[含焦量10+]白尾鹿与老鼠，跨物种传染的焦虑
前段时间美国农业部有份报告特别火，说的是东部几个州的抽样检测显示，野生白尾鹿的新冠抗体阳性率超过三分之一。
结果老夫瞅了下原文：
这尼玛何止三分之一啊……
在密歇根州，67%的小鹿鹿抗体阳性。
这可就奇了怪了。
67%阳性率是啥概念？
当初新加坡把30多万移工关在集体宿舍里面同吃同住半年养蛊，最终养出来的抗体阳性率也不过47%而已。
然后再也没法推高了。
所以你一群马鹿何德何能，凭啥有67%阳性率？
更何况，小鹿鹿们也没在集体宿舍里同吃同住，
正好相反，按照wiki的说法，小鹿鹿们的生活习性差不多是这样的：
白尾鹿分布于加拿大南部、美国大部和南美洲北部。每年11～12月交配，一雄多雌，妊娠期196～210天,每窝产仔1～2只（多时3～4只）。幼鹿随母鹿生活1～2年，8个月性成熟。善游泳，能游过 6～14千米的水域。有季节性迁徙习性。不喜结群。当大雪或食物缺乏时，在适宜栖息和食物丰富处聚集4～5只左右。以草、灌木、嫩枝、菌类、坚果、苔藓为食。
不喜结群，食物缺乏时聚集4～5只左右。
不喜结群，食物缺乏时聚集4～5只左右。
不喜结群，食物缺乏时聚集4～5只左右。
（重说三）
朋友们请告诉我，这样的生活习性，怎么可能搞出来67%的阳性率？
别说新冠了，就算派麻疹出马没用好吧~
正在咱百思不得其解的时候，偶然听到了病毒学界巨咖、哥伦比亚大学教授、美国病毒学会前任扛把子Vincent Racaniello老师的盲猜：
简单听译：
对了，最近有没有听说白尾鹿，野生的白尾鹿感染了新冠？
这事儿就很有趣，它们到底怎么中的招？反正我猜它们不是从人类这边感染的病毒。
我猜它们不知怎么被啮齿动物传染了。
反正我家附近可没什么白尾鹿，它们从来不会接近我6英尺范围内（此处顺便影射美国6英尺安全距离的规定），所以肯定不是被我传染的，不是我的锅。
它们多半是被树林子里的啮齿动物传染了，所以这说明啮齿动物已经被感染了，so......boy！
啮齿动物，啮齿动物，啮齿动物！
（重说三）
说到动物感染新冠，一旦有啮齿动物参与，
那么相比之下，白尾鹿之类的，瞬间就变成了无关紧要的小问题……
对美国，或者说对全世界而言，真正大条的事件，可能是这个：
上周纽约城市大学和密苏里大学几位作者联合发了篇预印本，
话说为了监测纽约的新冠毒株变异情况，这几位作者连续几个月都在纽约周边14个污水处理厂采样。
结果一不留神就采到了惊天大瓜~
简单来说就是，作者们用了一些我们不需要理解细节的黑科技，可以测出污水样品中病毒残片刺突蛋白第412到579氨基酸位点的突变（RBD结构域就在这个范围），并且可以确认这些测出来突变点位是不是属于同一个RNA序列。
因此作者们可以通过突变点位的排列组合，进一步推算出污水样品中各个变异株的流行率（这里说流行率好像有点怪怪的…）
然后根据以上原理，作者们也真的在废水里测出了各种流行变异株，比如alpha、beta、gamma和delta等，并且跟纽约市感染者基因测序得到的流行率基本一致。
——详见下图：
如上图，左边是各个时间段感染者基因测序得到的各毒株流行率，右边是对应时间段污水测序得到的各毒株流行率。
不同色块代表不同毒株，详见右边注释框。
一切都挺正常对不对？
除了污水测序组里夹了一坨深蓝色块……
那一坨代表污水中的不明毒株（unknown waste-water lineage）。
本来污水样品里边有不明毒株倒也挺正常，因为对污水采样约等于是全局抽样，而纽约市并没有给所有感染者做测序。
但作者们进一步发现了两个疑点：
随着纽约疫情好转，确诊人数日益减少，深蓝色部分所占份额却越来越多，并且从增加的比例来推论，这部分的绝对数量并不受纽约疫情曲线影响；
深蓝色部分包含了四种闻所未闻的变异毒株：
各位你们看不懂图也没关系，你们不需要知道这四种变异株具体是啥。
你们只需要知道，现如今人类所有测序数据库的接近三百万条测序记录里面，完全找不到这四种，连依稀相似的都没有。
然后作者们进一步发现，这四个变异株唯一共同的突变点位——Q498，这货非常罕见。
截止7月26日，美国共有两个含有Q498H的测序记录。
宿主都是老鼠。
宿主都是老鼠。
宿主都是老鼠。
（重说三）
老夫可以再帮作者加点料啊~
老夫搜了下GISAID，国内也有三个含有Q498H的测序记录，
宿主也全部是老鼠。
——比如，请品鉴：
然后呢，前段时间华中农业大学金梅林老师在柳叶刀上发表了一个研究结果
Q498H突变是促进病毒感染老鼠的关键突变。
Q498H突变是促进病毒感染老鼠的关键突变。
Q498H突变是促进病毒感染老鼠的关键突变。
（重说三）
所以啊，白尾鹿超高阳性率的蹊跷似乎就解释得通了。
如果美国存在啮齿动物类自然宿主的话，那么不管是作为中间宿主传播还是通过水源粪口传播，引起鹿群大量感染都不是没有可能。
而且，妈耶……这种时候还需要在意什么白尾鹿吗？
对于人类来说，还有什么比生活在纽约这种大城市，无视人类疫情涨跌，持续向污水厂贡献病毒碎片的老鼠更可怕？？？
白尾鹿这种废柴，有必要的话直接全面扑杀就行。
纽约市的老鼠谁来扑杀看看？
说不定消灭新冠病毒都比灭鼠容易一点吧……
——焦虑警告又来了——
作者们显然不想就此罢休。
他们还在继续制造焦虑。
他们把纽约污水厂发现的四种神秘毒株放在慢病毒载体上（顺便拿D614G毒株做对比组），分别用来跟表达了人ACE2、大鼠ACE2、小鼠ACE2以及不表达ACE2的293ft细胞系做感染实验。
结果如下：
看不懂图没关系，老夫口述一下——从左到右四组柱子分别代表没有ACE2的293ft细胞系（对照组，只有跨膜蛋白酶）、有人ACE2的细胞系、有小鼠ACE2的细胞系，以及有大鼠ACE2的细胞系。
各种不同颜色的柱子从左到右分别代表原始毒株（D614G）、alpha毒株（A570D+N501Y）、四种污水神秘毒株，以及作为对照的慢病毒载体（neg）。
柱子越高则代表对应毒株越易感。
试验结论——
原始株（D614G）不能感染大鼠和小鼠；
污水中的四种神秘毒株非常容易感染大鼠和小鼠；
污水中的四种神秘毒株也非常容易感染人类。
怎么样，各位，有没有瑟瑟发抖？
作者们丧心病狂了，焦虑感已经冲破了天际……
他们继续拿污水里的四种神秘毒株针对BNT疫苗和两种单抗产品做了抗体中和实验。
——请品鉴：
看不懂图没关系，老夫帮各位打个总结啊——
四种神秘毒株里面有三种都表现出了很强的免疫逃逸能力。
SO...BOY!