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袁伟时:中国的奴性和戾气从哪里来?

“芯片大学”虚晃一枪,人才断层问题不能跑步解决

两大中国首富双双被重挫-释放信号强烈

民间帝王赖小民和性感女星舒淇与许晴

女性高潮时为什么会“喷水”?

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生信菜鸟团

生物信息数据分析文章就是看图写作文

Tip60,它们虽然都是蛋白质的乙酰化酶,但是它们的CHIP-seq数据表现不一致,仔细看上图就明白了。为什么不一致,就需要解释,解释就需要有生物学背景,比如CBP
2018年1月7日

学习资源分享专题-生信入门

生信最主要是生物学和计算机的综合,相较而言,计算机比生物学难度稍大。这里的入门基础主要针对计算机基础。有,有计算机编程经验,学过C,python等编程语言。没有,纯生物毕业,早年的VB只有印象;
2017年12月17日

学习资源分享专题-网络学习资源—MOOC

9.腾讯课堂:腾讯推出的专业在线教育平台,聚合大量优质教育机构和名师,下设职业培训、公务员考试、托福雅思、考证考级、英语口语、中小学教育等众多在线学习精品课程。https://ke.qq.com/
2017年12月16日

学习资源分享专题-生信人windows电脑必装软件

Everything是一款文件搜索软件,是目前速度最快的软件,几十万个文件可以很快完成索引,文件名搜索瞬间呈现结果。它小巧免费,支持中文,支持正则表达式,可以通过HTTP或FTP分享搜索结果。
2017年12月14日

带你快速入门高通量测序

大家可以看到,干货中囊括了从微生物到植物,从动物到人类的高通量测序大数据分析的相关内容。是不是很吸引人?下文我将手把手大家如何利用这些资料,让你快速入门你所感兴趣的相关领域。
2017年12月13日

学习资源分享专题-数据分析与R语言

广义线性模型是为了解决预测变量或响应变量是非连续变量的问题,如是与否、对与错等变量是无法直接使用线性回归拟合。这时需要将相应的非连续变量转化一个连续的变量,一般是由一个关联函数来转换的。
2017年12月12日

学习资源分享专题-国内外几十个生信课程带你飞

https://github.com/lexnederbragt/INF-BIO9120_fall2013_de_novo_assembly/tree/master/presentations
2017年12月11日

功能数据库专题-GSEA

听上去这个GSEA和GO、KEGG很像,但其实是有本质区别的。常见的转录组高通量分析(Microarray&RNA-seq)都是通过对差异比较之后的表达矩阵设定阈值,例如fold
2017年12月10日

功能数据库专题-DAVID

DAVID是一个生物信息数据库,整合了生物学数据和分析工具,为大规模的基因或蛋白列表(成百上千个基因ID或者蛋白ID列表)提供系统综合的生物功能注释信息,帮助用户从中提取生物学信息。
2017年12月8日

功能数据库专题-reactome

Expression这一项和很多数据库类似,会给出该物种每个器官的表达情况,比如我现在选择的是lung,在右侧的热图中也会被选中,有趣的是还能选择性别,点击第三个小方格图片则会变成人的脑组织。
2017年12月7日

功能数据库-BIOCARTA

假如你想了解通路图中某一个转录因子的更多信息,这时候你可以用鼠标点开对应的因子。这次我以图中的P53因子为例:点开后第一栏,首先可以看到一系列与P53相关的序列ID,然后还有相对应数据库的链接。
2017年12月6日

功能数据库专题-KEGG

differentiation”信号通路的名称为map04659,如果点击“map04659”,那么会进入详情页,最下面会有绘制此信号通路时所参考的文献列表,对进一步理解信号通路很有帮助。
2017年12月5日

功能数据库专题-GO数据库

GO工作,基本来说,可分为三个不同的部分:第一,给予和维持定义;第二,将位于不同数据库中的本体论语言、基因和基因产物进行联系,形成网络;第三,发展相关工具,使本体论的标准语言的产生和维持更为便捷。
2017年12月4日

转录组之BodyMap

database,链接:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC102396/】,发表日期:2000年,what
2017年12月3日

转录组之GTEx

expression,即主要由两条同源染色体中的一条进行转录)水平似乎较高,而大脑组织中却不存在等位基因特异性表达。有趣的是,与转录本总丰度相比,不同组织之间的等位基因特异性表达水平似乎更加保守。
2017年12月2日

转录组之芯片异同

http://www.biotrainee.com/thread-2011-1-1.html
2017年12月1日

【直播】我的基因组(七):从整体理解全基因组测序数据的变异位点

"查看了几份资料,还是健明师兄这个写的比较详细,这就是今晚的变异位点版块啦,一起学习~".replace(/\r/g,"").replace(/\n/g,"").replace(/\s/g,"
2017年11月30日

转录组专题-WGCNA分析

Coefficient为0.8的两个基因与Coefficient为0.79的两个基因是有显著差别的,但是以上算法却无法避免这一处境,WGCNA采用了一种基于软阈值的判定方法很好地避免了这一问题。
2017年11月29日

转录组专题-融合基因

ph染色体应该是人类结缘融合基因的开始,ph染色体是由于9号和22号染色体的两个片段相互重排拼接后的变异22号染色体,大多数情况下,其上会有一个在诊断和治疗CML都很有意义的融合基因BCR-ABL。
2017年11月28日

转录组专题-可变剪接

许多疾病的发生往往也是由于可变剪切的错误调节引起的。有些剪接产物特异性表达于癌性组织,可以作为疾病的生物标记,也可以作为疾病治疗的靶目标。与疾病相关的几种典型剪接变异:
2017年11月27日

数据库专题之TCGA

portal.gdc.cancer.gov,经过了简单的合并,将每种癌症相同类型的数据合并到了一个文件中(例如443个胃癌样本的RNA表达量数据都合并到了一个文件中,非常适合用R进行后续的分析)
2017年11月19日

遗传资源数据库之 COSMIC

该网站专注于以图形方式呈现复杂的表型特异性突变数据。数据取自选定的基因,最初在癌症基因普查中,以及PubMed的文献检索。
2017年11月18日

遗传资源数据库专题-UK10K

10K计划得以获得罕见突变与广泛疾病的关联,并发现了一些与基础疾病有关系的新基因突变。基于这个基因组测序结果,一系列分析数据及相关疾病应用的学术成果先后发表于《Nature》、《Nature
2017年11月17日

遗传资源数据库专题-ESP6500

1.首先进入ESP官网,网址:http://evs.gs.washington.edu/EVS/,可以看到它包含主页在内的七个版块
2017年11月16日

遗传资源数据库专题-EXAC

Consortium,外显子组整合数据库),该数据库旨在汇总和协调各种大规模测序项目的外显子组测序数据,并为更广泛的科学界提供摘要数据。
2017年11月15日

遗传数据库专题-hapmap

是的,hapmap数据库已经无法在NCBI上打开了,浏览器键入hapmap.org,显示的是NCBI撤销hapmap数据库的通知,连带的还讲述了如此做的原因:长江后浪推前浪,hapmap死摊上。
2017年11月14日

遗传资源数据库之1000genomes

第三个先导项目通过对700人的1000个基因外显子的测序,获得了占人类基因组全部序列2%的蛋白质编码基因名录。前所未有的大样本量有助于研究人群罕见变异的表达图谱。
2017年11月13日

变异形式专题-SV

变异是一个相对的概念,只有在彼此的比较中才有存在的意义。目前关于人类基因组变异的讨论,都是以“人类基因组计划”中所组装出来的人类基因组作为参照物。人类基因组上的变异主要分为三大类:
2017年11月12日

变异形式专题-INDEL

计算过程主要包含3步:(1)潜在的indel的探测;(2)通过局部重匹配计算基因型的似然值;(3)基于LD连锁不平衡的基因型推断和检出识别。Indel在X,Y染色体上没有检出值得出。
2017年11月12日

变异形式专题-CNV

MB的DNA片段的变异,在人类基因组中广泛分布其覆盖的核苷酸总数大大超过单核苷酸多态性(单核苷酸多态性,SNP)位点的总数,并就CNV在动物基因组中的研究进行了展望
2017年11月11日

变异形式专题-SNV

这是一个更复杂的事件,其中一个或多个碱基被一个或多个碱基取代,其中所鉴定的等位基因的长度与参考不同(即涉及插入或删除)。基本上,这种类型代表了不能在其他四个类别中表示的变体。一个例子可以是AAA->
2017年11月9日

变异形式专题-SNP多态性

单核苷酸多态性(SNP)的密度可以通过微卫星DNA进行预测。AT微卫星是单核苷酸多态性(SNP)密度有效的检测方式,在单核苷酸多态性(SNP)显著降低及较低GC含量的区域,AT出现大片重复。
2017年11月8日

变异形式专题-基因结构

真核细胞的基因和原核生物一样都有编码区、非编码区,在非编码区都有调控遗传信息表达的核苷酸序列。但是其与原核细胞的基因结构已经有了很大的差异,真核生物的基因存在的很多的冗余序列和复杂的调控序列。
2017年11月7日

变异形式专题-参考基因组

(1)打开网址:https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html#;点击“species”(如下图)或者点击红色框中的图片,再输入基因序列号即可查找到序列:
2017年11月6日

组学专题-代谢组学

如果你生信基本技能已经入门,需要提高自己,请关注上面的生信技能树,看我们是如何完善生信技能,成为一个生信全栈工程师。
2017年11月4日

组学专题-蛋白质组学

IDEntifications的数据库。主要包含蛋白质和多肽(另有转录后修饰信息)的记录信息,同时包含支持这些记录的质谱信息。简而言之就是一个质谱数据库,每个蛋白质都附有试验方法的描述,pubmed
2017年11月3日

组学专题-微生物组学

从技术层面来讲,微生物组学与基因组学一样基于基因测序,目前,基因测序的仪器及耗材主要被美国的几大仪器生产商所垄断;中游都为测序服务,并构建相应的数据库,但是下游却并不完全相同。
2017年11月2日

组学专题-表观基因组学

被甲基化修饰后,影响其对环境的胁迫应答。由于植物的分生组织产生生殖细胞,所以在形成分生组织前的表观遗传可直接传递给后代。非生物的逆境胁迫,如盐,干旱,热,抗生素等,都会引起甲基化水平的改变
2017年11月1日

组学专题-表观基因组学

被甲基化修饰后,影响其对环境的胁迫应答。由于植物的分生组织产生生殖细胞,所以在形成分生组织前的表观遗传可直接传递给后代。非生物的逆境胁迫,如盐,干旱,热,抗生素等,都会引起甲基化水平的改变
2017年11月1日

组学专题-转录组学

基因共表达网络是基于基因间表达数据的相似性而构建的网络图,图中的节点代表基因,具有相似表达谱的基因被连接起来形成网络。通过构建基因共表达网络,可以深入探讨基因间的相互作用关系并挖掘核心基因(hub
2017年10月31日

生信菜鸟团-专题学习目录(2)

如果你生信基本技能已经入门,需要提高自己,请关注上面的生信技能树,看我们是如何完善生信技能,成为一个生信全栈工程师。
2017年10月31日

组学专题-基因组学

markers)组成的图谱,而不是通过分析重组事件得到的。通过遗传学图谱,可以建立基因组中每个染色体的物理学图谱。此外,在缺乏完整的序列信息的情况下许多不同的技术已经被用于建立物理学图谱。
2017年10月30日

测序数据质量控制之CHIPQC

2.http://bioinformatics-core-shared-training.github.io/cruk-bioinf-sschool/Day4/chipqc_sweave.pdf
2017年10月29日

测序数据质量控制之RSeQC

PYTHONPATH=/home/jmzeng/my-bin/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/:$PYTHONPATH然后几分钟就出结果啦
2017年10月28日

测序数据质量控制之fastx Toolkit

piRNAs。最近一次更新在2014年(不符合现在的发展速度),可能有些新的软件会更快更好(比如seqtk之类)。无论如何,此番介绍旨在让大家简单地操作fastq文件,fastx
2017年10月27日

测序数据质量控制之Trimmomatic

的过程,不会改变reads序列本身,这话没毛病。这时候就轮到trimmomatic登场了。Trimmomatic是一个主要针对Illumina测序的reads修剪和过滤的软件,包括paired
2017年10月26日

测序数据质量控制之sickle

需要fastq格式的输入文件,然后会输出经过修剪的fastq文件。在可选择的参数中,我们可以改变修剪所设定的read的长度和质量控制的标准,或者禁用5'修剪并使能够切掉含有多个Ns的顶端序列。
2017年10月25日

测序数据质量控制之cutadapt

report.txt本条命令和上一条命令效果一样,会在Read的3'端进行序列为AACCGGT的adapter序列搜索并将其修剪,不同的是本次的修剪报告会导入到report.txt文件中。
2017年10月24日

测序数据质量控制之FastQC

3.批量显示QC结果的利器(http://fbb84b26.wiz03.com/share/s/3XK4IC0cm4CL22pU-r1HPcQQ1iRTvV2GwkwL2AaxYi2fXHP7)
2017年10月23日

浅谈Blast&Blat

能够实现比较两段核酸或者蛋白序列之间的同源性的功能,它能够快速的找到两段序列之间的同源序列并对区域进行打分以确定同源性的高低。Blast的运行方式是先用目标序列建数据库(这种数据库称为
2017年10月22日

vcf格式,略略略~~

AC=1;AF=0.50;AN=2;DB;DP=18;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.16;MQ=95.26;MQ0=0;QD=1.66;SB=-0.98
2017年10月21日

纳米孔测序技术

纳米孔测序技术(又称第四代测序技术)是最近几年兴起的新一代测序技术。目前测序长度可以达到150kb;目前市场上广泛接受的纳米孔测序平台是Oxford
2017年10月21日

NGS数据格式之bed

Feature在chrom中的起始位置(前坐标),chrom的第一个碱基的坐标是0,chromStart如果等于2,其实表示的是第三个碱基,feature包含这个碱基
2017年10月20日

NGS数据格式之Bigwig/Wiggle

Wiggle:简写为wig,表示基因组上一个区域的信号,可以上传至UCSC上进行可视化。而wig文件也是和BED文件类似的包含区域信息的文件,一般使用MACS峰值探测后可以产生wig格式的文件。
2017年10月19日

NGS数据格式之gff/gtf

类型,此处的名词是相对自由的,建议使用符合SO惯例的名称(sequenceontology),如gene,repeat_region,exon,CDS等。
2017年10月18日

浅谈SAM格式

当测序后生成的fastq文件比对到到基因序列后,通常会生成一个sam或者bam为扩展名的文件。由于生信分析中,大部分分析都是基于sam格式进行的分析,所以今天我就带大家深入学习一下SAM格式的文件。
2017年10月17日

入门生物信息,门在哪?

是一个常用的网站,对于生物信息工作者来说biostar是一个非常好的论坛。如果我们想在某个特定的网站进行搜索的话,你可以在搜索内容之后加上site:*.com*,你得到的答案就全部来自这个网站了。
2017年10月16日

测序之pacbio

如果把拼接工作看作是在做拼图游戏。NGS获得的读长都很短,就好象把一幅图打成非常小的碎片,然后做拼图。由于碎片太小,因此许多碎片看起来都差不多,这样要拼出一副完整的图难度很大。PacBio
2017年10月14日

测序平台之Ion Torrent

每个芯片都会有一个进口,还会有一个出口,是走液流用的。在测序珠子上机的时候,就从进口把珠子的混悬液注入到芯片上,然后再把这个芯片离心一下。离心的作用,是更好地把珠子卡到小孔中去。
2017年10月13日

SOLiD测序原理

adapter结合的引物和磁珠。其中,表面固定着大量P1引物的磁珠被称为P1磁珠。P1引物固定在P1磁珠球形表面,PCR反应过程中,磁珠表面的P1引物可以和变性模板的P1
2017年10月12日

illumina测序的化学原理

以Q30为例,Q30代表碱基可信度为99.9%,那么其被误判的几率就是0.1%,于是-10*lg(0.1%)=30。也就是说,如果一个碱基测序的可信度为99.9%,就代表其达到了Q30质量标准。
2017年10月11日

测序平台专题-罗氏454测序平台

http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=201103&do=blog&id=312599
2017年10月10日

中心法则六十年:克里克改变了现代生物学

克里克可以理解地无法预测这些衔接子分子的性质,但是他觉得它们可能含有核苷酸,这些核苷酸能与蛋白质合成的DNA和RNA位点配对。即使允许,他还没有完全掌握核糖体RNA的作用,克里克的眼光令人惊讶的是:
2017年10月10日

带你走进Sanger测序的世界

在Sanger测序期间,DNA聚合酶通过向生长链(延伸产物)中加入核苷酸来复制单链DNA模板。链延长发生在引物的3'端,通过与模板的碱基对互补来选择加入到扩增产物中的脱氧核苷酸。
2017年10月9日

生信菜鸟团-专题学习目录

如果你生信基本技能已经入门,需要提高自己,请关注上面的生信技能树,看我们是如何完善生信技能,成为一个生信全栈工程师。
2017年10月9日

逆转录

转座子中。而逆转录过程中形成的U3/R/U5区域正好是一类常见的LTRs,大多数重复序列预测分析软件也是基于这一区域的序列特征实现的。
2017年10月8日

Paired-end Reads

Paired-end方法是指在构建待测DNA文库时在两端的接头上都加上测序引物结合位点,在第一轮测序完成后,去除第一轮测序的模板链,用对读测序模块(Paired-End
2017年10月8日

中心法则之翻译

能特异地识别mRNA模板上起始密码子的tRNA叫起始tRNA,其他tRNA统称为延伸tRNA。原核生物起始tRNA携带甲酰甲硫氨酸(fMet),真核生物起始tRNA携带甲硫氨酸(Met)。
2017年10月7日

中心法则专题-NGS与转录

是遗传信息由DNA转换到RNA的过程,即信使RNA(mRNA)以及非编码RNA(tRNA、rRNA等)的合成步骤。在NGS的促进下,研究转录和转录调控的技术有了极大的扩展,以空前的速度发展。
2017年10月6日

DNA复制

需要引物:DNA聚合酶必须以一段具有3'端自由羟基(3'-OH)的RNA作为引物,才能开始聚合子代DNA链。RNA引物的大小,在原核生物中通常为50~100个核苷酸,而在真核生物中约为10个核苷酸。
2017年10月5日

中心法则-RNA

lncRNA可通过折叠形成一定的空间结构与多种蛋白互作,也可通过碱基互补配对与其它核酸进行识别,这种识别又可将蛋白引导至特定序列位点,这些特点使得lncRNA在发育和癌症中的功能发挥得更加丰富。
2017年10月4日

中心法则-蛋白质

蛋白质相互作用和细胞中涉及的途径对于获得基因组的整体上的功能很重要。运用所得到信号和代谢途径,我们将可以可视化生物合成。通路将用于检查基因在特定生物系统中预测好坏的程度。路径分析中的主要工具如下:
2017年10月3日

中心法则专题-DNA

中心法则经常遭到误解,尤其与遗传信息“由DNA到RNA到蛋白质”的标准流程相混淆。有些与标准流程不同的信息流被误以为是中心法则的例外,其实朊病毒是中心法则现时已知的唯一例外。
2017年10月2日

中心法则-蛋白质

蛋白质相互作用和细胞中涉及的途径对于获得基因组的整体上的功能很重要。运用所得到信号和代谢途径,我们将可以可视化生物合成。通路将用于检查基因在特定生物系统中预测好坏的程度。路径分析中的主要工具如下:
2017年10月2日

名词package

以上为我大论文致谢中的一部分。别的加了一些具体的人名,我不告诉你~~但是真的是“遇见你们,没有遗憾和可惜”~~1,2,3:唱!以上是我的胡言乱语!
2017年10月1日

OMIM数据库

Man(OMIM)。意为在线《人类孟德尔遗传》,是持续更新的、关于人类基因和遗传紊乱的数据库。它主要着眼于可遗传的或遗传性的基因疾病,包括文本信息和相关参考信息、序列纪录、图谱和相关其他数据库。
2017年9月30日

NGS基础概念-depth and coverage

需要提供捕获的区域,为bed格式,如果是agilent的全外显子可在其官方网站下载,-ct1代表至少覆盖1X的区域,-ct10代表至少覆盖10X的区域,你可以自己添加自己想要的深度。
2017年9月29日

二代测序的barcode/index

核酸序列数据是以“A、T、G、C”碱基顺序表示,而其数量的大小可以使用k、M、G等单位来表示,k代表103、M代表106、G代表109,例如,人全基因组大小为3G(或3Gb),也就是3X109b。
2017年9月28日

浅谈FastQ和FastA格式

“!”(0+33)到“I”(40+33)。以上是sanger中心采用记录read测序质量的方法,Illumina起初没有完全依照sanger中心的方法来定义测序质量,而是把P换成了p/(1-p).
2017年9月27日

De Novo sequencing vs resequencing

后续可选择的分析:全基因组关联研究(GWAS)旨在寻找与某些表型相关的SNP。主要用于检查不同个体的许多常见遗传变异体,并鉴定其相关的特定性状,例如主要疾病的遗传特定性状。
2017年9月26日

浅谈RPKM,FPKM,RPM,TPM的区别

FPKM和RPKM的区别就是一个是fragment,一个是read。对于单末端测序数据,由于Cufflinks计算的时候是将一个read当做一个fragment来算的,故而FPKM等同于RPKM。
2017年9月25日

Nr,GenBank, RefSeq, UniProt 数据库的异同

是一个有来自于70,000多种生物的核苷酸序列的数据库。每条纪录都有编码区(CDS)特征的注释,还包括氨基酸的翻译。GenBank属于一个序列数据库的国际合作组织,包括EMBL和DDBJ。
2017年9月23日

pubmed

Medicine)最重要的书目文摘数据库,收录了全世界70多个国家和地区的5000余种生物医学期刊,书目文摘条目1500万余条,时间起自1966年。标有[PubMed
2017年9月22日

基础数据库之dbSNP

NCBI里对所有提交的snp进行分类考证之后,都会给出一个rs号,也可称作参考snp,并给出snp的具体信息,包括前后序列,位置信息,分布频率等,应该说用这个rs号是比较容易确定搞明白的。
2017年9月21日

NCBI数据库专题之Taxonomy

2.Download:包含完整的分类数据库以及将核苷酸和蛋白质序列记录并与其分类标识相关联的文件,详细信息可以查看taxdump_readme.txt和gi_taxid.readme文件。
2017年9月20日

带你认识GEO数据库

urlopen("https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc={}".format(geo))
2017年9月19日

浅谈Entrez ID

Tool的ID列表,如有AGILENT_ID、BGD_ID、ENSEMBL_GENE_ID、ENTREZ_GENE_ID、GENEBANK_ACCESSION等,截止2017.09共计有30种。
2017年9月18日

一文看懂NCBI的refseq

NM开头的表示标准序列,XM表示预测的蛋白编码序列,NR_表示非编码蛋白的mRNA序列,AF开头的表示克隆序列,BC开头的表示模板序列,它的ID前缀的解释表格如下;
2017年9月7日

将军笔记之基本统计

要想一次对分组返回多个统计量,要是用by()函数,格式为:by(data,INDECES,FUN),data是数据框或矩阵,INDECES是因子或因子组成的列表,用于定义分组;FUN是任意函数。
2017年8月1日

将军笔记之绘图

因为要用到vcd包中的Arthritis数据集,所以先载入vcd包。此处提示在载入vcd包之前先要载入grid包,照做。(那个提示是告诉你R自动载入了grid包,不是要你载入grid包。好傻...)
2017年7月31日

将军之高级数据管理

由于不同学科之间分数差别很大,不宜直接计算各科总分和平均分,因此用scale(roster[,2:4]),将roster数据框中的2-4列转为标准正态分布下的标准分;(scale按列处理)
2017年7月30日

将军笔记之数据管理

#所有行,6-10列,注意冒号的用法,是产生6,7,8,9,10,而c()函数,把这五个数变成向量(其实6:10生成的本来就是向量,这里不用c()函数也可以的)。还可以指定向量名称:myvar
2017年7月27日

将军笔记之图形初阶

boxplot(wt,horizontal=TRUE,axes=FALSE) 这个图画在上面那个图指定的矩形区域中;终于以注意这里的horizontal=TURE选项用来表示这个箱形图是横着的;
2017年7月26日

将军笔记之创建数据集

可以看到,数据框,就是把几个向量用data.frame()函数结合到了一起。注意产生的数据框已经自动加上了列名,列名即是结合的向量的名字。每一列只能有一种数据模式,但是不同列的数据模式可以不一样。
2017年7月25日

将军的R语言介绍

sink("filename")将输出重定向到文件filename中,使用append=TRUE追加,split=TRUE将输出同时发送到屏幕和文件。sink()不加参数输出到屏幕;
2017年7月24日

转录组入门(2):读文章并拿到测序数据

(RIP)-seq本次入门不考虑。在这里我们也用到了循环,为方便大家理解,可以试一下下面这个简单的代码:for
2017年7月10日

你值得拥有的测序名解

假如有1百万个reads映射到了人的基因组上,那么具体到每个外显子呢,有多少映射上了呢,而外显子的长度不一,那么每1K个碱基上又有多少reads映射上了呢,这大概就是这个RPKM的直观解释。
2017年6月21日

转录组学小组开始招人啦——快到碗里来

这里有小白有大神,你可以和大家尽情交流,获得JIMMY等大神的帮助,也许你是大神,也许你是刚入门的小白,现在的你在什么位置都不重要,重要的是你往什么方向走。只要你想学习,有兴趣学习,都可以加入!
2017年6月9日