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零代码、无实验复现8分+SCI,傻瓜式生信高招!(附详细操作教程)

科研小Z 科研Z库 2022-04-13

据统计,2020年发表的所有生信SCI共4165篇,其中纯生信(或仅含少量表达检测)文章3194篇,剩下的971篇生信实验类文章,其包含实验占比>30%。


其中IF>7的高分文章达到了192篇,IF>3分的文章也达到了2552篇


而且从近十年数据来看,纯生信文章发表数量每年都呈上升趋势。临床预测模型作为临床研究的高级玩法,正成为越来越多人发表高分SCI的首选,生信仍是未来主流方式。

2020年高分生信见刊数这么多,2021如何用最简单的方式,靠自己发高分生信SCI?


【一图搞懂:生信SCI撰写结构】

🔥不做实验

高分生信文章复现技巧

01、2021最新高分热点复现详细指导

5分复现:打破传统生信分析思路!差异基因结合微环境分析文章
5分复现:新手能轻松发表的类风湿关节炎生信文章
5分复现:不做实验可发的肿瘤免疫亚型生信分析套路
5分复现:生信SCI图表单基因生信文章技巧
6分复现:SND1基因在人泛癌中的作用纯生信SCI复现
7分复现:带你解析肿瘤预后模型研究套路
8分复现:肿瘤进展纯生信套路复现
8分复现:甲基化生物信息分析套路的应用
9分复现:基因组纯生信分析发顶刊的秘诀
以上内容真实有效,获取方式在文末


按照高分文献步骤复现,2020年别人发7分,2021年发表5分以上小问题!
以2020年发表的6分纯生信SND1基因在人泛癌中的作用复现为例:
重现操作步骤:首先打开TIMER2工具,点击Submit之后就出来图了,再点击PDF下载下来就OK,跟文章一模一样的图。

拆分1:作者想表示出SND1在癌症组织和正常组织哪个表达更高。


拆分2:作者明确了基因的表达水平,现在就要明确SND1的蛋白表达水平了。

拆分3:作者明确了基因的蛋白表达水平,现在就要明确SND1在不同肿瘤不同分期的表达水平。



02、200篇纯生信SCI范文+复现步骤

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03、2020年最热生信思路解读
(1)预后模型构建/biomarker筛选生信SCI列29篇:延续了2019年的生信研究热点,2020年诊断/预后模型、biomarker筛选的生信文章有增无减。
(2)非编码RNA研究高分生信SCI共22篇:纯生信的ceRNA机制研究目前已经很难再发5分以上的文章了,想要发表非编码RNA研究的高分文章,生信分析加上表达量验证实验体外细胞表型实验已成为标配。
(3)免疫治疗/免疫浸润相关生信SCI共14篇:预测肿瘤复发的可能性,分析患者免疫状态,筛选诊断生物标志物等研究,利用高通量生信分析无疑是行之有效的有力手段。

🌟思路1:生物信息学分析基因组改变与临床预后的相关性

中文题目:CDKN1B的缺失与非裔美国男性前列腺癌的转移相关

发表期刊:Clin. Cancer Res.(IF=8.911)
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🌟思路2:纯生信文章剖析免疫浸润及肿瘤微环境与骨肉瘤的研究套路
中文题目:免疫细胞浸润及免疫相关基因在骨肉瘤肿瘤微环境中的分析
发表期刊:Aging (Albany NY) (IF=5.515)
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思路3:生物信息学文章剖析肿瘤免疫分析的研究套路

中文题目:免疫分析显示葡萄膜黑色素瘤的免疫亚型预后不良

发表期刊:Aging (Albany NY)(IF =5.515)
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思路4:DNA甲基化相关的circRNA海绵调节与乳腺癌的研究套路

中文题目:乳腺癌中基于DNA甲基化介导的特色海绵功能的circRNAs预测

发表期刊:Front Bioeng Biotechnol.(IF=5.122)
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期刊推荐

29个最值得投稿的生信期刊

对2020年所有生信文章的发表期刊进行统计,接收生信文章量大于30篇的期刊有29个,其中Front Oncol以181篇遥遥领先!以上期刊列表绝对能称作“生信友好期刊”,大家有需要投稿的生信文章,可以根据影响因子在列表中选择合适的期刊!


全套操作

生信热门实用工具

(1)生信必备实用软件+教程

01、R软件最新版本(包含珍贵万能代码)

①R语言初级教程(共90课时)

②R语言中级教程(共391课时)

③R语言高级教程(共146课时)

④Machine Learning Using R

⑤Machine Learning With R

⑥R数据科学

⑦R数据可视化手册

02、Graphpad Prism9 最新版本

①Graphpad Prism科研制图软件教程

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03、Origin2020最新软件版本(包含安装教程)

①Origin PDF初级教程(新手必看)

②Origin最新更新高级视频教程(共72讲)

04、Image J 最新版本(包含安装教程及MAC版本)

①Image J实用插件下载及安装教程

②Image J科研论文作图(共10课时)

③Image J使用方法进阶系列教程(共10课时)


(2)60+生信必备工具
🌟01、生信必备绘图工具①CIRCOS:绘制圈图的神器,表格转为圈图②Omicshare:热图绘制工具③Exon-Intron Graphic Maker:根据序列长度等比例绘制gene的结构元件④Venny2.0:直接输入list后即可自动生成Venn图⑤OmicShare:绘制韦恩图工具⑥Ternary plot maker:绘制三元图工具⑦IBS:进行序列结构示意图绘制⑧WEGO:绘制GO注释结果图⑨iPath:进行可视化通路图在线分析⑩WebLogo 3:序列标识图绘制工具02、RNA二级结构
①Mfold:对序列的RNA二级结构进行预测和评分②RNAfold:在线RNA预测软件03、蛋白互作网络数据库①String:可按照蛋白质名称,氨基酸序列等信息进行检索②Pfam:蛋白结构域预测04、序列比对①ESPript:一款新型的多序列比对及可视化工具②NCBI-BLAST:运行速度比较快的多序列比对③MUSCLE:运行速度快的多序列比对④Clustal Omega:DNA、RNA、蛋白的多序列比对⑤ClustalW2:应用较广泛的多序列比对⑥T-Coffee:准确度高,速度慢的多序列比对⑦SimiTriX-SimiTetra:多序列比对相似性展示⑧MEME:从序列中找到新的、没有 gap的motifs⑨Weblogo:是一款经典的motif可视化软件05、Gene ID转化①BioMart:方便批量查找、转换各种编号的神器②g:profiler:基因组和通路信息与Ensembl数据库同步更新③UniPort Retrieve/ID mapping④bioDBnet:一个操作简单、覆盖全面的ID转换工具06、蛋白结构预测①SWISS-MODEL:蛋白三级结构预测②Phyre2:蛋白三级结构预测③Cap3:短序列拼接④Promoter Scan:启动子预测⑤PredictProte:蛋白一级结构预测⑥ProtParam tool⑦SignalP:信号肽预测07、富集分析①OmicShare GO富集分析工具②OmicShare KEGG富集分析工具③OmicShare:趋势分析工具08、基因外显子内含子
①GWAS Atalas:全基因组关联分析
②Gcorn plant:植物同源基因数据库
③qPrimerDB:实时定量PCR


(3)生信撰写全技巧教程
🌟【妥妥上五分】生信数据分析必看6个课件
①多个GEO数据联合分析
②GEO数据差异分析
③基于TARGET数据构建风险模型
④TCGA甲基化差异分析
⑤TCGA甲基化和基因相关性分析
⑥TARGET数据库差异分析
【快速发文】生信数据库深度挖掘最全教程
①GEO+TCGA+Oncomine纯生信联合数据挖掘全套实操视频+万能代码
②生物信息学芯片分析视频及源代码
③最新GEO芯片数据挖掘视频及源代码
④NIH的TCGA-topic大全
⑤TCGA-大文章
⑥GO数据库使用指南
⑦KEGG数据库的使用说明

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