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【1分钟学实验】WB干货之如何选择我的内参?

燕子 生物实验菌 2022-07-09


在众多的生物实验技术中,Western Blot在研究蛋白相关的实验中依然占据着重要地位,虽然实验不难,但因其周期较长,步骤较繁琐,影响因素较多,因此常常会遇到各种疑难杂症。


对于那些实验中出现的问题,我们要做到追本溯源,一步步查找原因,解决问题。今天我们就先讲一讲WB中内参的使用和选择

 

1、 什么是内参


对于初始接触Western blot的童鞋最先要解决的便是内参的问题,内参既是内部参照,一般是指由管家基因编码表达的蛋白质(Housekeeping Proteins),在组织和细胞中的表达相对恒定,在检测蛋白表达水平变化时常用它来做参照。

2、选择内参的依据


(1) 种属来源:根据所做的蛋白样本的种属确定,哺乳动物一般β-actin、β-tubulin、GAPDH、Lamin B、Na+/K+-ATPase等;植物样本一般选择Plant actin、Rubisco等;其他来源样本应参考文献报道选怎合适蛋白作为内参。


(2) 蛋白表达位置:由于研究目的不同,对于细胞中不同部位蛋白的研究也要相应考虑不同的内参。一般总蛋白用β-actin、GAPDH作为内参即可,而针对细胞浆,细胞核,细胞膜等不同细胞定位的蛋白检测,最好使用相对应的内参,使得实验结果更具有科学性和严谨性。

 
(3) 目的蛋白分子量:一般应保证目的蛋白与内参蛋白分子量相差5KDa以上,比如检测目的蛋白分子量为45KD,此时不适宜选择β-actin(42KD)作为内参,可以考虑选择GAPDH(36KD)作为内参。


(4) 实验处理条件对内参表达的影响:实际的实验环境中,处理条件也许会改变一些内参的表达,这种情况下就要考虑研究的信号通路中是否会对内参有影响。如在糖代谢的研究中,不能用GAPDH作为内参,因为GAPDH是糖酵解过程中的酶,某些细胞中,缺氧也会改变GAPDH的表达。
 

3、内参的作用


内参蛋白在整个WB实验中可以说意义重大,作用非凡。首先,在WB结果中可以直观的判断目的蛋白的表达情况;若内参条带亮度一致,即可排除实验中上样量的影响;其次,由于内参蛋白容易显现,且存在范围广,能够帮助我们查找WB实验中的问题所在,如电泳,转膜条件是否合适,显色体系是否正常等。另外,在我们做WB之前,都会先根据内参调整上样量,这时可以少量上样如5μg左右,以节省蛋白样品。在做目的蛋白时,一般加30-50μg,若是清楚目的蛋白含量低或是比较难显现,可以相应加大上扬量,提高目的蛋白显现的几率。


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