测试表征系列 | XRD精修宝藏:CMPR软件介绍
在使用GSAS软件进行XRD精修时,我们常常需要对数据格式进行转换,初步进行峰形拟合,处理GSAS结果等工作。那么,CMPR软件就是必不可少的。CMPR软件是由美国国家标准与技术研究院中子研究中心的Brian H. Toby编写的免费通用的粉末衍射数据的多功能软件,不仅能够在Windows平台使用,还可以在Mac系统及Linux系统上正常运行。如果大家使用了该软件,最好在工作中引用Brian H. Toby的论文:Toby, B. H. (2005). "CMPR - a powder diffraction toolkit," Journal of Applied Crystallography 38, 1040-1041。
图1 CMPR软件
(1)使用搜索引擎进行搜索CMPR或者按照下面的链接直接下载软件:
http://11bm.xray.aps.anl.gov/downloads/
(2)将压缩包进行解压,无需安装,双击文件夹中的“Start- CMPR.bat”文件即可运行程序;
(3)同时我们也可以创建软件快捷方式,并利用文件夹里面的“CMPR.ico”修改图标;
打开CMPR软件后,我们会看到两个界面,一个是CMPR主程序窗口,用以实现程序的主要功能,另外一个是绘图窗口,主要用来显示数据结果图形。
图2 CMPR软件的界面
4.1 转换原始数据格式
GSAS软件进行精修所需的数据格式为“.gsas”类型,然而大部分XRD测试结果文件并不为此。除此之外,我们常常还需要将不同格式的XRD文件进行转换。在此,我们就可以利用CMPR软件来进行处理,它能读取几乎所有类型的XRD测试结果。下面我们以一个例子来为大家演示如何进行操作:
(1)尽管不同仪器XRD测试结果相差很大,但共同点是都包含“衍射角度”与“强度”。因此,我们首先将仅包含“衍射角度”与“强度”的XRD数据复制到txt文件里,如“Sb.txt”;
(2)然后将文件的后缀名改为“.dat文件”,如改成“Sb.dat”;
(3)打开CMPR软件,选择“Read”选项卡,然后选择数据类型为“XY data (ascii)”,接着选择文件位置和文件,最后点击“Read”进行数据读取;
(4)随后就能看到plot窗口已经绘制出了XRD谱图,这表明数据已经读取成功;
(5)如下图所示,首先选择“Write”选项卡,然后选择文件,随后选择保存位置,接着选择保存文件类型为“Simple gsas with esds (.gsas)”,最后点击“Write Selected Datasets”即可;
(6)随后程序就会弹出如下图所示的对话框,表明文件创建成功;如果文件没有创建成功,通常是由于在第5步忘记选择文件了;
(7)查看转换后的文件Sb.gsas文件,这种类型的文件GSAS可以直接读取。
4.2 输出精修结果
GSAS精修的很多结果都保存在“.exp”文件中,我们同样可以采用CMPR软件来将其转换为“.csv”文件,从而采用Excel来将其打开以利于后续的绘图。下面是主要的操作过程:
(1)与4.1类似,首先是打开.exp文件;
(2)随后弹出读取对话框,单击OK即可;
(3)进入“Write”选项卡,选择所有文件,随后选择保存位置,接着选择保存文件类型为“.csv”,最后点击“Write Selected Datasets”即可;
(4)可以发现,数据已经被转换成了可以用Excel打开的“.csv”文件了。
4.3 其他功能
(1)峰形参数拟合
CMPR另外一个非常重要的功能就是使用“Fit”和“FitWid- ths”功能进行峰形参数拟合,从而得到仪器参数的初始值:U,V,W,LX和LY。这个功能比较重要,不过内容比较多,我们将在下一篇推文中介绍。
(2)Rescale功能
使用Rescale功能不仅可以调整X轴和Y轴的单位以改变XRD谱图的显示方式,还能够对数据进行放大、缩小、偏移等操作。
(3)指标化
指标化的过程就是标定衍射线指数。对衍射结果进行指标化是鉴定未知结构的第一步。CMPR软件的“Index”选项卡就可以完成此工作。可以看到,CMPR包含三个进行指标化的软件,分别是:ITO,TREOR和DICVOL。
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