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【学习】脑结构、功能磁共振数据处理混合基础实操班(深圳*11.27-29)第二轮通知

脑结构、功能磁共振数据处理混合基础实操班(深圳*11.27-29)第二轮通知

 

南京安睡科技有限公司协同睡眠障碍与脑科学团队将于2020年11月27日-29深圳举办脑结构与脑功能磁共振数据处理基础实操培训班。    睡眠障碍与脑科学团队以及南京安睡科技有限公司以会议培训、数据处理服务、失眠治疗产品研究等为核心业务的创新性公司,目前已拥有授权发明专利及软件著作权多项。

睡眠障碍与脑科学团队具有较强的研发实力,目前正在开发操作简单、实用的软件工具包,涉及结构影像、功能影像、脑电、心理范式、机器学习、问卷等多个模块。本次培训班老师均具备博士(后)或硕士学历。

 

培训特色:

此次学习班旨在减少所有学员宝贵时间,将课程压缩至周末期间,减少学员请假时长,让更多的学员能用机会出来学习。本次学习班课程主要特色为减少一些繁琐无用的理论课程,加量、压时、不加价,坚持小班教学,重操作、轻理论。本次学习班将带所有学员从原始磁共振数据一直手把手练习至结果呈现。我们将竭尽全力保证所有参加培训的学员在最有限的时间内成功操作、学会所列课程。

 

培训对象:

    所有学科医生、在校学生、高校老师均可参加,本次课程主要针对磁共振数据脑结构与脑功能磁共振数据处理的一些基础常规方法进行讲解,主要涉及VBM、皮层厚度、常见局部功能指标、连接指标、TBSS以及常见的一些统计方法。

 

课程安排:

时间

课程名称

主要内容

11月25

(线上装机)

19:00-21:00

 

数据整理及格式转换

 

1、数据采集注意事项

2、磁共振原始数据整理与格式转换

3、软件安装与常用软件包介绍

11月27

(周五上午)

9:00-12:00

 

VBM讲解、操作

1、脑结构分析及VBM分析原理介绍

2、VBM分析流程、操作步骤详解(VBM8)

3、VBM分析流程、操作步骤详解(CAT12)

4、Linux简单命令学习

11月27

(周五下午)

13:00-18:00

基于FSL-VBM讲解、步骤实操

1、基于FSL的VBM操作

2、统计分析

3、结果呈现

 

11月27

(周五晚上)18:30-21:30

 

 

FreeSurFer脑皮层厚度处理步骤

1、FreeSurFer皮层厚度处理及文件说明(thickness,sulc,curv

2、海马亚区分割

3、特定脑模板皮层厚度提值

4、基于组水平的皮层厚度统计

5、结果汇总与可视化操作

 

11月28日

(周六上午)

9:00-12:00

 

 

静息态功能磁共振分析方法总览及理论讲解

1、静息态功能磁共振分析方法概论

2、静息态功能磁共振分析方法预处理(如时间矫正、头动矫正、标准化、平滑)3、数据去噪

4、局部指标理论介绍5、网络指标理论介绍

 

 

11月28日

(周六下午)

13:00-18:00

 

 

CONN工具箱介绍、各个网络及局部指标实操

1、静息态功能连接分析

2、动态功能连接分析(简单演示)

3、静息态独立成分分析(ICA)4、局部相关,全脑相关,径向相关,径向相似性等指标计算5、ALFF/fALFF等指标计算

6、图论分析

11月28日

(周六晚上)

18:30-21:30

CONN工具箱与功能连接分析

1、CONN工具箱各指标的统计分析

2、各个指标的结果呈现

3、CONN工具箱各个指标手把手实操练习

 

11月29日

(周日上午)

8:30-12:00

 

基于SPM统计

多重比较校正

可视化操作

1、单样本t、双样本t检验

2、单因素、双因素方差分析

3、重复测量方差分析

4、多重比较矫正(FWE,FDR,GRF,AlphaSim)

5、画图、制作表格、结果汇总

(Xjview、BrainNet、mricron)

11月29日

(周日下午)13:00-17:00

 

扩散成像处理实操

1、TBSS分析方法介绍

2、TBSS数据批处理实现

3、TBSS数据分析实操

4、结果呈现

 

 

培训人数:

  由于场地限制,本次培训班将限制人数,实现小班教学,请大家提前联系我们报名,报完为止。请在11月25号网课前报名。

 

 

培训地点:

深圳市龙岗区吉华街道吉华路333号上水径大厦426室。乘坐3号线地铁至上水径C出口向前走50米左右。

 

培训费用:

参会人员培训费3500元/人(培训费及资料费),交通食宿费用自理。

 

网络学习班报名

请扫码咨询 brainnews客服Maroon 

微信号:brainnews_11

电话号码:15829301719

留言:脑结构


 

备注:

1. 请各位培训学员自带笔记本电脑(Windows 64位系统、i5、4G内存、100G剩余存储空间等以上基本配置);


2. 可携带自己3-5例数据,现场根据自己的数据进行预处理;

3. 进入教室请携带口罩。培训期间,我们将免费提供口罩。

 

 

讲课老师团队介绍:

刘博士,博士后,副教授,硕士研究生导师。 深圳市高层次人才、广东省高等学校“千百十工程”培养对象。主持完成国家自然科学基金、广东省自然科学基金、深圳市自然科学基金及企业横向课题多项,发表论文40余篇,他引次数超过300,获2015年度教育部自然科学奖一等奖。刘教授大学主讲机器学习课程,在数据处理、编程方面具有极其丰富的经验。

 

林博士,博士后。浙江大学数学与应用数学学士,中国科学院大学神经生物学博士,芬兰赫尔辛基大学神经影像博士后。以第一作者在Human brain mapping等杂志发表机器学习等方面SCI文章8篇。熟悉影像学的各种主要数据分析方法,特别是基于机器学习的脑连接组学和影像组学。

 

戴博士,博士后,特聘教授。中国老年医学学会认知障碍分会委员。目前担任SCI期刊《Journal of Thoracic Disease》杂志的助理编辑;SCI期刊《Frontiers in Neurology》、《Frontiers in Psychiatry》和 《BioMed Research International》杂志的客座编辑。担任中国普通外科杂志《中国胸心血管外科临床杂志》及《临床与病理杂志等期刊编委已发表学术论文40余篇,Google scholar被引用700余次,h指数为13主持国家自然科学基金等课题6项,参加省级以上课题13项。申请国家发明专利2项、软件著作权1个。参与编写专著2

 

陈博士,中国神经科学学会会员,擅长使用脑电、功能性磁共振成像等认知神经科学的方法处理任务态实验数据,包括但不限于使用Matlab工具包(EEGLAB,Fieldtrip, SPM等)处理数据以及使用R语言(ggplot2)对数据处理结果进行绘图。曾在科学通报,心理科学进展,Social and Affective Neuroscience (SCAN),Scientific Reports, Neuroscience Bulletin等国内外心理学著名杂志发表多篇认知神经科学方向的学术论文。另参与多项国家自然科学基金项目,主持中央高校基本科研业务费项目一项。

 

段博士,自动化(本科)和心理学(研究生)交叉学科背景,精通Matlab、Python及R语言。以第一作者发表SCI论文多篇,软件著作权一项(自动睡眠分析和纺锤波识别),在睡眠及静息态脑电数据处理方面有着丰富的经验。

 

田博士,神经影像学及心理学学科背景,精通Matlab、Python及R语言。。以第一作者发表SCI论文多篇,在功能磁共振和结构磁共振影像处理方面有丰富的经验。

 

 

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