学习资源分享专题-国内外几十个生信课程带你飞
有些人肯定想说，我现在先放着，等以后需要的时候再拿出来学，就怕以后你忘记现在放着的东西咯，所以趁热打铁吧。
今天我给大家带来的是生信课程学习资料，国内国外大大小小约几十个吧。微信后台回复：qq群资料（或QQ群资料），可获得如图学习资源。本文的国外生物信息学课程就来自下图，其他课程学习资源后面几天的关键词回复都能获得，不过我还是在小标题下面给了对应的链接。
国外生物信息学课程
1.Applied Bioinformatics
授课单位：PennState
http://www.personal.psu.edu/iua1/2015_fall_852/main_2015_fall_852.html
Linux操作的基本命令；生物信息的基本概念及常用的数据格式介绍；常用软件的安装及使用；最后有具体的RNA-seq数据处理例子（可以学习里面的shell脚本和项目工作目录安排）。
推荐指数：❤❤❤❤❤
理由：该教程讲的内容挺全面，适合生信初学者入门学习，极力推荐。
2.Data Analysis for the Life Sciences
授课单位：MIT
http://genomicsclass.github.io/book/
R语言的基本概念及统计基础；介绍Bioconductor用于基因组、转录组、芯片数据及DNA甲基化数据处理的例子。
推荐指数：❤❤❤❤
理由：可以利用该教程系统地学习R中的基础统计知识，教程还附带一本书，讲得好，推荐。
3.361 Division - Scientific Training, Education and Learning
授课单位：TGAC
https://github.com/TGAC/361Division
宏基因组的基本概念、数据库及其数据处理的典型流程；拼接相关方面的基础知识。
推荐指数：❤❤❤❤
理由：宏基因组和拼接这两块，教程中的ppt内容讲得详细。
4.Bioconductor for Genomic Data Science
授课单位： Johns Hopkins University
http://kasperdanielhansen.github.io/genbioconductor/
Bioconductor的安装、相关R包的学习。
推荐指数：❤❤❤
理由：这是Coursera上基因组数据科学系列课程中的一门，可以学习一下。
5.加州大学河滨分校girke教授的教程
授课单位：University of California Riverside
http://girke.bioinformatics.ucr.edu/manuals/mydoc/home.html
R语言的基本操作和Bioconductor；介绍inux基础、NGS生物信息数据分析的。
推荐指数：❤❤❤
理由：右侧网页链接访问不稳定，可以看左边的Bioconductor教程。
6.圣母大学Steven Buechler教授的生物信息学课程
授课单位：University of Notre Dame
http://www3.nd.edu/~steve/
R语言的基础知识。
推荐指数：❤❤
理由：课程比较老，不过可以看看。
7.Biotechnology
授课单位：Columbia University
http://www.columbia.edu/cu/biology/courses/w3034/
DNA、蛋白方面生物和测序基础知识。
推荐指数：❤❤
理由：2011年的课件，但是可以学习学习。
8.MIT的所有生命科学课程目录及部分课件
授课单位：MIT
http://ocw.mit.edu/courses/life-sciences/
生命科学相关内容。
推荐指数：❤
理由：每门课程中都会有部分章节会有PDF，但是课件时间都比较早。跳过没仔细看。
9.以色列特拉维夫大学的一个生物信息小组主页
授课单位：Tel Aviv University
http://acgt.cs.tau.ac.il/group_seminars.php
科研小组的讨论及发表文章记录。
推荐指数：❤
理由：只附有简单的摘要记录，但仍可作为参考的资料，有时间可以看看。至于他们发表的文章，我们应该平时看自己本研究方向的论文比较多，但初学者可以看看，生物信息学的不同的研究方向是怎样的。
10.印度昌迪加尔市微生物技术研究所生物信息学课件
授课单位：Microbial Technology Chandigarh
http://www.imtech.res.in/raghava/slides/
简单地介绍了linux、数据库、perl以及一些生物知识等。
推荐指数：❤
理由：相关内容讲得都比较浅，有几个ppt讲得不错。
11.stephen教授
授课单位；University of Virginia
http://stephenturner.us/edu.html
gene expression, protein-DNA binding, DNA methylation, DNAvariation, and metagenomics.
推荐指数：❤❤❤❤❤
理由：他一个人就是一堆教程，他的主页上链接许多其他在线课程，另外在他的github主页有实用unix一行命令和几个R包的介绍，如果你关注他的Twitter，你会发现非常多的资料。
12.Statistical Genetics
授课单位：University of Alabama at Birmingham
http://www.soph.uab.edu/ssg/courses/archives
5th short course on next-generation sequencing:thechnology and statistical methods
授课单位：University of Alabama at Birmingham
http://www.soph.uab.edu/ssg/nhgri_r25/fifthshortcourse
高通量测序技术，功能基因组，转录组，云计算的基础知识。
5th Short Course on Statistical Genetics and Genomics
授课单位：University of Alabama at Birmingham
http://www.soph.uab.edu/ssg/nigmsstatgen/fifth
基因组学，GWAS，Pharmacogenomics，生物统计、转录组，表观遗传学，宏基因组学的等遗传基因组学基础知识。
推荐指数：❤❤❤❤❤
理由：有视频，老师讲得不错，推荐。
13.bioinformatics.ca汇总
https://bioinformatics.ca/workshops
(1)High-throughput Biology: From Sequence to Networks 2015
https://bioinformatics.ca/workshops/2015/high-throughput-biology-sequence-networks-2015
(2)Introduction to R (2015)
https://bioinformatics.ca/workshops/2015/introduction-r-2015
(3)Exploratory Analysis of Biological Data using R
https://bioinformatics.ca/workshops/2015/exploratory-analysis-biological-data-using-r-2015
(4)Bioinformatics for Cancer Genomics
https://bioinformatics.ca/workshops/2015/bioinformatics-cancer-genomics-2015
(5)Informatics for RNA-seq Analysis
https://bioinformatics.ca/workshops/2015/informatics-rna-seq-analysis-2015
(6)Informatics on High-throughput Sequencing Data
https://bioinformatics.ca/workshops/2015/informatics-high-throughput-sequencing-data-2015
(7)Pathway and Network Analysis of -omic Data (2015)
https://bioinformatics.ca/workshops/2015/pathway-and-network-analysis-omic-data-2015
(8)Informatics and Statistics for Metabolomics (2015)
https://bioinformatics.ca/workshops/2015/informatics-and-statistics-metabolomics-2015
(9)Analysis of Metagenomic Data
https://bioinformatics.ca/workshops/2015/analysis-metagenomic-data-2015
(10)Cancer Data and its Analysis (UK, 2015)
https://bioinformatics.ca/workshops/2015/cancer-data-and-its-analysis-uk-2015
(11)Cancer Data and its Analysis (CCRC 2015)
https://bioinformatics.ca/workshops/2015/cancer-data-and-its-analysis-ccrc-2015
高通量测序、RNA-seq、R语言基础、癌症分析、多组学数据分析、宏基因组、宏代谢组等基础知识。
推荐指数：❤❤❤❤❤
理由：每一块内容知识点讲得都很详细，教程里大都附带视频、ppt、pdf资料，是一个学习的好资源，推荐学习。
14.Sequence Data Analysis Training School
授课单位：Bastiaansen Genetics
http://www.basgen.nl/sdac/downloads.html
linux基础、比对分析、RNA-seq、拼接。
推荐指数：❤❤❤❤
理由：课程按天安排的，共5天，内容比较丰富，值得看。
15.Next Generation Sequencing Course
授课单位；Indiana university
http://compbio.iupui.edu/group/1/pages/next_gen_course
高通量测序原理、数据处理基础知识、DNA-seq、RNA-seq。
推荐指数：❤❤❤❤❤
理由：一个华人讲的课程，课时较长，没有PPT，英语好、有耐心的同学推荐学习一下，讲得还不错。
16.INF - BIO9120 _ fall 2013 _ de _ novo _ assembly
授课单位：the University of Oslo
https://github.com/lexnederbragt/INF-BIO9120_fall2013_de_novo_assembly/tree/master/presentations
拼接。
推荐指数：❤❤❤❤
理由：一共是3个PPT，讲拼接原理到应用，不错，推荐。
17.GLOBEX Bioinformatics
授课单位：University of Delaware
https://www.eecis.udel.edu/~lliao/globex15/handout.html
生物信息基础知识，包括进化分析、基因表达、分析算法等等。
推荐指数：❤❤❤
理由：一共分为11个章节，都有PPT。
18.CSH Genomes
授课单位：Schatzlab
http://schatzlab.cshl.edu/teaching/
基因组拼接、测序技术原理等。
推荐指数：❤❤❤
理由：里面的PPT资源还是挺丰富的。
19.Banana Slug Genomics
授课单位：UCSC
(1)https://banana-slug.soe.ucsc.edu/archive:spring_2015_syllabus
(2)https://banana-slug.soe.ucsc.edu/?idx=archive%3Abioinformatic_tools
香蕉蛞蝓的基因组拼接项目。
推荐指数：❤❤
理由：一个基因组拼接项目，里面还有一些软件使用的说明。
20.Genomics12
授课单位：Die Freie Universität Berlin
http://www.mi.fu-berlin.de/w/ABI/Genomics12
高通量数据分析相关算法、宏基因组、转录组、ChIP-seq。
推荐指数：❤❤❤
理由：一共15个章节，有PPT,另外还有8个小练习。
21.Analysis of Microarray Data
授课单位：The University of Texas MD Anderson Cancer Center
http://bioinformatics.mdanderson.org/main/Education:MicroarrayCourse
芯片数据分析
推荐指数：❤❤❤❤❤
理由：内容很详细
其他国外课程
https://pan.baidu.com/s/1qYQdq4s 密码：7hgo
国内生物信息学课程
北京大学生物信息学公开课
测序中国课程课程资料
中科院生物信息学公共课
等等...
https://pan.baidu.com/s/1miACrsW密码：fz00
生信视频
BioMart:The Linked Dataset-How can I get gene symbols(HGNC symbols) for a list of human variations?https://v.qq.com/txp/iframe/player.html?vid=p13298e3h6l&width=500&height=375&auto=0
本视频介绍了Ensembl Biomart工具的一个功能，即寻找HGNC symbols，我们跟着视频一步一步走，即可完成这部分内容的学习。这里推荐阅读基因ID转换小工具，简单了解一下，注意评论区哦。
小结
这些学习资源都来之不易，希望好好珍惜，好好使用，愿你早日入门生信。非常感谢上海浦东-群主、沈梦圆等人的整理，为我们带来了那么多丰富的生信课程学习资源。另外，如果你那里有非常好的课程学习资源愿意分享，欢迎向我们推荐。有意者请在评论区留言，小编会与你联系。
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