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11分杂志推荐的文献检索神器,它比pubmed更好用!

科研小Z 科研Z库 2022-04-13



如果问科学研究的第一步是什么,那一定是文献检索,通过已经验证的知识我们总能有更多的新发现。


平常我们在进行传统的pubmed检索的时候,通常都是通过关键词进行检索。但是如果是基于句子水平来检索,则很难获得我们想要的结果。

今天这个安利,大家一定要好好吃下去!用好这几个小工具,让你的文献检索事半功倍!


LitSense

官网:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/research/litsense/

LitSense是一个独特的基于句子水平的生物学检索数据库,这个工具发表在了2019年7月的《Nucleic Acids Research》(IF=11)上。

通过输入固定的句子,就可以得到最佳匹配的文章及位置。可搜索PubMed中29百万篇文章摘要和PMC Text Mining (文本挖掘)Subset 中约300万篇全文文章中的五亿多个句子,并快速返回相关文献。

与PubMed相比,LitSense具有以下几个独特的功能:


LitSense检索

检索方式很简单,我们只需要输入想要检索的一系列关键词或一个查询句子,它就会通过最先进的神经嵌入方法,根据术语重合情况以及语义相似性找到文献中最匹配的句子并返回相关文献及其期刊。

如果不知道如何检索,LitSense网站上已经为我们准备好了范例

Try: "Breast cancers with HER2 amplification have a higher risk of CNS metastasis and poorer prognosis"

LitSense返回检索内容和查询语句至少相似60%的句子。如果没有则不会返回结果。如果我们要进行完全匹配的话,则可以通过双引号来进行检索。

对于检索结果的每个句子也有不同的标示。检索结果匹配到的单词会通过加粗来进行表示,如果是特定相关单词,会显示不同的颜色。



PubTator

官网:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/research/pubtator/

LitSense嵌套的PubTator是用于查看和检索全文生物医学文章中的生物概念注释的在线软件(即文本挖掘系统),可以为基因/蛋白质、遗传变异、疾病、化学物质、物种和细胞系等生物学概念提供自动注释并以不同颜色标注。

网站的使用相当简单,如何使用Pubmed,就怎么使用pubtator进行检索即可。



pubmed.icu


官网:https://www.pubmed.icu/

一款Pubmed本地化平台,整合了Pubmed、SCI-HUB、百度翻译,不仅可以检索文献和直接下载大部分文献,而且还可以在线翻译文献标题和摘要,用起来非常便利。



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