高通量测序及后续高级分析服务
随着后基因组时代的来临及高通量测序技术的发展,基础实验已经远远不能满足生物医药方向的研究,大量的样本被用来做高通量测序。但原始的测序数据及标准分析结果并不能直接获得关键结论,因此必须进行生信高级个性化分析。
转录组测序和宏基因组测序是现阶段应用最广泛的高通量测序类型。医药加平台推出高通量测序实验及后续高级分析业务,协助科研人员对数据进行深度挖掘并提供结论。
医药加的分析特色:
1、分析结果+分析结论: 基于您的分析目的和需求,提供分析方案和分析结果。还可以结合您的研究方向提供分析结论(比如与研究方向最相关的5~10个基因及关键通路)
2、测序实验+高级分析: 测序实验+标准分析+高级分析无缝衔接,节省成本,高效、优质的解决问题。
1、转录组测序
包括:RNA-seq测序、lncRNA-seq测序及miRNA-seq测序。
常见的分析设计有:
两组比较分析(比如癌症vs癌旁,治疗前vs治疗后,基因敲除前vs敲除后);
三组比较分析(比如 正常组 vs 疾病组 vs 疾病治疗组);
四组及以上比较分析(时间序列分析或浓度序列分析)等
分析的基本思路流程图如下:
分析结果示例图:
数据预处理分析(表达箱式图和Venn图分析)
功能富集分析(GO分析和KEGG PATHWAY分析)
时间序列表达趋势分析及热图分析
蛋白互作网路分析及转录调控网络分析
关键mRNA(或lncRNA)的预后及表达预测分析
2、宏基因组测序
包括:宏全基因组测序、16S/ITS靶基因测序、功能基因测序等。
常见的分析设计有:肠道菌群分析、土壤环境分析、水环境微生物等。
分析基本思路流程图如下:
分析结果示例图:
多样性分析曲线图
聚类树与组分图结合分析
属水平下各样本丰度的heatmap图
PCA分析
Lefse分析
医药加范老师, 15301721511 (手机,微信号)