中国大学MOOC的生物信息学之华中农业大学
我们首先在生信技能树分享了：中国大学MOOC的生物信息学公开课之河南科技大学 不知道学习的朋友多不多，反正留言参与推进高校生物信息学课程改革的朋友很少。
确实各大高校的课程设置，跟不上生物信息学的发展速度啊！这两天我会把全部中国大学MOOC的生物信息学课程搬运过来推荐给大家，如果确实有需要的朋友，可以查漏补缺，适当看一看。但是我们的重点是讨论一下新时代的生物信息学课程设置，不应该是这样的泛泛而谈的生物信息学认知课。
我这里起一个头，我希望高校可以开设的课程包括；
肿瘤数据库之TCGA计划（希望可以介绍NGS技术在肿瘤学的应用，TCGA计划的来龙去脉，数据背后的生物学认知革命）
实用生物信息学统计大全（包括差异分析，富集分析，GSEA，WGCNA，GSVA等等）
生物信息学图表绘制课（各种NGS组学数据下游分析图表展示示例讲解）
其它待你补充哦
今天我们推荐的是华中农业大学的生物信息学课程
https://www.icourse163.org/course/HZAU-1205902809
课程前言
本课程在原国家级精品课程、国家级精品资源共享课《生物信息学》基础上转型升级，是一门生命科学领域和信息科学领域的应用型交叉学科。课程共分为八章，分别是生物信息学概要、生物信息学数据库、生物信息学数据库检索、系统演化分析、基因分析和基因组注释、蛋白质分析、基因组浏览器、生物信息学其他应用。通过本课程的学习，可以培养学员具有生物信息学方面的理论基础和基本技能，能够运用所掌握的生物信息学理论、方法和技术初步解决科研和实际工作中生物信息的存储、检索、分析和利用的问题。本课程不仅有理论讲授，更有大量操作视频，并辅以在线互动答疑和其他相关资料。
课程目录
第一章 生物信息学概要
1.1 生物信息学发展
1.2 生物信息学基本方法和技术
1.3 生物信息学研究内容
1.4 生物信息学应用
第二章 生物信息学数据库
2.1 核苷酸数据库
2.2 蛋白质数据库
2.3 其他数据库及数据提交
第三章 生物信息学数据库检索
3.1 关键词为基础的数据库检索
3.2 序列对位排列分析原理
3.3 序列为基础的数据库检索
第四章 系统演化分析
4.1 多序列对位排列
4.2 系统演化分析
4.3 MEGA应用
第五章 基因分析和基因组注释
5.1 编码蛋白质基因预测
5.2 非编码RNA基因预测
5.3 基因结构分析
5.4 miRNA及靶基因预测
5.5 ENCODE
第六章 蛋白质分析
6.1 蛋白质性质和结构分析
6.2 膜蛋白分析
6.3 蛋白质翻译后修饰分析
6.4 蛋白质亚细胞定位分析
第七章 基因组浏览器
7.1 UCSC基因组浏览器
7.2 Ensembl基因组浏览器
7.3 代表性模式生物数据库
7.4 代表性农作物数据库
第八章 生物信息学其他应用
8.1 芯片表达谱及RNA-seq应用
8.2 ChIP-seq技术及应用
8.3 Galaxy应用
8.4 GEO数据库应用
8.5 CRISPR gRNA设计
8.6 Primer设计
8.7 限制性核酸内切酶切割位点分析
8.8 测序在组学中的应用
可以看到，基本上是围绕着生物信息学早期概念而展开的，现在流行的NGS测序，以及各种的组学技术都没有涉及。
参考资料
Bioinformatics: A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins (Third edition). New York: Wile-Interscience. 2004.
NCBI Education. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/home/learn/
EMBL-EBI. https://www.ebi.ac.uk/
樊龙江。生物信息学。浙江大学出版社，2017。
Mayer B。组学数据生物信息学：研究方法与实验方案（导读版）。科学出版社，2013。
李霞 雷健波 李亦学。生物信息学（第二版）。人民卫生出版社，2015。
我特意翻了一下大家推荐的教程，发现里面的章节课后习题有点渗人！
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