CNS级绘图策略：Graphpad Prism自定义配色方案！
如果有些配色方案被多次使用，如ggplot2风格的带背景色的配色方案，则可以将其自定义为配色模板；此外，对于CNS等顶级期刊上面比较喜欢的配色方案也可以通过拾色器获取其颜色值，在GraphPad Prism中设置成自己的配色方案。
下面以ggplot2Set1配色方案来自定义配色模板。
1、在任意项目文件的Graphs（图形）表单下，单击工具栏中Change选项组的Change colors图标，并选择More Color Schemes选项，在Color Scheme界面的左下角单击Define ColorScheme按钮，如图1所示。
图1自定义配色方案
2、新弹出的Define Color Scheme界面分为4部分，如图2所示。
在界面左上角可以选择根据哪个配色方案进行修改，默认不选择（其实选择了当前配色方案）。
在界面左下角可以选择是在XY graph（XY图形）还是在Bargraph（柱状图）中进行预览，这里先选择Bar graph（柱状图）。需要注意的是，这两个图形的配色方案设置并不相同，一般在自定义配色方案时两种图形都需要重新设置。
在界面右上角可以自定义颜色，默认先在Data Sets（数据集）选项卡中修改表示图形的颜色，这是最重要的部分；旁边是Axes& Background（坐标轴&背景）选项卡，可以设置坐标轴和背景的颜色；上面是Objects（对象）选项卡，可以自行绘制或插入对象，还有Embedded Tables（嵌入表格）选项卡，这两部分基本不用修改，保持默认即可。
在界面右下角设置自定义的颜色方案只用在本项目中或者使用在任意模板中，必须选中Apply and save as a scheme named单选按钮，然后为自定义配色方案命名。这里再次强调，自定义配色方案务必选中此单选按钮，并单击OK按钮后才能真正修改配色方案，否则不起作用。
图2 Define Color Scheme界面
3、在界面右上角的Data Sets选项卡中选择需要修改的数据集编号（或单击<和>图标进行前后切换），即可对Data Sets选项卡中任意一个数据集单独进行颜色自定义，如图3所示。
图3 修改配色方案
4、但不建议在上一步骤直接定义每个数据集中每个选项的颜色。更方便的做法应该是进入Choose Color（选择颜色）界面之后，将配色方案中所有颜色都添加到Custom（自定义）选项组中，后续再进行颜色选择和设置，将会省事很多。
如图4所示，连续自定义颜色的方法分三步：
①在Custom选项组中选择一个空白小方块（不能省略，否则后续添加的颜色会默认覆盖第一个小方块颜色）；
②输入RGB值；
③单击Add to Custom Colors（添加到自定义颜色）按钮。循环操作这三步，将配色方案中的所有颜色都添加到Custom选项组中，单击OK按钮。
图4 连续自定义颜色
ggplot2Set1自定义的颜色的RGB值依次为：灰色（229,229,229）、红色（228,26,28）、蓝色（55,126,184）、绿色（77,175,74）、紫色（152,7,163）、橙色（255,127,0）、黄色（255,255,51）、褐色（166,86,40）、洋红色（247,129,191）、深灰色（153,153,153）。
5、现在可以在Define Color Scheme界面右上角依次为数据集中每个选项设置颜色了，如图5所示，这里直接从Custom选项组中调取刚刚设置的颜色即可。
建议从修改Bar pattern（柱状图图案）的颜色开始，因为修改Barpattern的颜色会使其他颜色发生联动变化，而先设置好Bar pattern的颜色再修改其他颜色则不会发生联动变化。此外，利用这种联动可以减少重复的颜色设置。
图5 设置柱状图下数据集的颜色
6、设置好Bar graph的颜色之后，切换为选中“XY graph”单选按钮，可以发现颜色并没有完全跟随Bar graph变化，毕竟这两种图形的设置项目不同。因此步骤5中设置数据集柱状图颜色的操作还需要在XY graph下再进行一遍，如图6所示。
图6 设置XY graph下数据集的颜色
7、在Axes & Background（坐标轴&背景）选项卡中设置坐标轴和背景色的颜色，如图7所示。这里将Plotting area（绘图区）设置为灰色（229,229,229），将Axes and frame（坐标轴和坐标轴框）设置为白色。
图7 设置坐标轴和背景色的颜色
8、完成设置之后，即可从Color scheme下拉列表中调用配色方案，如图8所示。
图8 调用新设置的配色方案
因为自定义配色方案中不包括网格线的颜色设置，所以需要自行添加白色网格线，如图9所示。其他无网格线的配色方案则无须进行这一步骤。
图9 添加白色网格线
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