【线下·杭州】基于图论的复杂网络拓扑指标理论及实操专题培训
基于图论的复杂网络拓扑指标理论及实操专题培训
主办单位：杭州脑海科技有限公司
协办单位：杭州师范大学附属医院认知与脑疾病研究中心
杭州拾睿科技有限公司
1. 内容概括
1） 本期培训班在杭州举办为期6天
2） 内容涵盖：
基于图论的复杂网络分析
功能网络的构建与拓扑指标的计算
ROC分析原理及对图论指标的应用
一般线性模型与岭回归分析
层次聚类分析技术与K均值聚类
Statsmodels与sklearn讲解与实操
脑连接组的可视化（brainNetViewer）
多模态分析
2. 课程说明
3. 课程安排
| 第1天 | 王 倩 倩 | [上午] rsfMRI数据预处理 | 9:00-12:00 |
| 数据初识与整理 | |||
| 预处理流程详解 | |||
| 例子数据实操 | |||
| 常见报错整理 | |||
| [下午] 功能连接计算 | 14:00-17:00 | ||
| 功能连接基本概念 | |||
| 例子数据实操 | |||
| 计算结果解读 | |||
| 文 建 洁 | [晚上] 实操复习 | 18:00-21:00 | |
| 复习白天内容 | |||
| 第2天 | 吕 亚 婷 | [上午] 脑连接组学与图论概述 | 9:00-12:00 |
| 脑连接组学简介 | |||
| 基于图论的复杂网络介绍 | |||
| 基于图论的复杂网络的应用研究 | |||
| [下午] 文献解读与脑网络分析 | 14:00-17:00 | ||
| 相关文献模块化解读 | |||
| GRETNA介绍与上机 | |||
| 总结与答疑 | |||
| 张 韬 | [晚上] 实操复习 | 18:00-21:00 | |
| 复习白天内容 | |||
| 第3天 | 张 韬 | [上午] 功能网络构建 | 9:00-12:00 |
| 节点与连边的定义 | |||
| 静态功能连接与动态功能连接的网络构建 | |||
| GRETNA操作练习 | |||
| 总结与答疑 | |||
| [下午] 拓扑指标计算与统计 | 14:00-17:00 | ||
| 复杂网络拓扑指标计算 | |||
| 复杂网络拓扑指标统计分析 | |||
| 多重比较校正 | |||
| GRETNA操作练习 | |||
| 王 倩 倩 | [晚上] 实操复习 | 18:00-21:00 | |
| 复习白天内容 | |||
| 第4天 | 王 罗 羽 | [上午] ROC分析理论 | 9:00-12:00 |
| ROC分析的基本原理 | |||
| ROC分析的相关指标 | |||
| ROC分析的特殊案例 | |||
| [下午] ROC分析操作 | 14:00-17:00 | ||
| 临床指标的ROC分析 | |||
| 复杂网络指标的ROC分析 | |||
| 李 仔 麒 | [晚上] 实操复习 | 18:00-21:00 | |
| 复习白天内容 | |||
| 第5天 | 张 翼 | [上午] 一般线性模型与回归分析 | 9:00-12:00 |
| 一般线性模型原理讲解 | |||
| 置换检验原理讲解 | |||
| 多重共线性及其解决办法——岭回归介绍 | |||
| 使用主成分分析和因子分析降维 | |||
| [下午] 聚类及统计分析 | 14:00-17:00 | ||
| 层次聚类技术 | |||
| k-means聚类 | |||
| 使用statsmodels进行统计检验 | |||
| sklearn库讲解及实操 | |||
| 李 仔 麒 | [晚上] 实操复习 | 18:00-21:00 | |
| 复习白天内容 | |||
| 第6天 | 贾 熙 泽 张 韬 | [上午] 脑连接组可视化 | 9:00-12:00 |
小p值并不能保证可靠结果：以帕金森病的静息态脑功能成像元分析为 | |||
| 节点与连边统计分析注意问题 | |||
| BrainNet Viewer介绍 | |||
| BrainNet Viewer操作练习 | |||
| 总结与答疑 | |||
| [下午] 多模态分析介绍 | 14:00-17:00 | ||
| 功能连接与结构连接介绍 | |||
| 功能网络与结构网络的分析流程 | |||
| 脑连接组学的计算方法与应用研究 | |||
| 总结与答疑 |
备注：请各位学员自带笔记本电脑，建议电脑配置：windows 64位系统、8G以上内存、80G以上剩余硬盘空间。请尽量携带Windows电脑，如果只能使用苹果MAC电脑，请提前使用Bootcmap安装windows 64位系统。
4. 授课教师
吕亚婷：博士，现任杭州师范大学认知与脑疾病研究中心臧玉峰教授课题组担任副研究员，硕士毕业于中国科学院自动化研究所模式识别与智能系统国家重点实验室，2013年博士毕业于德国马克思普朗克人类认知与脑科学研究所。共发表SCI论文21篇。其中，以第一或通讯作者（含共同）在Annals of Neurology、Journal of Neurology、Human Brain Mapping等权威期刊发表SCI论文11篇。申报人研究成果具有较高的临床应用价值，得到了多个项目支持，目前主持1项科技部国家重大慢性非传染性疾病重点研发计划课题，2项国家自然科学基金项目及1项杭州市创业创新项目，共计取得科研经费近200万。目前担任国内神经科学顶级期刊Neuroscience Bulletin（影响因子4.246）的青年编委；Frontiers in Neuroscience的Review Editor；并担任Neuroimage, Neuroimage:Clinical, Science Bulletin, Frontiers系列等国内外刊物的审稿人。
张翼：博士生，目前在浙江大学物理学系交叉学科实验室学习，师从唐孝威院士。主要关注长期认知训练对脑的塑造作用，可熟练使用python语言分析功能磁共振数据，尤其擅长对静息态功能网络有关问题的分析。以第一作者发表SCI论文1篇（Cerebral Cortex），SSCI论文1篇（Consciousness and Cognition）。
王罗羽：杭州师范大学与浙江大学附属杭州市第一人民医院联合培养研究生，具有医学和神经科学的交叉背景，跟随浙大丁忠祥教授和杭师大吕亚婷老师从事多模态磁共振成像在脑卒中和阿尔茨海默病等脑疾病方面的方法学研究，具有丰富的临床数据采集和数据分析经验，以第一或共同作者发表多篇SCI论文，开发了ROC分析绘图工具包ROCA（https://github.com/Luoyu-Wang/ROCA）。
贾熙泽：杭州脑海科技有限公司首席执行官，杭州师范大学附属医院认知与脑疾病研究中心副研究员（兼职）。研究兴趣为：静息态方法学、基于脑影像的Meta分析以及脑影像技术在积极心理学中的应用。现任中国心理学会积极心理学专委会委员，师从任俊教授从事积极心理学研究。具有计算机、心理学及神经科学交叉背景。目前主持国自然青年基金项目1项，并作为主要参与人参与8项国自然科学基金项目。在臧玉峰教授的指导下，基于REST开发了RESTplus工具包，有关该工具包的论文于2019年发表于Science Bulletin（影响因子 9.5分，30次引用）。同时还担任静息态功能磁共振论坛网站（restfmri.net）的管理员。合作发表SCI文章23篇，主要作者13篇（第一作者或通讯作者）。Neural Plasticity杂志的guest editor、Frontiers in Neuroscience（SCI医学2区，3年平均IF 3.69）、Frontiers inPsychology（SSCI心理学2区期刊，影响因子2.0）以及Frontiers inPsychiatry（SCI医学3区，3年平均IF 3.18）杂志的评审编辑，Journal of Magnetic Resonance Imaging、Frontiers Aging Neuroscience、Brain research、Neuroimage：Report、Scientific Report等多个杂志的审稿人，曾多次受邀在国内外重要学术会议介绍静息态磁共振数据分析。
张韬：脑海科技高级数据分析工程师
王倩倩：脑海科技高级数据分析工程师
5. 培训说明
培训班限额招生20人，报满截止。我们会按照缴费顺序安排座位，为方便会务安排，报名敬请从速。考虑到疫情原因，本次培训每名学员每天发1个口罩。学员需要提供杭州健康码（支付宝首页搜索‘杭州健康码’）。
6. 培训费用
7. 培训地点
学习班请扫码咨询
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