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科研助力|如何高效阅读好一篇文献？
读好一篇文献涉及到四个方面：1）评估文章的价值；2）掌握阅读文献的技巧；3）提升阅读文献的高度 ；4）通过记笔记录下文献中的要点。本文综合各种来源，介绍如何面对以上四个方面。全文约1万字。
一、评估文章的价值
读好一篇文章的前提是文章本身就好、值得花时间阅读。差的文章不存在读好一说。斯坦福大学教授罗伯特·大卫·西格尔博士(Robert David Siegel)在他的“如何查找与阅读科学论文”文章中，详细介绍了如何评估一篇文章是否值得阅读。 他指出：
“一般来说，人们不会试图征服他们遇到的每一篇文章。文章实在是太多了，这需要太多的工作。他们往往会按顺序研究文章--同时决定是否进一步关注它。这个决定是基于几个因素：1）文章是否足够有趣。2）文章是否与自己的工作相关。3）文章是否具有一般的重要性。4）文章是否质量高且准确无误。5）文章是否写得很清楚，是否至少经过合理的努力就能看懂。6）文章是否内容丰富。7）文章是否简短。”
他还指出：“一个人不会像读小说或报纸文章那样去读期刊文章。这有几个原因: 1）信息太过密集，以致无法通过简单阅读就能理解。2）你可能对文章的某一方面感兴趣，而不是对整篇文章感兴趣。这类文章的特殊结构可以使人更容易找到所需的部分。3）对文章某一部分的理解往往需要向后或向前参考文章的另一部分。”
小说或报纸文章属于非学术型文章。网站paper masters的文章Research paper sources指出，非学术型文章还包括杂志类（magazine）文章、没有支持的网址、博客文章和未经同行评议的学术论文。本文考虑的文献属于学术型，包含非小说类书籍、学术期刊文章、同行评审的专业出版物、大学网站的研究型教材和原始素材（primary sources，即用于研究的素材，例如，假如我们要研究历史，那么那个历史时期的一封可以揭示历史事件的信是可以使用的原始素材，虽然这封信不是一篇学术论文）。按照西格尔博士(Dr. Robert David Siegel)指出的获取学术型文献的9种方式（见下面的滑动框），我们不难找到与自己相关的大量文献，并从中筛选出值得阅读的文献。
获取学术型文献的9种方式
（西格尔博士）1. 参考文献列表。当你找到一篇好文章后，你可以使用文章末尾的参考文献列表来查找不断扩充的相关文章列表。
2. 可靠的期刊。 人们经常会翻阅两三本自己喜欢的期刊，只是为了寻找感兴趣的文章，并一般性了解科学领域的动态。大多数图书馆都有指定的栏目，展示最近收到的期刊。
3. 大众报刊 。大众报刊往往在（科学）期刊寄给科学家或图书馆之前就收到了期刊的预印本。人们可以得到有趣的线索，知道会有什么成果问世。请记住，只有极小部分的研究结果能到达大众报刊，所以相关选择往往是有偏见和/或耸人听闻的。然而，这是普通公众对科学和医学的看法，所以仅凭这一点就值得阅读。千万不要对报纸文章中介绍的研究结果信以为真。一定要自己查找引文，看看它说的是什么。看看他们的信息是否正确。看看证据有多强。
4. 同事、教授和朋友。 因为任何一个人都不可能对文献进行全面筛选，从同学、教授和朋友那里要文章也是寻找有趣文章的绝佳途径。
5. Current Contents《当前内容》。 这是一份由转载自其他一些期刊的目录组成的期刊。这是一种快速浏览大量文章标题的方法，以便决定哪些文章值得进一步细读。
6. 引文索引（Citation Index）。对我来说，这是最宝贵的资源之一。它可以让人把参考文献 "向前推进"。它是最近发表的文章所引用的所有文章的汇编。因此，如果你发现了一篇两年前的优秀文章，你可以查找这篇文章，看看在过去的一个月里还有哪些文章使用它作为参考。这是一种寻找同一主题的较新文章的方法。
7. 摘要汇编 。从概念上讲，这些汇编与《当前内容》类似。然而，在这种情况下，它们的出版频率较低，它们不仅包含文章的标题，而且还包含摘要或概要。
8. 电脑搜索。如果你知道自己想研究的主题，但又没有一个好的起点，这是个不错的方法。一定要适当地做好搜索主题的限制工作，否则最后你会得到太多的参考资料，而你不知道该怎么做，因为其中大部分都是无关紧要的。
9. 网络搜索 。 就质量而言，很容易被找到或遗漏，但是，我对找到难以找到的小不点东西、可理解的照片和图表，以及科学故事中的人类利益方面的能力印象深刻。记住，不同的搜索引擎会产生不同的结果。例如，我发现Lycos比雅虎更有用。网络爬虫们（Web Crawler）会同时使用各种搜索引擎进行搜索。
阅读一篇文献的五个阶段
（西格尔博士）1. 在第一阶段，评估（screen）文章：1）快读一遍标题，寻找关键词。慢慢读标题，直到读懂为止。2）翻看作者，看看有没有你认识的名字，你知道的作品。这是尝试判断数据质量的一个重要过程。3）看日期。在分子生物学领域，信息变化很快，日期可能是最重要的。在政策研究问题上，日期不如思想质量重要。请记住，从研究完成、文章写好到发表之间有一定的滞后期。除了发表日期，很多期刊还会列出文章收到的日期，以及文章被接受的日期。有趣的是，经过审稿的期刊更容易被延迟发表，但不太可能包含不准确或轻率的文章。4）有些文章有一个简短的关键词列表。虽然它们有时会有误导性（做过计算机参考文献检索的人都知道），但它们通常具有相当的信息量，应该尽早查看。
2. 在第二阶段，找准关键词： 1）快读一次摘要，寻找关键词。慢慢读摘要，直到读懂为止。2）读引言。引言往往是一篇文章中最容易阅读的部分。在某些情况下，它也是信息量最大的——但并不大到呈现新的信息，而是整合背景信息。有些作者还会用一种比摘要中的方式更容易理解的方式来介绍他们研究的重点内容。3）引言中往往会引用很多参考文献。这是个极好的时机，可以开始看它们。如果参考文献中包含被引用的文章标题，那么这些参考文献的信息量就特别大。你会想反复去看参考文献页。
3. 在第三阶段，理解论文处理问题的方式：1）仔细阅读图形和表格。这第一遍你不会理解它们，但这将帮助你知道当你真正阅读文章时要注意什么。2）进入讨论。阅读前几段和最后几段。如果它很短和/或很容易理解，就把整篇文章读完。
4. 在第四阶段，首次阅读全文：1）如果你走到这一步，如果你还没有复印这篇文章，你可能希望复印。相对于你时间的投入，金钱的投入肯定是微不足道的。2）把摘要和引言再浏览一遍。这时你应该能够对它们有一个充分的了解。3）跳过方法部分。只有当你打算在研究中使用某些研究过程时，才需要仔细研究方法部分。方法的某些部分，如化学药品的购买地或病毒菌株的获得时间，实际上并不有助于对文章的理解，可以放心省略。即使在文章的其他部分相当清楚之后，方法的其他部分可能仍然模糊不清。对于我们的阅读目的，只有方法部分有助于理解文章的其余部分时才去阅读。4）阅读结果部分。5）阅读讨论部分。6）研究图和表。
5. 在第五阶段，加强理解：1）重读文章全文。你不妨多读几遍。2）一定要在文章上写。圈出不认识的字。检查重要的点。质疑你不理解或看起来不合理的东西。X掉那些错误的东西。记下进一步的想法或问题。3）查阅参考资料。查阅没有完全解释清楚的知识点。查阅课本，明确常识点。查阅不熟悉的单词。4）离开文章前，再重读一次摘要。
伊丽莎白·佩恩整理的采访稿
（译自Elisabeth Pain，Science, Mar. 21, 2016）
1. 你如何阅读论文?
我从阅读摘要开始，接着我浏览了一下引言，翻阅了这篇文章，看了这些图形。我试着找出最突出的一两个图形，我明白其中表达了什么。然后，我读了结论/总结。只有当我这样做的时候，我才会回到技术细节中去澄清我可能有的任何问题。 ——Jesse Shanahan 我首先通过阅读摘要和结论得到一个大致的概念。这些结论有助于我理解摘要中总结的目标是否已经实现，以及所描述的工作是否对我自己的研究有意义。我也经常看图表，因为它们会帮助我对一篇论文产生第一印象。然后，我通常从头到尾阅读整篇文章，按照它们出现的顺序浏览各个部分，这样我就可以明确了解作者想要表达的文章内容。如果你想让它成为一个卓有成效的练习，你首先需要清楚地知道你需要获得哪类信息，随后你需要在阅读中把重点放在这方面。这些重点可以是将你（期望看到）的结果与作者提出的结果进行比较，将你自己的分析置于上下文中，或者使用新发布的数据对其进行扩展等。引文列表可以帮助你决定为什么这篇论文与你最相关，给你一个第一印象，让你知道和你做过类似研究的研究者是如何使用这篇论文的。——Cecilia Tubiana 如果我的目标是抓住要点，我会阅读摘要，跳到图表并浏览讨论部分的要点。因为论文的摘要和正文可以被作者掌控并进行塑造，从而用来讲述一个引人入胜的故事，所以我认为图表是论文最重要的部分。如果我不清楚这些图形的含义，我就会转向去研究方法论。如果我想更深入地研究这篇论文，我通常会完整地阅读它，同时也会阅读该作者以前的一些论文或关于同一主题的其他文章。如果在我觉得特别有趣或有争议的陈述之后有参考文献，我也会查找并阅读这篇参考文献。如果我需要了解更多的细节，我可以访问任何额外提供的数据源或补充阅读材料。如果作者的研究与我的相似，我会看看他们的相关数据是否与我们的发现相符，或者是否有任何不一致的地方。如果有的话，我会考虑导致此种情况的原因。此外，我思考如果我们使用与他们相同的方法，我们的模型会发生什么，以及我们可以从中学习到什么。有时，关注作者决定以某种方式进行实验的原因也很重要。作者是否使用了模糊的测试而不是常规的测试，他们为什么要这样做？ ——Jeremy C. Borniger 我总是从标题和摘要开始。这会告诉我这是否是一篇我感兴趣的文章，以及我是否能够从科学和语言两方面理解它。随后我读了引言，这样我就能理解被框起来的问题，直接跳到图形和表格上，这样我就能对数据有所理解。之后我阅读讨论部分来了解论文是如何融入知识体系的。我在阅读中会着重关注论文中对数据局限性和数据合理推断的认识。有些研究者会夸大他们的主张，这对我来说可能是一个危险信号。我还会给自己戴上“流行病学家”的帽子，这样我就可以确保研究设计足以实际测试了正在被检验的假设。随着我对论点框架、图形和讨论的深入阅读，我也在思考哪些部分是令我激动人心并具有创新性的，哪些在生物学或逻辑上是相关的，哪些是最受文献支持的。我也会考虑哪些部分符合我预先就有的假设和研究问题。 ——Kevin Boehnke 我的阅读策略取决于是哪篇文章。有时候我会先浏览一下，看看文章有多少内容是与我所进行的研究相关。如果它直接适用于我当前的主题，除了可能已经熟悉的引言我会仔细阅读这篇论文。但我总是想弄清楚是否有特别的地方或数字需要我密切关注，然后我去阅读结果和讨论中的相关信息。我也会检查是否有我感兴趣的参考资料。有时我好奇地想看看这个领域中有谁或者更有可能没有被引用，看看作者是否选择忽略研究的某些方面。我经常发现补充图形（supplementary figures）实际上提供了最令人好奇和有趣的结果，特别是如果结果涉及到作者没有提及的领域的部分，或者如果他们不清楚或无助于他们对整个故事的解释。 ——Gary McDowell 阅读论文正好给了我一个做阅读笔记的任务，使我成为一个积极的读者，而不是让我的眼睛呆滞在堆积如山的文字上，这只会使我忘记刚读过的一切。例如，当我阅读背景信息时，我会将每篇文章中关于特定主题的信息性句子保存在Word文档中。我会在阅读过程中以写评论的方式写下我所产生的想法或我需要进一步探索的问题。这样在我未来的研究过程中，我只需要阅读这份笔记，而不是重新阅读所有的读过的论文。同样，当我想知道如何进行一个特定的实验时，我会用Excel创建一个表格来总结各种研究团队是如何进行这个特定的实验的。 ——Lina A. Colucci 我通常从摘要开始阅读论文，这样可以帮助我对研究的全部内容有一个简单的了解。在通读整篇文章之后，如果我发现自己不能在阅读方法部分前理解结果或者是我不熟悉的实验，我则会把方法部分的阅读留到最后。论文中结果和方法部分允许读者分开考虑这篇论文，以确保它经得起科学的严格检验。在阅读过程中我会始终考虑所进行的实验类型，以及这些实验是否最适合解决所提出的问题并且确保作者包含了相关和足够数量的质量控制。通常，结论也可以基于有限数量的样本，这限制了它们的重要性。我喜欢打印出论文进行阅读并在阅读中着重标注最相关的信息，以便于我在重新浏览文章时快速想起要点。我认为与所进行研究最相关的是那些改变对研究主题的想法或者可以给出新的想法和方向的内容。——Lachlan Gray 我选择阅读的是基于与我的研究领域，以及那些引起很多兴趣和讨论的东西，因为它们正推动我们在新的方向上研究心理学或更广泛的科学。多数情况下，我试图从论文中得到的是方法论、实验设计和统计分析的问题。所以对我来说，最重要的部分首先是作者用了什么方法，其次是他们发现了什么结果。理解作者为什么认为他们在做这项研究(引言)以及他们认为结果意味着什么(讨论)也是有趣的。当这是一个我非常了解的领域时，我通常不太关心反映作者理论偏好、思考方法及结果的这些章节。但当这是一个我所知甚少的领域时，我会仔细阅读这些内容，因为这可帮助我了解更多该研究领域的假设和解释方法。——Brian Nosek 我阅读文章很快。第一次阅读的目的只是为了看看这篇论文对我是否有意义。如果是的话，我会更加注重细节的再读一遍。如果这篇论文对我的研究至关重要——而且是理论性的——我会以重新设计这篇论文的方式阅读。在这种情况下，我只是从起点开始，然后自己解决所有其他问题，而不是通读论文。有时这是一个痛苦而缓慢的过程。有时，我会对作者写得不够清楚、忽略要点、纠缠于多余的废话而感到愤怒。但有时我也会被一篇文章弄得神魂颠倒。 ——Ulf Leonhardt 我总是先读摘要，只有当摘要表明论文对我有价值时，我才会继续读下去。如果论文的主题是我很熟悉的，我通常会浏览一下引言并阅读它的最后一段，以确保我知道论文中要讨论的具体问题。接着我会看图表浏览结果，最后阅读讨论部分。如果主题不是我熟悉的，我通常会更仔细地阅读引言，以便将研究置于上下文中。最后我再对图表和结果进行阅读。——Charles W. Fox 重要的是我们要意识到在阅读论文时必须走捷径，以便有时间完成其他工作，包括写作、研究、参加会议、教学和论文评审。从博士阶段开始，我一直在阅读学术期刊文章和章节的结论和方法，而不是整本书。——Rima Wilkes 作为《科学》杂志的总编，我必须一直阅读和理解自己研究领域之外的论文。一般来说，我从通讯编辑写的总结开始阅读，这些总结是为像我这样的人准备的：一个对任何事物都感兴趣但只深入某一领域的科学通才。接下来，我查看是否有人写了一篇关于论文的新闻文章。第三，我查看其他科学家是否有观点。透视的主要目标是拓宽文章的信息，但是作者通常在为非专家学者提取文章精华的同时也做了大量的工作。由于摘要是为了广泛地传达给期刊的读者而写的，因此我会对摘要进行讨论。最后，我继续阅读论文本身，依次阅读引言、结论、扫描图表，然后通读论文。——Marcia K. McNutt
2. 当有些东西你不明白时，你会怎么做？
我喜欢在线阅读，这样我就可以轻松地将我不知道的单词剪切粘贴到浏览器中，以了解它们的意思。——McNutt 如果文章里只有一些我不熟悉的东西，我会记下来以后查。如果我真的在努力完成阅读这篇论文，我会试着查阅一篇综述文章或教科书中的章节，以给我提供必要的背景资料，这样我会觉得效率更高。在阅读过程中会遇到许多缩略词和行话，这些内容可能是特属于一些子领域的，所以除非是为了我自己的研究，否则我通常不会涉猎这些细节。不过在阅读论文的过程中，我会努力花时间去理解正在使用的（研究）方法。——Shanahan 在阅读中遇到不理解的内容我通常会立即停下来查找。如果我不懂一个关键短语或行话，剩下的阅读可能就没有意义了。然而，这可能会适得其反，因为我经常在阅读过程中向上追溯原因(什么是X？哦，X影响Y……那么Y是什么？等等)。当你去了解事物是如何联系在一起的时候，这可能是一种乐趣，但是如果你的时间紧迫，这可能会把你的注意力从手头的任务上转移开。有时，论文中所有的行话会首先模糊实验的全部要点。在这种情况下，问问你自己“作者试图回答什么问题”？通过这样的方式你可以判断作者是成功还是失败。——Borniger 这取决于不可理解的部分在多大程度上阻止了我去关注主要论点。我通常不会在第一次看文章时试图理解所有章节的所有细节。如果不可理解的部分对我的研究很重要，我会试着问同事，甚至直接联系主要作者。因为时间有限，所以回到最初的参考文献获取所有的背景信息是最后的手段。合作或个人直接联系作者在解决具体问题时效率更高。——Tubiana 有时候，你只需通读一篇论文就可以使任何你不熟悉的术语到最后都会变得更清楚。如果进展非常艰难，那么停下来寻找额外的信息通常是解决问题的最好办法。因此我会在Google上快速搜索主题、题目、方法等来协助我获得这些信息。如果这是一篇内容非常密集的文章，那么你需要在阅读这篇文章之前额外阅读几篇文章。——Gray 我问自己的问题是，“为了从这篇论文中得到我需要的东西，我需要理解这意味着什么吗？”我现在阅读的研究领域的文章远远超出了我的专业知识范围，我通常不需要更多的实质性内容的肤浅知识。如果我不能理解论文的深度，那我就需要做更多的背景研究否则我就不能做任何事情。——Nosek 最近，我不得不阅读一些存在很多不熟悉内容且是我所研究专业领域之外的论文。在某些情况下，我能够直接从结果或图表中提取我需要的信息。我也会使用Google搜索来定义论文中的术语和概念，或者阅读引用的参考文献来更好地理解所提出的观点。有时候论文是如此的不可理解(至少对我来说)，以至于我懒得去读它们。——Fox
3. 你是否曾觉得阅读论文不堪重负，你如何应对？
如果这篇论文与我正在努力解决的问题有关，你可以肯定论文中有一些关键的东西我不明白。这种混乱不是威胁，而是机会。我是无知的，我需要变得不那么无知。这篇论文可能对我有所帮助。同时，有些论文写得很糟糕，不值得费力去读。其他人肯定已经把概念写得更清楚了，这样我就可以把我的困惑集中在理解实质而不是糟糕的语法上。 ——Nosek 如果所要阅读的论文不在我所了解的研究领域，如果它的篇幅很长，如果文章中充满了技术术语，我会不知所措。当这种情况发生时，我的解决办法是将文章分成几块，并在接下来的几天内进行阅读。对于真正难以理解的论文，我认为和同事们在一起讨论也很有帮助。 ——Shanahan 是的，很多次了。这就是为什么我通过与其他科学家交谈和反复试验来制定自己的阅读策略。我曾经也沮丧地举起过双手，扔掉那些讨厌的论文，再也不看。——Boehnke 是的，在这些情况下，你必须意识到一些论文是几十位科学家多年工作的结果。期望在一个下午消化和理解其中的所有内容是一个牵强的想法。——Borniger 我常常感到不知所措！但是某些部分可能不需要像其他部分那样深入理解。你还需要知道你自己的短板：论文中是否有一些部分是你想模仿的，但不是你专业知识的一部分，并且可能通过合作变得“可访问”？——Tubiana 如果我觉得这篇论文对我正在做的事情非常重要，我会暂时放下它，过段时间后再阅读几次。但是如果这太令人难以承受，那么我不得不把它放在一边，除非我联系过的同事中有人能够解释它。 ——McDowell
4. 你还有其他想分享的建议吗？
以下是被采访者名单：
Jesse Shanahan, 康涅狄格州米德尔顿卫斯理大学天文学硕士研究生
Cecilia Tubiana, 德国哥廷根马克斯·普朗克太阳系研究所的科学家
Jeremy C. Borniger, 哥伦布俄亥俄州立大学神经科学博士研究生
Kevin Boehnke, 安阿伯密歇根大学环境健康科学博士研究生
Gary McDowell, 马萨诸塞州梅德福德塔夫茨大学发展生物学博士后研究员，波士顿学院访问学者
Lina A. Colucci, 哈佛-麻省理工学院健康科学与技术项目的博士研究生
Lachlan Gray, 布尔内特研究所艾滋病毒神经发病实验室副主任，澳大利亚墨尔本莫纳什大学传染病系兼职研究员
Brian Nosek, 弗吉尼亚大学心理学系教授，夏洛茨维尔开放科学中心执行主任
Ulf Leonhardt, 以色列雷霍沃特魏茨曼科学研究所物理学教授
Charles W. Fox, 列克星敦肯塔基大学昆虫学系教授
Rima Wilkes,温哥华不列颠哥伦比亚大学社会学系教授
Marcia K. McNutt, 《科学》杂志总编
1. 完整的引文信息。作者、出版日期、（书籍或文章的）标题、期刊、卷#、期#、页码范围：2. 如果是web访问：给出url和访问日期3. 关键词：4. 一般主题：5. 特定主题：6. 假设：7. 方法：8. 结果：9. 要点总结：10. 背景（该文如何与该领域的其他工作相关；如何与其他人包括你自己的关键问题和发现联系起来）：11. 意义（对领域的意义；与你自己的工作的相关性）：12. 重要图表（摘录简要说明；图表出现的页码）：13. 引用的可供你跟进的参考文献（列出那些明显与你的主题相关的文献以及其他人经常引用的任何论文，因为这些文献很可能在你发展自己的文章时被证明是必不可少的）：14. 其他评论：