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冲击2022国自然,这个标书写作辅助神器技术大牛都在用!

科研小Z 科研Z库 2022-04-13
标书写作神器——PolySearch,一种用于提取人类疾病,基因,突变,药物和代谢物之间的关系的基于网络的文本挖掘系统。

01PolySearch的由来
首先为大家简单介绍这篇文章,它是发表在NucleicAcidsRearch杂志上,它的影响因子是11.516,PolySearch---pubmed 发表。

看过了摘要的朋友应该都知道,该文章的作者想到了在目前为止科学研究的数据量极大,但是却不能有效的处理;还有目前研究的基因组学、蛋白质组学或代谢组学涉及很多全面的搜索,但是还没有开发有用的工具来支持这些搜索。因此,作者开发了PolySearchWeb服务器。

02PolySearch简介
网址:http://wishart.biology.ualberta.ca/polysearch
PolySearch是一款集成多搜索引擎的搜索工具,该搜索工具集成了很多实用的功能,通过该搜索引擎可以保存、记录你的搜索痕迹,该搜索引擎加入了很多智能的交互因素。

1、支持多种('poly')类型的数据库中的多种('poly')类型的生物医学文本搜索。一种可通过Web访问的工具,专门用于提取和分析人类疾病、基因/蛋白质、突变(SNP)、药物、代谢物、通路、组织、器官和亚细胞定位之间的文本派生关系。

2、PolySearch有着非常强大的功能,它支持数十种不同类型的文本,其次能够达到50种不同类别的查询,主要涉及到的方向是科学摘要和生物信息数据库的查询。它支持的查询方式是,“给定X,找到所有Y”,其中X或Y可以是疾病,组织,细胞区室,基因/蛋白质名称,SNP,突变,药物和代谢物等等。

3、PolySearch可以利用文本数据挖掘和文本数据的方式来挖掘,比较能够体现提取和分析PubMed数据的排列,跟另外的数据库做对比的话,它有一个非常显著的特点就是,它不仅仅能够提取和分析PubMed数据库,而且还能还可以实现提取和分析来自DrugBank,SwissProt,HGMD,Entrez SNP等跟多个数据库。


03PolySearch具体操作
接下来就是详细介绍PolySearc的操作。它的搜索功能涵盖了快速搜索和高级搜索两个,首先看看如何利用PolySearc进行快速搜索?

快速搜索操作:
1、PolySearch的程序员是用了标准的HTML和Perl对查询界面进行编写(如:下图中,搜索:结直肠癌相关的基因或蛋白质相关的研究)。

2、最后搜索出来关于结直肠癌与基因或蛋白质有关的研究的结果有109个,而且还把最可能的基因或蛋白质,做出了相关性的排序顺序

3、接着点击Hite,出现了结直肠癌相关的COX-2基因详细描述,其中包括了文献题目,还有文献种语句的描述。

4、最后点击Details,就能够得到文献中的详细描述了。

高级搜索操作:
知道了快速搜索的功能之后,是不是很期待高级搜索呢?不要急,小编这就给你详细的介绍它的操作方法。

1、在Adanced Options 中能够限定关键词/数据库等等(如:限定OMM数据库)。

2、最后点击提交,出现的结果是:

3、CheckResults栏,出现的结果是:

4、在这个工具栏中,能够用jobID号来检索以前的搜索结果。

5、“Thesaurus”栏搜索的结果是:
PolySearch的功能还是蛮齐全的,需要的小伙伴可以尽情操作起来哦,小编在这里给大家温馨提示,PolySearch已经更新到2.0版本啦!



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