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广州超算研究团队针对新型冠状病毒的老药新用研究

陈品 唯信计算 2022-06-15
武汉加油!
随着武汉新型冠状病毒2019-nCoV疫情暴发及进一步扩散,每天不断增长的一串串数字时刻揪动着全国人民的心。这是一场和时间赛跑的战争,抗击冠状病毒全国在行动。中山大学广州超算联合药学院相关研究团队根据最新公布的新型冠状病毒2019-nCoV水解酶(Mpro)高分辨率晶体结构,利用自主研发的星光超算应用平台上集合传统统计、高通量计算、及最新AI方法的新药筛选平台,在“天河二号”超级计算机上重点针对已上市药物进行虚拟筛选,发现了多种可能起作用的潜在药物,给出了所筛选的30种潜在药物列表,包括六种此前未见报道的药物


2019-nCoV Mpro晶体结构

根据筛选的药物列表,中山大学附属第三医院感染科专家及临床药师结合多年临床经验,提示以下药物可能对临床治疗有帮助:
1、盐酸缬更昔洛韦片

临床用于巨细胞病毒(CMV)的治疗。

2、常见HIV治疗药物

包括洛匹那韦(目前诊疗方案推荐克力芝的主要成分,据临床初步观察有效)、沙奎那韦、茚地那韦、地瑞那韦、替拉那韦、奈非那韦等。

3、特利加压素

可用于消化道出血、难治性腹水及肝肾综合征的常用药物,重症病人抢救有可能有效。

4、其他临床常用药

有抗凝药哒比加群酯、改善静脉淋巴管药物地奥司明、抗肿瘤药拉帕替尼及雷替曲塞。
其中六种此前未见报道:苯赖加压素、特利加压素、地奥司明、哒比加群酯、拉帕替尼以及雷替曲塞,希望对临床救治有所启示。

附表:2019-nCoV水解酶(Mpro)药物虚拟筛选结果,其中6种(蓝色底)为此前未见报道的潜在药物。

基于超算的药物虚拟筛选一方面能够加快新药研发,另一方面在传染病爆发期能够帮助人们选择老药以新用。我们一直在努力提升基于超算的药物虚拟筛选平台的可用性和有效性,希望对抗击疫情有所帮助。未来,我们会持续更新基于天河二号相关药物及化合物筛选结果,供大家参考,欢迎科研、临床专家参与探讨与合作研究实验。

若您正在开展抗新型冠状病毒药物的设计与研发等工作,需要借助最新超算研究手段与药物筛选平台,需要算力、数据资源等,欢迎联系我们,邮箱:pin.chen@nscc-gz.cn。

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