深度 | Omicron,更危险的新冠变种杀来了
The following article is from 纽约时间 Author ChineseInNY
感恩节期间的伦敦街头。
香港卫生部门发现首名感染者是本月从南非返回香港的一名36岁的印度籍男子,随后发现同一家隔离酒店住在斜对面房间的另一名62岁的中国籍男子被感染。据香港卫生署卫生防护中心称,这两名男子身上的病毒基因序列完全相同,表明是通过空气传播的。两人都接种了辉瑞疫苗。
官员们说,香港大学的进一步测序证实,这些病毒属于来自南非的新变种,不过他们承认,“目前还缺乏”有关该变种对公共卫生影响的信息。
南非的研究人员正在加紧跟踪新冠Omicron病毒新变种。该变种此前被称为B.1.1.529,本月在博茨瓦纳首次被发现。科学家们也在试图了解这种变异的特性,比如它是否能逃避疫苗引发的免疫反应,以及相比其他变异,它引起的疾病是更严重还是更轻微。
“我们正以迅速跟进,”约翰内斯堡金山大学的病毒学家佩妮·摩尔(Penny Moore)说,她的实验室正在测试这种变异基因躲避疫苗免疫和以前感染的可能性。摩尔补充说,在接种过疫苗的个体中有再感染和病例的轶闻报告,但“目前下结论还为时过早。”
急救人员正在南非一家传染病医院工作。
南非德班夸祖鲁-纳塔尔大学的传染病医生理查德·莱塞尔斯(Richard Lessells)在南非卫生部于11月25日组织的新闻发布会上说:“关于这种变异,我们还有很多不了解的地方。变异情况让我们感到担忧,但现在我们需要做的工作是了解这种变异的重要性,以及它对应对疫情的意义。”
研究人员还希望测量Omicron变种在全球传播的潜力,了解它是否可能引发新的感染浪潮。
变异飙升
研究人员在博茨瓦纳的基因组测序数据中发现了这种B.1.1.529变种。它之所以引人注目,是因为仅在刺突蛋白中就有30多个突变。ACE2受体是一种帮助创造冠状病毒感染人类细胞入口点的蛋白质,夸祖鲁-纳塔尔省大学的生物信息学家图利奥·德奥利韦拉(Tulio de Oliveira)说,这种新变体在ACE2受体上有10个突变。相比之下,Beta变种在ACE2受体上有三个突变,在Delta变种中有两个突变。这些突变与高传染性和逃避感染阻断抗体的能力有关。
但这种变异在南非豪登省(约翰内斯堡的所在地)的明显急剧上升,也敲响了警钟。据莱塞尔斯说,11月该省病例迅速增加,而且在学校和年轻人中尤为突出。德奥利韦拉说,他的团队在基因组测序和其他基因分析发现,他们在11月12日至20日从豪登采集的77个病毒样本中,所有病人感染的都是B.1.1.529变体。数百个样本的分析工作正在进行中。
莱赛尔斯说,这种变异带有一种突增突变,这使得它可以通过基因分型测试检测出来,而基因分型测试的结果比基因组测序快得多。来自这些试验的初步证据表明,Omicron的传播范围要远超过豪登省的范围。“这让我们担心,这种变体可能已经在该国广泛传播,”莱赛尔斯说。
疫苗的有效性
为了了解Omicron造成的威胁,研究人员将密切跟踪它在南非和其他地区的传播。南非拥有非常先进的测序技术,2020年底那里的研究人员率先发现Beta变种,现在,科研人员已经对Omicron展开了类似的工作。
摩尔的团队曾提供了关于Beta变种躲避免疫能力的首批数据,现已开始了Omicron的工作。他们计划测试这种病毒逃避感染阻断抗体以及其他免疫反应的能力。这种变异在抗体识别的刺突蛋白区域有大量的突变,可能会降低其效力。摩尔说:“我们知道的许多突变都是有问题的,但更多的突变看起来可能会导致进一步的逃避。”
摩尔说,计算机模型甚至提示Omicron可以躲避免疫系统另一个组成部分T细胞的免疫。她的团队希望在两周内得到初步结果。
英国牛津大学研究病毒进化的艾里斯·卡佐拉基斯(Aris Katzourakis)说:“一个紧迫的问题是,因为它有如此多的突变,是否会降低疫苗的有效性。”摩尔表示,在南非,接受强生、辉瑞生物科技或牛津阿斯利康三种疫苗的人群中,已经有突破性感染报告。
南非的研究人员也将研究Omicron引起的疾病是比其他变种更严重还是更轻微,莱塞尔斯说,“真正关键的问题在于疾病的严重程度。”
研究人员说,到目前为止,Omicron变种在南非以外造成的威胁还远远不清楚。摩尔说,目前还不清楚这种变体是否比Delta变种病毒更具传染性,因为目前南非的新冠病例数量很低。
卡佐拉基斯说,存在Delta变种高度流行的国家应该密切关注Omicron的迹象,“我们需要看看两种变体病毒在竞争中谁能抢先,以及新变种是否会增加流行。”