前沿报告 | 韩昱晨：时空组学技术及其在病理中的应用

2021年12月16日-19日，中华医学会病理学分会第二十七次学术会议暨第十一届中国病理年会顺利召开。本次年会以“传承、创新、发展”为主题，来自全国各地的病理工作者齐聚云端，共襄盛会。1.2万余人在云端共同见证了不一样的精彩。

12月17日上午，中华医学会病理学分会第二十七次学术会议暨第十一届中国病理年会分子病理专场也在线上开启，精准医学的发展日新月异，此次分子病理专场也为相关领域研究人员提供了一个交流学习的平台。

分子病理是近几年来发展最快速的领域之一，分子病理学理论与技术的应用，拓宽了病理诊断的视角，发展了新的研究领域。分子病理专场聚焦最新前沿技术进展、临床实践中的难点和重点，展示了分子病理领域的研究成果和风采，同时也将为我国分子病理的发展带来极大的促进作用。

精彩报告

韩昱晨教授报告视频 

来源：中华医学会病理学分会第二十七次学术会议暨第十一届中国病理年会

在会上，上海市胸科医院病理科韩昱晨教授以《时空组学技术及其在病理中的应用》为题作了精彩的报告。报告首先介绍了后人类基因组时代以来，基因组技术的发展和应用，从个体到群体，从宏观到微观，从局部到系统，引出了2020年Nature Method年度技术——空间转录组技术。

其后，韩教授从病理的角度对癌症认知进行了详细的阐述。韩教授认为，肿瘤的异质性、演化和微环境是癌症和癌症病理研究的核心问题，也是探究开发治疗方法的关键所在。韩教授以Cell上一篇肝癌最新研究为例，介绍了单细胞技术通过细胞分群聚类、功能分析解析肿瘤异质性和微环境的方式和能力；在此基础上，空间转录组学的精细细胞定位和功能表征能力可以解析癌症组织的空间异质性。韩教授认为，肿瘤在不同的发展阶段会有不同的异质性，在同一个肿瘤组织内部也有空间的异质性，所以肿瘤细胞在时间和空间两个维度，为我们认识和战胜癌症提出了挑战和高要求，空间转录组技术恰恰为完成这一挑战提供了强有力的工具。

随后，韩教授介绍了单细胞转录组技术和空间转录组的原理和差别，同时介绍了大视场、高分辨率的DNB纳米球测序的空间转录组技术Stereo-seq。她以肝组织、支气管组织和肝癌组织等为例，讲述了空间转录组技术在确定细胞类型、根据基因表达模式识别新的组织区域、研究细胞间相互作用的应用。在病理研究方面，通过肺腺癌、结肠癌研究，阐明通过空间转录组可以将肿瘤分子分型、定位侵袭性肿瘤的前沿及其生物学特性、定位定量免疫微环境。

最后，通过介绍现有的癌症诊断治疗的手段和流程，韩教授对空间转录组学在病理鉴定的应用、以及新一代数字化病理——时空数字病理诊断系统的形成进行了展望。

韩教授在报告中提到的华大时空组学技术Stereo-seq于2021年1月发布，该技术突破了传统技术的限制，通过时空芯片捕获组织中的mRNA，以空间条形码（Coordinate ID, CID）还原回空间位置，实现组织原位测序，为深入地了解细胞的基因表达及形态与局部环境之间的关系建立强大的研究基础。该技术可实现生命全景时空分子图谱，成为全球领先的能同时实现“纳米级分辨率”和“厘米级全景视场”的原位捕获空间全转录组测序技术，可以全面应用于生老病死、意识起源、万物生长、生命起源等重大问题研究，推动生命科学和医学领域的发展，带来生命科学领域第三次科技革命。

推荐阅读

07-20 时空组学

07-28 DNBelab C4

10-30 国际合作中心

12-06 大科学计划

联系我们

对时空组学或单细胞组学整体解决方案感兴趣的老师，可选择以下方式和我们联系，我们将及时为您进行详细的介绍：

1. 在公众号留言；

2. 发送信息至邮箱：

[e-mail]；

3. 点击页面左下方“阅读原文”登记信息。

点

“阅读原文”登记信息