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高通量测序及后续高级分析服务

七师兄 生信之家 2022-04-16


随着后基因组时代的来临及高通量测序技术的发展,基础实验已经远远不能满足生物医药方向的研究,大量的样本被用来做高通量测序。但原始的测序数据及标准分析结果并不能直接获得关键结论,因此必须进行生信高级个性化分析。


转录组测序和宏基因组测序是现阶段应用最广泛的高通量测序类型。医药加平台推出高通量测序实验及后续高级分析业务,协助科研人员对数据进行深度挖掘并提供结论。


医药加的分析特色:

1、分析结果+分析结论: 基于您的分析目的和需求,提供分析方案和分析结果。还可以结合您的研究方向提供分析结论(比如与研究方向最相关的5~10个基因及关键通路)


2、测序实验+高级分析: 测序实验+标准分析+高级分析无缝衔接,节省成本,高效、优质的解决问题。


 

1、转录组测序

包括:RNA-seq测序、lncRNA-seq测序及miRNA-seq测序。


常见的分析设计有:

两组比较分析(比如癌症vs癌旁,治疗前vs治疗后,基因敲除前vs敲除后);

三组比较分析(比如 正常组 vs 疾病组 vs 疾病治疗组);

四组及以上比较分析(时间序列分析或浓度序列分析)等


分析的基本思路流程图如下:

分析结果示例图:

数据预处理分析(表达箱式图和Venn图分析)


 

功能富集分析(GO分析和KEGG PATHWAY分析)


 

时间序列表达趋势分析及热图分析


 

蛋白互作网路分析及转录调控网络分析


 

关键mRNA(或lncRNA)的预后及表达预测分析



2、宏基因组测序

包括:宏全基因组测序、16S/ITS靶基因测序、功能基因测序等。


常见的分析设计有:肠道菌群分析、土壤环境分析、水环境微生物等。


分析基本思路流程图如下:

 

分析结果示例图:

 

多样性分析曲线图

 

聚类树与组分图结合分析

 

属水平下各样本丰度的heatmap



PCA分析


 

Lefse分析


 

服务咨询

医药加范老师, 15301721511 (手机,微信号)



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