【科学代码】itol.toolkit：iTOL系统发育树注释美化辅助R包

itol.toolkit包是一个CRAN收录的开源R包。

（https://cran.r-project.org/web/packages/itol.toolkit/index.html）

主要用于系统发育树可视化在线平台iTOL的注释模版文件生成，自动化工作流为用户降低数据整理输入门槛，全面解锁iTOL的强大功能：

1. 23种模版功能支持

2. 一站式S4对象保存数据及样式实现可复现可视化

3. 自动化工作流简化输入数据准备门槛

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文档

系统发育树美化是一类应用实战属性极强的技能，用户需要大量丰富文档作为参考，模仿使用，套用实例，才能快速上手、举一反三。为此开发者配备了5类文档：

1.CRAN官方R包文档

https://cran.r-project.org/web/packages/itol.toolkit/itol.toolkit.pdf

2.在线英文文档

https://tongzhou2017.github.io/itol.toolkit/index.html

3.中文文档

https://mp.weixin.qq.com/mp/appmsgalbum?__biz=Mzg3NDczNjMzMg==&action=getalbum&album_id=2771807851647565826&scene=173&from_msgid=2247486002&from_itemidx=1&count=3&nolastread=1#wechat_redirect

4.视频教程：附含在该代码的使用说明里

5.直播演示（关注蔻享代码平台后续通知）

示例

1.标准示例

https://tongzhou2017.github.io/itol.toolkit/articles/Get_Start.html

2.单功能用户示例

https://github.com/TongZhou2017/itol.toolkit/discussions/20

3.文献复现示例1

https://github.com/TongZhou2017/itol.toolkit/discussions/9

4.文献复现示例2

https://github.com/TongZhou2017/itol.toolkit/discussions/13

软件

主页

https://github.com/TongZhou2017/itol.toolkit

https://code.koushare.com/#/code/codeDetail?codeId=310

蔻享

代码

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中国科学院海洋研究所徐奎栋课题组在读博士生周通

开发

人员

开源

类型

MIT

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编辑：黄琦

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