华大时空蛋白转录组Stereo-CITE亮相国家蛋白质科学中心（北京）2024年第二季度学术研讨会

近日，由国家蛋白质科学中心（北京）（以下简称蛋白质设施）主办、北京大学分中心凤凰中心平台承办的2024年第二季度学术研讨会在北京大学金光生命科学大楼成功举办。

北京大学生命科学学院、北大-清华生命科学联合中心高宁教授主持本次会议。中国科学院院士、国家蛋白质科学中心（北京）理事长兼主任贺福初，国家蛋白质科学中心（北京）技术专家张晔，南方科技大学田瑞军教授，北京大学第一医院/基础医学院薛瑞栋研究员，北京大学未来技术学院曾虎研究员，北京大学生命科学学院季雄研究员等齐聚现场，深入讨论蛋白质领域的热点问题、发展趋势以及最新的理论和实验成果。

此外，大会还特别邀请深圳华大生命科学研究院刘一帆博士分享华大时空蛋白转录组产品方案及应用。

单细胞时空多组学是目前比较前沿的多组学研究技术。在过往bulk测序的基因平均表达水平的基础上，将研究升维到单细胞层面、空间二维平面、甚至3D建模重构上，将单独的RNA/蛋白质/代谢层面的研究，升级到RNA+蛋白质+代谢物的多组学联合应用。目前，允许对转录组和蛋白质组进行共检测的方法仍然有限，或只允许对有限数量的蛋白质进行检测，或缺乏单细胞分辨率。

刘一帆博士表示，华大时空组学已于2024年3月正式发布时空蛋白转录组Stereo-CITE，该方案能够在同一张组织切片上，以单细胞级分辨率，实现全转录组和100+重蛋白质的原位共检测，并配有强大的生信分析工具，生成基因和蛋白质的空间表达图谱，也可支持蛋白质组和转录组联合分析，有助于科研人员获得更广的空间组学研究视角。点击了解详细产品方案。

刘一帆博士现场分享

刘一帆博士还展示了Stereo-CITE产品在人癌旁淋巴结和小鼠肝脏等样本上的应用数据。相较于单一的转录组或者蛋白质组信息，通过Stereo-CITE同时捕获到的转录组和蛋白质组数据的空间联合聚类不仅可以很好地还原人癌旁淋巴结样本的组织学结构，还能帮助发现内部的特征性区域（图中黄色区域：PD-L1高表达区域），为临床诊疗提供有用信息。此外，通过单细胞水平上的多组学数据整合，能更全面、准确地鉴定出小鼠肝脏组织血管结构周围中的多种细胞类型。

Stereo-CITE在人癌旁淋巴结中的应用

Stereo-CITE在人肝脏中的应用

Stereo-CITE在组织器官空间图谱构建、肿瘤异质性、肿瘤免疫微环境、靶点挖掘和生物标志物识别和免疫治疗方面均有广阔的应用前景。未来，Stereo-CITE有望为时空病理提供重要助力。

点击视频了解时空蛋白转录组Stereo-CITE

 

刘一帆

华大时空组学产品开发高级工程师

刘一帆博士，华大时空组学产品开发高级工程师，当前重点关注时空组学和单细胞领域技术研发、产品开发及其下游应用，在空间组学、细胞组学和蛋白质组学等领域有着一定的行业经验。目前以第一作者或共同作者在《Nature Communications》、《Cancer Letters》等杂志上发表10余篇论文。曾参与973项目、国家自然科学基金重大研究计划、澳门科学技术基金发展会和深圳科创委等支持的重大科研项目，并拥有一项科研成果专利申请和抗体商业转化。

内容 | 庄雯

题图 | 彭卫

排版 | 小飞鱼

审核 | 刘一帆、黎晓玲

特别关注

为助力青年科学家的科研发现，华大时空组学发起“见‘微’知著——华大时空组学中国区青年科学家激励计划（第三期）”。该计划将支持广泛的科研领域，包括但不限于各类疾病研究（动物模型研究、病原微生物研究等），鼓励国内青年科研人员利用时空转录组FFPE产品方案进行微生物检测和宿主-微生物互作等的科学研究。

评审委员会最终将评选出5个科研项目，并为入选项目提供2-4个FFPE样本的时空转录组支持（芯片规格为1cmx1cm），华大智造将提供测序试剂支持。生化实验、测序和标准分析等服务和收费标准由合作单位提供。入选项目需在本年内完成执行。（点击报名）

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