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6月25日0—24时，31个省（自治区、直辖市）和新疆生产建设兵团报告新增确诊病例13例，其中境外输入病例2例（均在上海），本土病例11例（均在北京）；无新增死亡病例；新增疑似病例3例，均为本土病例（均在北京）。
当日新增治愈出院病例6例，解除医学观察的密切接触者625人，重症病例与前一日相比减少7例。
境外输入现有确诊病例84例（其中重症病例1例），无现有疑似病例。累计确诊病例1895例，累计治愈出院病例1811例，无死亡病例。
截至6月25日24时，据31个省（自治区、直辖市）和新疆生产建设兵团报告，现有确诊病例389例（其中重症病例8例），累计治愈出院病例78439例，累计死亡病例4634例，累计报告确诊病例83462例，现有疑似病例10例。累计追踪到密切接触者760818人，尚在医学观察的密切接触者8044人。
31个省（自治区、直辖市）和新疆生产建设兵团报告新增无症状感染者5例（境外输入4例）；当日转为确诊病例1例（无境外输入）；当日解除医学观察4例（均为境外输入）；尚在医学观察无症状感染者97例（境外输入57例）。累计收到港澳台地区通报确诊病例1686例。其中，香港特别行政区1193例（出院1088例，死亡7例），澳门特别行政区46例（出院45例），台湾地区447例（出院435例，死亡7例）。
据北京卫健委消息，6月25日0时至24时，北京新增报告本地确诊病例11例、疑似病例3例、无症状感染者1例；无新增报告境外输入确诊病例、疑似病例、无症状感染者，治愈出院病例1例。
6月11日0时至6月25日24时，北京累计报告本地确诊病例280例，在院280例。尚在观察的无症状感染者22例；无新增报告境外输入新冠肺炎确诊病例、疑似病例和无症状感染者，无在院病例。
新增确诊病例中，丰台区7例、海淀区2例、昌平区1例、大兴区1例。
全市有12个区无本地报告新增确诊病例，具体为平谷区自有疫情以来无报告病例、延庆区154天、怀柔区140天、顺义区138天、密云区135天、石景山区11天、门头沟区10天、房山区10天、东城区9天、通州区5天、朝阳区4天、西城区3天。
今年2月29日，北京市首次报告境外输入病例，截至目前，境外输入病例累计报告174例。昨天，第174例境外输入患者治愈出院。至此，北京市境外输入患者清零。
吴尊友预测：
7至10天左右，北京清零！
但可能还有波动
吴尊友此前曾公开表示，“北京此轮疫情已得到控制”，他仍坚持这个说法。“北京疫情继续呈向好趋势，预计7至10天感染人数初步清零。”中国疾控中心流行病学首席专家吴尊友，6月24日下午在接受中青报·中青网记者独家专访时说。不过，吴尊友也指出，清零并不代表问题被彻底杜绝。从目前的情况看，北京的病例数量可能会有一些波动——比如到清零之后还会出现零星的病例，对传染病来说，这是经常发生的情况。吴尊友介绍，清零后还需再观察一段时间，看能否彻底巩固。“当患者数量经过小波动后，持续一段时间再没有新病例发生，就表示传播被彻底阻断了。”他说，如果感染人数反弹，就需要在反弹后再次清零时，再观察一个周期（14天）。“对北京我们充满信心。”吴尊友预计，北京这次疫情的总病例数“应该不会突破400”。
曾有说法称，“武汉新冠肺炎病毒来自野生动物。北京新发地批发市场与武汉华南海鲜批发市场环境存在一定共性”。吴尊友对此表示，可以肯定地说，北京此轮疫情不是野生动物传播的。
在56天没有病例后，北京为什么突然出现新病例？他指出，对此轮病毒溯源的工作正在不断推进，目前尚未找到明确的原因。但前期调查显示，在北京出现的新冠肺炎病毒与欧洲毒株密切相关。吴尊友认为，北京此轮疫情的传染源可能是已感染的物品或人。具体来说，可能是一些在低温环境下保存的物品，低温环境使得病毒存活时间较长；或是复工复产后曾去过疫情流行区的新发地经营者；曾去过疫区或与病人有过接触的新发地购物者，这些人早已感染，但因症状较轻并未察觉，后将病毒带入新发地。北京和武汉疫情最早发生的地点都是市场，且都在海产品销售区域。为何在这样的局部环境下容易形成高病毒含量的传播中心？他表示，相关专家正前往新发地进行新一轮查证。“我们也在不断收集数据，来验证前述几种科学假设。”吴尊友坦言，要找到病毒真正的源头并不容易，像艾滋病从被发现到现在，已经快40年，也还一直在溯源。“不过，专家们都在从不同的角度努力，希望尽快找到病毒的来源。”