2021关键词 | 可提笔著文章，可下五洋捉鳖，致敬奋斗者！
时空组学这一年
创新点亮时空，科技引领未来。2021年初，华大自主研发的Stereo-seq时空组学技术横空出世，突破了传统技术的限制，将生命科学研究带入到时空时代，带来了生命科学领域第三次科技革命。
为山者，基于一篑之土，以成千丈之峭。这一年，时空组学实现了从0到1的突破，也在奋斗中浓墨重彩了每一个关键词。未来，我们期待与您，一起探索生命时代的星辰大海，书写更美好的时空华章。
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01
2021年1月，华大发布了Stereo-seq时空组学技术，该技术通过时空芯片捕获组织中的mRNA，以空间条形码（Coordinate ID, CID）还原回空间位置，实现组织原位测序，为深入地了解细胞的基因表达及形态与局部环境之间的关系建立强大的研究基础。
Stereo-seq可实现生命全景时空分子图谱，成为全球领先的能同时实现“纳米级分辨率”和“厘米级全景视场”的原位捕获空间全转录组测序技术，可以全面应用于生老病死、意识起源、万物生长、生命起源等重大问题研究，推动生命科学和医学领域的发展，带来生命科学领域第三次科技革命。
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02
随着科技创新2030—“脑科学与类脑研究”重大项目的发布，脑科学研究的重要地位进一步凸显。其中需要利用先进时空组学及单细胞组学生物技术进行研究的方向包括：脑区单细胞时空动态图谱、脑区发育过程中的单细胞转录组研究、全脑三维细胞图谱、神经元空间分布图谱、脑疾病单细胞空间分布图谱等。1月起，华大和中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心（神经科学研究所）合作，发挥华大时空组学的前沿技术优势，助力脑科学重大科技项目。
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03
通过算法对测序数据进行定位、比对、注释等处理后，可以鉴定出不同的细胞类型。研究人员利用Stereo-seq时空组学技术，对多张切片进行配准和变换，重构出全脑细胞三维时空图谱，精准展示出不同细胞类型的分布情况。该研究由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心（神经科学研究所）和深圳华大生命科学研究院等主导。
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04
StereoMap可视化系统是立足Stereo-seq技术的亿万级大数据可视化在线平台。除了实时数据可视化外，StereoMap还提供在线数据挖掘功能，方便用户随时随地对时空组学数据进行深入探索和挖掘，具有大数据可视化、在线数据挖掘、在线数据管理等优势。
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05
2021年10月，华大时空组学6篇科研文章集中预印。深圳华大生命科学研究院携手各合作伙伴，利用Stereo-seq时空组学技术对小鼠胚胎、斑马鱼胚胎、果蝇、蝾螈脑、实体瘤、拟南芥等进行时空组测序，构建时空组图谱。
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06
10月，全球首个时空组学国际合作中心落地青岛。该中心将利用华大自主可控的技术开展全套实验服务并完成交付，保证交付质量。中心实验室总面积近2000平米，拥有时空组学、细胞组学、数字化等独立实验室，配备有高存储的集群设施，可实现3000张切片/年的时空组数字化通量，并获得了ISO 9001、ISO 14001、ISO 45001三体系认证，将支撑时空组学全球科研合作和技术研发，实现关键核心技术自主可控，助力解决“卡脑袋”问题，发挥战略引领和学术引领作用。
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07
第十六届国际基因组学大会（ICG-16）于2021年10月25日-31日在青岛举行，大会以“组学与国际合作”为主题，吸引了包括9位院士在内的20余个国家的155位组学领域科研翘楚线上线下齐聚青岛，聚焦生物多样性保护、新冠疫情防控等生命科学领域的全球性难题，分享前沿生物技术进展，探讨国际合作机遇。时空组学、单细胞组学强势亮相“组学与全球健康”“生命科学的前沿发展”等板块，展望生命科学革命性技术的未来。
美国国家科学院院士、美国工程院院士、美国哈佛大学George CHURCH教授，中国科学院院士陈子江教授，中国科学院院士黄荷凤教授，美国国家科学院院士、中国科学院院士、香港科学院创院院士蒲慕明教授，以色列魏茨曼科学研究院Ido AMIT教授，中国科学院神经科学国家重点实验室李澄宇教授，昆士兰大学分子生物科学研究所 (IMB) 组长Quan NGUYEN教授，新加坡基因组研究所高级研究员Shyam PRABHAKAR教授，浙江大学医学院郭国骥教授，麻省理工学院霍华德休斯医学研究所Xiaojie QIU教授，基因组工程团队负责人徐健教授，深圳华大生命科学研究院韩磊博士等多名海内外大咖作时空组学、单细胞组学相关专题报告。
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08
除了在国内积极推进科研合作，华大时空组学技术在国际间的合作也在如火如荼地开展。目前，里加时空平台建设已完成，并正常开展时空项目，里加本地已完成多样本类型实验及数据分析。华大与牛津大学、瑞典卡罗林斯卡医学院等单位展开合作。
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09
STOmics试剂盒包含了Stereo-seq技术流程所需的主要试剂和时空芯片，实验流程快速高效，从组织切片转化到待测序文库仅需8小时。时空芯片上装载具有空间坐标信息的捕获探针，探针与组织切片结合后，在芯片上原位抓取组织内的mRNA分子并进行cDNA合成，通过测序和配套的可视化系统，获取全视场样本的转录组信息。
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10
2021年12月5日，经历53天的探索征程，“探索一号”科考船搭载着“奋斗者”号载人潜水器返回三亚，完成了2021年度第二航段的常规科考应用任务。“奋斗者”号载人潜水器参航科学家团队共同发起《马里亚纳共识》倡议，同时启动“马里亚纳海沟生态环境科研计划”，简称MEER（Mariana Trench Environment and Ecology Research Project），邀请国内外研究学者围绕马里亚纳万米深渊科考，协力攻坚深海地球科学系统的形成与演化、生命起源与环境适应、生物多样性与气候变化等重大科学问题。华大时空组学将支撑该计划实施，同时华大将致力于提供极端生物的全流程解决方案。
可提笔著文章，
可下五洋捉鳖，
逐梦时空，永不止步。
2021，即将谢幕，
这一年，
微光成炬，众志成城；
2022，马上开启，
一如既往，
只争朝夕，续写华章。
致敬所有科研人员，
致敬所有奋斗者！
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