据统计,2020年发表的所有生信SCI共4165篇,其中纯生信(或仅含少量表达检测)文章3194篇,剩下的971篇生信实验类文章,其包含实验占比>30%。
其中IF>7的高分文章达到了192篇,IF>3分的文章也达到了2552篇!
而且从近十年数据来看,纯生信文章发表数量每年都呈上升趋势。临床预测模型作为临床研究的高级玩法,正成为越来越多人发表高分SCI的首选,生信仍是未来主流方式。2020年高分生信见刊数这么多,2021如何用最简单的方式,靠自己发高分生信SCI?
01、2021最新高分热点复现详细指导
5分复现:打破传统生信分析思路!差异基因结合微环境分析文章 |
5分复现:新手能轻松发表的类风湿关节炎生信文章 |
5分复现:不做实验可发的肿瘤免疫亚型生信分析套路 |
5分复现:生信SCI图表单基因生信文章技巧 |
6分复现:SND1基因在人泛癌中的作用纯生信SCI复现 |
7分复现:带你解析肿瘤预后模型研究套路 |
8分复现:肿瘤进展纯生信套路复现 |
8分复现:甲基化生物信息分析套路的应用 |
9分复现:基因组纯生信分析发顶刊的秘诀 |
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按照高分文献步骤复现,2020年别人发7分,2021年发表5分以上小问题!以2020年发表的6分纯生信SND1基因在人泛癌中的作用复现为例:重现操作步骤:首先打开TIMER2工具,点击Submit之后就出来图了,再点击PDF下载下来就OK,跟文章一模一样的图。拆分1:作者想表示出SND1在癌症组织和正常组织哪个表达更高。
拆分2:作者明确了基因的表达水平,现在就要明确SND1的蛋白表达水平了。拆分3:作者明确了基因的蛋白表达水平,现在就要明确SND1在不同肿瘤不同分期的表达水平。02、200篇纯生信SCI范文+复现步骤
(1)预后模型构建/biomarker筛选生信SCI列29篇:延续了2019年的生信研究热点,2020年诊断/预后模型、biomarker筛选的生信文章有增无减。(2)非编码RNA研究高分生信SCI共22篇:纯生信的ceRNA机制研究目前已经很难再发5分以上的文章了,想要发表非编码RNA研究的高分文章,生信分析加上表达量验证实验体外细胞表型实验已成为标配。(3)免疫治疗/免疫浸润相关生信SCI共14篇:预测肿瘤复发的可能性,分析患者免疫状态,筛选诊断生物标志物等研究,利用高通量生信分析无疑是行之有效的有力手段。
🌟思路1:生物信息学分析基因组改变与临床预后的相关性
中文题目:CDKN1B的缺失与非裔美国男性前列腺癌的转移相关
发表期刊:Clin. Cancer Res.(IF=8.911)🌟思路2:纯生信文章剖析免疫浸润及肿瘤微环境与骨肉瘤的研究套路中文题目:免疫细胞浸润及免疫相关基因在骨肉瘤肿瘤微环境中的分析发表期刊:Aging (Albany NY) (IF=5.515)思路3:生物信息学文章剖析肿瘤免疫分析的研究套路
中文题目:免疫分析显示葡萄膜黑色素瘤的免疫亚型预后不良
发表期刊:Aging (Albany NY)(IF =5.515)思路4:DNA甲基化相关的circRNA海绵调节与乳腺癌的研究套路
中文题目:乳腺癌中基于DNA甲基化介导的特色海绵功能的circRNAs预测
发表期刊:Front Bioeng Biotechnol.(IF=5.122)
对2020年所有生信文章的发表期刊进行统计,接收生信文章量大于30篇的期刊有29个,其中Front Oncol以181篇遥遥领先!以上期刊列表绝对能称作“生信友好期刊”,大家有需要投稿的生信文章,可以根据影响因子在列表中选择合适的期刊!
(1)生信必备实用软件+教程
01、R软件最新版本(包含珍贵万能代码)
①R语言初级教程(共90课时)
②R语言中级教程(共391课时)
③R语言高级教程(共146课时)
④Machine Learning Using R
⑤Machine Learning With R
⑥R数据科学
⑦R数据可视化手册
02、Graphpad Prism9 最新版本
①Graphpad Prism科研制图软件教程
②Graphpad科研论文绘图教程
03、Origin2020最新软件版本(包含安装教程)
①Origin PDF初级教程(新手必看)
②Origin最新更新高级视频教程(共72讲)
04、Image J 最新版本(包含安装教程及MAC版本)
①Image J实用插件下载及安装教程
②Image J科研论文作图(共10课时)
③Image J使用方法进阶系列教程(共10课时)
🌟01、生信必备绘图工具①CIRCOS:绘制圈图的神器,表格转为圈图②Omicshare:热图绘制工具③Exon-Intron Graphic Maker:根据序列长度等比例绘制gene的结构元件④Venny2.0:直接输入list后即可自动生成Venn图⑤OmicShare:绘制韦恩图工具⑥Ternary plot maker:绘制三元图工具⑦IBS:进行序列结构示意图绘制⑧WEGO:绘制GO注释结果图⑨iPath:进行可视化通路图在线分析⑩WebLogo 3:序列标识图绘制工具02、RNA二级结构
①Mfold:对序列的RNA二级结构进行预测和评分②RNAfold:在线RNA预测软件03、蛋白互作网络数据库①String:可按照蛋白质名称,氨基酸序列等信息进行检索②Pfam:蛋白结构域预测04、序列比对①ESPript:一款新型的多序列比对及可视化工具②NCBI-BLAST:运行速度比较快的多序列比对③MUSCLE:运行速度快的多序列比对④Clustal Omega:DNA、RNA、蛋白的多序列比对⑤ClustalW2:应用较广泛的多序列比对⑥T-Coffee:准确度高,速度慢的多序列比对⑦SimiTriX-SimiTetra:多序列比对相似性展示⑧MEME:从序列中找到新的、没有 gap的motifs⑨Weblogo:是一款经典的motif可视化软件05、Gene ID转化①BioMart:方便批量查找、转换各种编号的神器②g:profiler:基因组和通路信息与Ensembl数据库同步更新③UniPort Retrieve/ID mapping④bioDBnet:一个操作简单、覆盖全面的ID转换工具06、蛋白结构预测①SWISS-MODEL:蛋白三级结构预测②Phyre2:蛋白三级结构预测③Cap3:短序列拼接④Promoter Scan:启动子预测⑤PredictProte:蛋白一级结构预测⑥ProtParam tool⑦SignalP:信号肽预测07、富集分析①OmicShare GO富集分析工具②OmicShare KEGG富集分析工具③OmicShare:趋势分析工具08、基因外显子内含子①GEO+TCGA+Oncomine纯生信联合数据挖掘全套实操视频+万能代码如何获取以上生信分析全部资料?
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