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没数据也能发10分?protocol竟这么火,标书/论文实验都可用!

科研小Z 科研Z库 2022-04-24

Protocol(研究方案)论文是一类描述研究方法的文章。近年来,越来越多的高分期刊考虑接受研究设计类的文章,发表protocol论文成为一些医生晋升职称的救命策略。



01

近10年Protocol整体发文趋势


据web of science统计,Protocol论文发文数量近10年来一直在快速增长,2021年发表43,872篇,与2012年相比约增长2.16倍;该类型论文的热度值达到了70


其中2021年发文最多的国家依次为:美国、中国、英国。中国学者发表了7469篇,占17%


发表protocol相关研究最多的六个SCI医学杂志分别是Medicine, BMJ Open, Trials, Syst Rev, Int J Environ Res Public Health,和BMC Public Healthy。


参考下图,您可以在投稿选择期刊时更有针对性。需要注意的是,Medicine已经被中科院列为高危期刊,所以投稿时尽可能避开。


比较推荐的是BMJ Open和Trials这两个期刊,对于临床试验特别友好;meta分析的protocol论文则可以投Syst Rev;公共卫生领域的研究设计则可以投Int J Environ Res Public Health或者BMC Public Healthy。


IF=-1的标记意味着该期刊尽管被Medline数据库收录,但不是SCI收录期刊;部分是掠夺性期刊,投稿时要特别小心。


Protocol论文关注的重点疾病包括糖尿病,针灸,抑郁,精神卫生,中风等;进一步往下看,可以看到几乎涉及所有科室的疾病。


02

Protocol的5个核心要点


这篇IF=15.534的高分protocol文章发表于《European Journal of Heart Failure》。作为一种降糖药的它可以明显改善心衰患者的预后,这种获益与患者是否合并糖尿病无关,令人惊呼的结果离不开严谨的protocol套路研究设计。

图片来源:文献截图


【1】Protocol研究从哪里找?

1. 数据库来源

①Bio-protocol:发表经过同行评审的优质实验方案。

网址:https://cn.bio-protocol.org/cn/default.aspx

Springer Nature Experiments:包含生物医学领域的60 000+实验室可重复Protocol。

网址:https://experiments.springernature.com/


③Nature Protocol Exchange:由Nature Protocols赞助的Protocol开放存取库,是一个用于共享科学研究协议的开放存储库。

网址:https://protocolexchange.researchsquare.com


④Protocols.io:一个共享的Protocol平台,其中的每一篇Protocol都是动态、交互式的。

网址:https://www.protocols.io/

⑤Cold Spring Harbor Protocols:Protocol分类融合了研究领域和学科,里面的大部分文章都给出了step-by-step的实验操作流程。

网址:http://cshprotocols.cshlp.org/

⑥Morimoto laboratory,专注于热休克反应的调节和分子伴侣的功能

网址:http://groups.molbiosci.northwestern.edu/morimoto/

⑦JoVE:不仅提供step-by-step的实验方案,而且提供实验流程的视频讲解,使得研究者能够直观的看到实验的复杂细节。

网址:https://www.jove.com/


2. 部分文献会在Supplement里给出。

可以通过下载附件来查看。一些文献的研究方案就是以附件形式附录在后,仔细阅读学习后,对整个研究的了解会更深入,同时更能体会到高分SCI文章在研究实施时的全面和细节上的完善。


3. 学术期刊

Trials是临床试验发表protocol最有名的杂志,因为接受接受文章种类多样,包括Study Protocol,因此很多临床研究者会在上面发表自己的Study Protocol。


【2】Protocol如何设计思路?

参考循证医学金字塔,处在证据级别顶端的是系统综述及随机临床试验的结果,而观察性及病例对照研究则略逊一筹。因此,研究类型的选择也决定了文章研究水平的定位。


与所有论文一样,protocol论文的设计也需要有创新性和严谨性两个基本要素。而在具体实施过程中,study protocol则要求更为严格,包括:

  • 研究方案是后续的临床试验的基础;

  • 研究设计规范;

  • 提供所在机构的伦理批准和临床试验注册信息;

  • 按照特定格式(SPIRIT)撰写。


【3】Protocol 要完成临床注册吗?

答案:需要!

在发表 Protocol 的时候,临床试验注册是必不可少的环节,也是发表高质量 Article 的保证。这里介绍两个免费的注册平台:

  • Prospero:注册成功后可以得到该研究专有的一个以 CRD 打头的号码,用于写在自己的 Protocol 中。

  • 中国临床试验注册中心:对于英文吃力的同学比较友好,研究方案写好后,需要翻译成英文版本,一起提交注册。


【4】Protocol 需要医院伦理吗?

答案:需要!

作者可以向自己所在医院的伦理委员会索要需要提交的材料清单,包括研究方案的具体要求。把这个写好,中文Protocol基本就出来了。另外,上伦理会时还需要提供一些研究者的资料信息。



03

最新protocol资料汇总


好的 Protocol 是发表高分 Article 坚强的后盾。小编为大家带来最新整理实验protocol,「纸上谈兵」也能发表10+SCI!

超全Protocol研究类型写作攻略

【1】Protocol写作入门

1.什么是 Protocol ?

2.要发表 Protocol ?

3.临床有什么研究可以写成 Protocol ?

4.临床试验研究方案的基本内容

5.要点临床试验方案撰写设计思路

6.Study protocol
7.可以发表 Protocol的杂志
8.写 Protocol 前需要过医院的伦理吗?

9.写 Protocol 前需要完成临床注册吗?

10.写英文 Protocol 需要注意的点

11.搞定 protocol的网站合集

12.收好这份 Protocol,你就是鉴鼠专家

【2】临床试验方案设计:SPIRIT规范

1. Information

2.Introduction

3.Participants,intervention,outcomes

4.Assignment of interventions

5.Data collection,management,analysis

6.Monitoring

【3】临床试验纳入标准

1.如何定义数据集?

2.数据集的种类:意向性治疗分析集、全分析集、符合方案集、安全集

3.不同数据集的关系以及如何应用

【4】高效设计研究方案

1.如何选择研究因素,对象与效应?

2.5种随机抽样方法+3种随机分组方法

3.如何设置对照组:6种对照形式的选择

4.排除主观影响:盲法与重复设计

5.统计误差与偏倚如何规避

6.5种选择偏倚与6种信息偏倚

7.P值,OR,RR 与95%Cl,如何选择?

8.3种样本量估算方法与检验效能估计

9.如何撰写临床研究计划书

10.10大特点区分观察性和实验性研究

11.如何选择合适的研究对象与数量

12.5种研究类型的36个设计要点

写标书必备:实验protocl合集!

【1】不同研究方向实验技术protocl

1.表型确认

表达检测:高通量、核酸水平、蛋白质水平

表型验证:细胞增殖、糖酵解、纤维化等

正反回复:分子克隆、基因沉默敲除、基因突变

实验模型:细胞模型、动物模型

2.分子机制

下游分子通路:常见信号通路的标志物总结

基因在细胞中的定位:蛋白亚细胞定位、染色体定位...

Rescue实验:回复实验策略

3.直接作用机制

蛋白-蛋白、蛋白-RNA、蛋白-DNA

RNA-RNA、结合位点研究

分子修饰、可变剪切

【2】不同研究水平实验技术protocl

1.PCR技术

反向PCR、降落PCR、菌落PCR

免疫PCR、实时荧光定量PCR

重叠延伸PCR实验

2.RNA技术

mRNA的分离纯化

RNA标记、RNA反转录、RNA干扰实验

细菌RNA制备实验

siRNA表达载体的构建

RNA琼脂糖凝胶电泳

3.DNA技术

DNA纯化、DNA作图、DNA电泳

质粒DNA的提取

重组质粒的连接、转化及筛选

cDNA文库构建

甲基化检测原理及步骤

动物基因组DNA的提取

4.蛋白质技术

蛋白质含量的测定、免疫组化实验

western blot详细操作步骤

等电聚焦电泳法测定蛋白质的等电点

双向电泳操作步骤及相关试剂配制

蛋白质的表达、分离、纯化实验

免疫共沉淀Co-IP实验操作步骤

ELISA步骤、试剂及注意事项

蛋白质胶的制备

3.感受态技术

感受态细胞制备及转化实验(全)

农杆菌感受态细胞的制备与转化

真核细胞转染操作方法

细胞转染操作方法及各方法比较

质粒转染实验步骤

大肠杆菌感受态细胞制备实验(CaCl2法)

大肠杆菌转化实验(热击法)

6.细胞技术

流式细胞仪检测细胞凋亡操作流程

细胞凋亡检测方法汇总

原代细胞培养与分离

细胞周期测定实验

细胞迁移实验

T淋林巴细胞分离技术

细胞增殖检测MTT法

细胞原代培养、传代培养、冻存和复苏

TUNEL法检测细胞凋亡实验原理和方法

原代细胞培养和传代培养的方法

MTT法测定细胞相对数和相对活力

B淋巴细胞分离技术

常见细胞、动物实验技术总结

【1】8种不同实验方法全流程手册

1、WB实验流程、注意事项、数据处理及写作
2、IHC实验流程、操作技巧、注意事项、图像分析 
3、载体学相关知识、克隆构建等 
4、RNAi/MicroRNA/表达检测及数据库使用 
【2】实验必备效率软件1、自带分子克隆工具—benchling2、实验记录本—notability 3、专业共享电子记录本—Labarchives4、计算摩尔浓度—DailyCalcs
5、搜索限制酶—Restriction Enzyme Tool
6、自动数菌落—Promega Colony Counter

【3】58套细胞实验实操视频


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