__check_name()
# 指定编码
self.encoding = csv_encoding
# 需要合并的csv文件所在文件夹
self.file_dir = file_dir
self.__check_dir_exist(self.file_dir)
# 文件路径列表
self.file_list = [os.path.join(self.file_dir, i) for i in os.listdir(self.file_dir)]
self.__check_singal_dir(self.file_list)
# 合并到指定文件中
print("开始合并csv文件 !")
for file in self.file_list:
df = pd.read_csv(file, encoding=self.encoding)
df.to_csv(self.save_path, index=False, quoting=1, header=not os.path.exists(self.save_path), mode='a')
print(f"{file} 已经被合并到 {self.save_path} !")
print("所有文件已经合并完成 !")
def split_csv(self, csv_path, save_dir, split_line=100000, csv_encoding='utf-8'):
"""
切分文件并获取csv文件信息。
:param csv_path: csv文件路径
:param save_dir: 切分文件的保存路径
:param split_line: 按照多少行数进行切分,默认为10万
:param csv_encoding: csv文件的编码格式
:return: None
"""
# 传入csv文件路径和切分后小csv文件的保存路径
self.csv_path = csv_path
self.save_dir = save_dir
# 检测csv文件路径和保存路径是否符合规范
self.__check_dir_exist(self.save_dir)
self.__check_file_exist(self.csv_path)
# 设置编码格式
self.encoding = csv_encoding
# 按照split_line行,进行切分
self.split_line = split_line
print("正在切分文件... ")
# 获取文件大小
self.file_size = round(os.path.getsize(self.csv_path) / 1024 / 1024, 2)
# 获取数据行数
self.line_numbers = 0
# 切分后文件的后缀
i = 0
# df生成器,每个元素是一个df,df的行数为split_line,默认100000行
df_iter = pd.read_csv(self.csv_path,
chunksize=self.split_line,
encoding=self.encoding)
# 每次生成一个df,直到数据全部取玩
for df in df_iter:
# 后缀从1开始
i += 1
# 统计数据总行数
self.line_numbers += df.shape[0]
# 设置切分后文件的保存路径
save_filename = os.path.join(self.save_dir, self.filename + "_" + str(i) + self.extension)
# 打印保存信息
print(f"{save_filename} 已经生成!")
# 保存切分后的数
df.to_csv(save_filename, index=False, encoding='utf-8', quoting=1)
# 获取数据列名
self.column_names = pd.read_csv(self.csv_path, nrows=10).columns.tolist()
print("切分完毕!")
return None
def __check_dir_exist(self, dirpath):
"""
检验 save_dir 是否存在,如果不存在则创建该文件夹。
:return: None
"""
if not os.path.exists(dirpath):
raise FileNotFoundError(f'{dirpath} 目录不存在,请检查!')
if not os.path.isdir(dirpath):
raise TypeError(f'{dirpath} 目标路径不是文件夹,请检查!')
def __check_file_exist(self, csv_path):
"""
检验 csv_path 是否是CSV文件。
:return: None
"""
if not os.path.exists(csv_path):
raise FileNotFoundError(f'{csv_path} 文件不存在,请检查文件路径!')
if not os.path.isfile(csv_path):
raise TypeError(f'{csv_path} 路径非文件格式,请检查!')
# 文件存在路径
self.file_path_root = os.path.split(csv_path)[0]
# 文件名称
self.filename = os.path.split(csv_path)[1].replace('.csv', '').replace('.CSV', '')
# 文件后缀
self.extension = os.path.splitext(csv_path)[1]
if self.extension.upper() != '.CSV':
raise TypeError(f'{csv_path} 文件类型错误,非CSV文件类型,请检查!')
def __check_name(self):
"""
检查文件名称是否 .csv 结尾
:return:
"""
if not self.save_path.upper().endswith('.CSV'):
raise TypeError('文件名称设置错误')
def __check_singal_dir(self, file_list):
"""
检查需要被合并的csv文件所在文件夹是否符合要求。
1. 不应该存在除csv文件以外的文件
2. 不应该存在文件夹。
:return:
"""
for file in file_list:
if os.path.isdir(file):
raise EnvironmentError(f'发现文件夹 {file}, 当前文件夹中存其他文件夹,请检查!')
if not file.upper().endswith('.CSV'):
raise EnvironmentError(f'发现非CSV文件:{file}, 请确保当前文件夹仅存放csv文件!')
if __name__ == '__main__':
# 测试切分
csv_path = r'E:\simple.csv'
save_dir = r'E:\simple_splited_files'
PyCSV().split_csv(csv_path, save_dir, split_line=10000)
# 测试合并
files_dir = r'E:\simple_splited_files'
save_name = r'merge_simple.csv'
PyCSV().merge_csv(save_name, files_dir)
Part4效果展示
1拆分csv文件
2合并csv文件
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文 | 陈煌杰
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