【最全】9篇mNGS专家共识速览（含下载）
编者语：聚焦mNGS
2022/6/21
宏基因组测序技术（mNGS）可以无偏倚地检测多种病原微生物，正在逐渐应用于临床感染性疾病病原检测。在新冠抗疫中，mNGS一战成名，为病毒早期发现、分型、溯源都做出了巨大的贡献。由于技术流程和解读的复杂性，业界对该技术的临床适应证、实验流程、质量管理、性能验证和报告解读等方面仍存在诸多困惑。专家共识的适时出现，有助于业界的良性互动，促进该技术规范和发展。
本篇汇总自mNGS临床应用以来的9篇专家共识内容概要，按时间倒序，文末附9篇共识原文下载链接，按需查阅。
目 录
概要速览
共识一：2022年6月
宏基因组二代测序技术在新生儿感染性疾病中的临床应用专家共识
首篇专注于新生儿感染领域mNGS应用的专家共识，肯定mNGS在新生儿重症监护病房（NICU）的院内感染防控方面具有独特的优势，强调必须在临床背景下解释mNGS的结果，特别是在临床样本中发现非典型或不常见的微生物时，应予以特殊关注，以确定其真正的致病潜力。
共识目标读者为儿科尤其是新生儿科的专业医生，有17条共识，主要内容涵盖：
从mNGS技术的临床适应证；
标本采集与转运；
报告解读；
共识二：2021年11月
中枢神经系统感染性疾病的脑脊液宏基因组学第二代测序应用专家共识
肯定脑脊液mNGS已经成为CNS感染病原学鉴定的重要实用技术。本共识能够帮助临床医生更合理、更规范地应用脑脊液mNGS并解读检测结果，提升mNGS在中枢神经系统（CNS）感染中应用的精准性。
共识主要内容涵盖：
临床适应证和送检时机；
标本的管理、检测、报告及实验室质控；
报告的临床解读；
共识三：2021年9月
宏基因组测序病原微生物检测生物信息学分析规范化管理专家共识
本共识系统梳理 mNGS 生物信息分 析中的关键环节，对常见问题提出了解决方案，但仍需强调结果解读应建立在临床拟诊及测序质量 有保证的前提下，由微生物专家与临床医生共同完成。
共识主要内容涵盖：
常用的生物信息学名词
mNGS生物信息分析的基本技术方案
生物信息学分析平台基本要求
共识四：2021年2月
宏基因组高通量测序技术应用于感染性疾病病原检测中国专家共识
共识对临床适应证、实验流程、质量管理、性能验证和报告解读一些关键问题给出了推荐意见和处理方法，有益于业界的良性互动，促进该技术规范和发展，为临床抗感染诊治提供帮助。
有38条共识，主要内容涵盖：
分类和术语适应证
基本流程和管理要求
质量管理保证
性能验证和标准化
共识五：2020年12月
高通量宏基因组测序技术检测病原微生物的临床应用规范化专家共识
主要内容涵盖：
临床应用的基本要求（适应证、标本类型及采集规范、报告解读原则）
mNGS检测病原微生物的实验室要求（实验室分区及人员要求、检测平台、生物信息平台）
mNGS微生物检测方法的建立性能确认（测序平台的性能确认、生物信息分析平台的性能确认、分析性能确认、性能确认的样本要求）
质量保证（质量要素、分析前、中、后）
共识六：2020年11月
中国宏基因组学第二代测序技术检测感染病原体的临床应用专家共识
共识就样本采集、分析解读和诊断效能等方面进行证据总结和意见推荐，共给出27条推荐意见。主要内容涵盖：
mNGS的适用范围（疑似中枢神经系统感染、疑似血流感染、疑似局灶性感染、疑似呼吸道感染）
mNGS的流程与质量控制
mNGS临床应用建议及其临床判读验证
mNGS在临床感染性疾病中针对不同病原体类型的诊断效能
mNGS在成本经济效益分析下的临床应用推荐
共识七：2020年9月
宏基因组测序技术检测感染性病原体江苏专家共识
有16条共识，主要内容涵盖：
mNGS 实验室的基本要求（实验室资质、符合生物安全实验室的基本要求、实验室的设置、实验室人员资质）
建立mNGS 技术平台上的实验方法及质量评估
mNGS 项目的性能确认及质量控制
mNGS 项目的报告内容及结果解读
共识八：2020年5月
宏基因组学测序技术在中重症感染中的临床应用专家共识（第一版）
主要内容涵盖：
检测与质控（检测设施设备控制、检测实验质控、测序结果的实验室判读控制、数据库建设）
规则及应用（不同病原体检测方法的特点、mNGS 报告解读规则、阴性结果的解读、阳性结果的解读）
mNGS 技术展望（耐药和突变的鉴定、mtNGS、多种因素对结果解读的影响、mNGS 时长的优化、临床数据和微生物基线）
共识九：2019年2月
宏基因组分析和诊断技术在急危重症感染应用的专家共识
共识主要内容涵盖：
mNGS 分析和诊断技术是急危重症感染 快速、精准诊疗的发展方向
mNGS 在急危重症感染患者应用的适应证
mNGS 检测的基本流程和质量控制
临床应用和结果解读原则
存在的问题
往期回顾
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