[变异毒株]关于Omicron传染性的定心丸（和焦虑）

大家晚上好，

今天咱搬运两篇关于Omicron传播动力学的预印本，

算是给大伙儿贩卖一点久违的定心丸吧。

但在这之前，

请允许咱自吹一把~

——请品鉴啦：

（请看这里：[Omicron]请各位稍安勿躁，不要抢跑……）

↑ 以上是咱在2021年12月1日的原话，

大致是想说，

虽然大伙儿都看到了，

Omicron传播超快，

但这不一定是因为Omicron传染性比Delta更强，

也有可能是其他因素作祟~

所以在更多干货出来之前，

千万不能抢跑……

——以及，请再品鉴啦：

（请看这里：[含焦量10.0]扶上马，送一程，病毒也要搞共存）

以上是咱在2021年12月14日的原话，

大致是在盲猜，

Omicron和Delta传染性有可能差不多~

或者说Omicron的传染性最多也就比Delta高一丢丢而已~

总之，

辛辛苦苦等了一个月，

现在实锤终于出来了~

（还是丹麦人给力！）

——请品鉴：

简单来说，

这份预印本是丹麦哥本哈根大学和国家血清研究所一起搞的一次研究。

几位老师统计了2021年12月1日到14日期间，

丹麦所有家庭发生的新冠传播事件。

得益于丹麦完善的户籍系统和电子病历系统（且互联互通！），

然后更得益于丹麦（至少在去年12月份）还过得去的检测覆盖，

才最终有可能捣鼓得出来这么一份预印本……

总之，

老师们首先揪出来丹麦在2012年12月1日到4日之间总共11937例确诊病例，

然后他们在其中确认了6397起家庭续发传播事件，

再然后，他们通过PCR检测SGTF来判定了家庭续发传播所涉及的变异株，

（SGTF≈Omicron，SGTP≈Delta）

再根据各自的家庭构成、年龄段和接种状态来各种计算，

最终算出了Omicron和Delta各自的家庭场景续发率。

——顺便走个名词解释呗：

用人话来说，

正如上述手写笔记所示，

续发率可以间接衡量病原体传染性的（相对）强弱，

比如，

假设有A和B两种变异株，

如果A的续发率比B更高，

那么就可以很有把握地判断，

A的传染性也比B高。

那么，丹麦这次研究得出的续发率到底是啥造型呢？

——一图秒懂，请品鉴：

• 对于已经接种三针的家庭成员，Omicron的续发率差不多是Delta的2.5倍；

• 对于已经接种两针（或者有过感染史）的家庭成员，Omicron的续发率差不多是Delta的1.7倍；

• 而对于没有接种的家庭成员，Omicron跟Delta续发率几乎一样

重要的事情说三遍啊：

对于没有接种的人，Omicron跟Delta续发率几乎一样；

对于没有接种的人，Omicron跟Delta续发率几乎一样；

对于没有接种的人，Omicron跟Delta续发率几乎一样。

所以咯，情况大概就是这么个情况。

在没有疫苗和既往感染史拉偏架的情况下，

Omicron续发率29%，Delta续发率28%。

Omicron的传染性只比Delta高了一丢丢，

而且是不一定具有统计显著性的那么一丢丢。

再说了，我们都知道，

Delta就是个大箩筐，

啥玩意儿都能往里面装……

简单查询可知，

2021年12月初丹麦流行的Delta，

主要是AY.4、AY.43、AY.122和AY.126等，

——请品鉴：

而代表了Delta大家族传染性上限的AY.4.2.2，

其实并没有在丹麦冒过头~

（AY.4.2.2比丹麦这些废渣Delta传染性高10%以上）

所以咯，

就病毒内生的传染性（intrinsical transmissibility）而言，

正如咱之前一直推断的那样，

Omicron跟Delta果然是差不多的。

（而这一推论也跟国内某些城市跟Omicron初次交手的战绩大致吻合）~

怎么样各位，

这玩意儿显然算是一颗定心丸吧？

那为啥……

咱标题里边儿又说有焦虑呢？

因为啊

咱又得回头翻翻老文章了。

请看这里啊：[含焦量10.0]扶上马，送一程，病毒也要搞共存

——请品鉴：

↑ 之前的文章里面咱八卦过，

哈金森研究所巨咖Bedford老师搞了个模型，

看看上面的示意图，

基本可以一图秒懂~

总之，上图纵轴是Omicron和Delta的交叉免疫程度，

横轴则是Omicron的R0（假设Delta R0为6的前提下）。

然后黑色区域代表Delta被Omicron后浪推前浪；

黄色区域代表micron被Delta前浪推后浪；

而灰色区域则代表两边井水不犯河水，实现和平共存。

根据Bedford老师的意思，

一旦两者R0相差不大，

且没有明显交叉免疫保护的话，

Omicron和Delta就会进入共流行……

重要的话再次说三遍啊：

共流行、共流行、共流行……

这个情况对于国内来说倒没求所谓，

反正一个也是清零，两个也是清零，

0+0=0。

但对于躺平党们来说，

这可就是轮番上阵，双倍的舒爽啊

焦不焦虑？

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定性贩卖完焦虑，

咱回到主题，

继续八卦丹麦这篇预印本。

咱们已经看到，

Omicron的内生传染性跟Delta差不多，

那么它在世界各地风卷残云一般的传播优势，

到底是怎么体现出来的呢？

其实道理很简单~

一方面呢，

上面丹麦数据已经很清楚了~

Omicron针对没有接种、接种两针（及既往感染）和接种三针的人，

家庭续发率分别是29%、32%和25%……

翻译成人话就是说，

接种两针（和既往感染史）完全没法防止感染~

（不过那个29-32的负数应该也不代表啥ADE，而是统计误差或者行为模式差别）

接种三针也约等于不防感染。

而Delta那边，

上述三个数字分别是28%、19%和11%……

也就是说，

Omicron的免疫逃逸立功了，

或者也可以说，

疫苗拉偏架了

除此之外，

还有另外一方面的原因，

那就是，Omicron的代际间隔，

可能相对于Delta明显缩短了。

——比如说，请品鉴啊：

↑ 以上是剑桥数学天才Selby老师基于英格兰数据的测算，

Omicron在英国的平均代际间隔比Delta短了差不多四成，达到2.2天左右；

——再比如说，请继续品鉴：

↑ 以上是韩国建阳大学几位老师根据韩国Omicron初期感染链的计算，

Omicron在韩国的平均序列间隔刚好也是2.2天上下……

（序列间隔和代际间隔有相关性）

作为对比，

根据CCDC官方数据，

当初广州的Delta社区暴发，

平均序列间隔是2.3天，

平均代际间隔则是2.9天。

——请品鉴：

当然了，严格来说，

不同地区、不同时间和不同方法得出来的代际间隔数据，

没法直接横向定量比较，

但Omicron代际间隔比Delta更短这个情况，

应该可以说八九不离十了~

而这可能是国内正面应对Omicron冲击时需要注意的关键点之一。

以上预印本的原文请见：

SARS-CoV-2 Omicron VOC Transmission in Danish Households

Frederik Plesner Lyngse, Laust Hvas Mortensen, Matthew J. Denwood, Lasse Engbo Christiansen, Camilla Holten Møller, Robert Leo Skov, Katja Spiess, Anders Fomsgaard, Maria Magdalena Lassaunière, Morten Rasmussen, Marc Stegger, Claus Nielsen, Raphael Niklaus Sieber, Arieh Sierra Cohen, Frederik Trier Møller, Maria Overvad, Kåre Mølbak, Tyra Grove Krause, Carsten Thure Kirkeby

medRxiv 2021.12.27.21268278; doi: https://doi.org/10.1101/2021.12.27.21268278

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下面咱另外搬运一篇相关paper吧~

虽然也只是预印本，

但可以说是病毒学小圈子苦苦期待了两年终于盼到实锤的关键信息。

（今天刚刚被巨咖Vincent Racaniello老爷大力表扬过）

——请品鉴：

简单来说，这是咱公众号的常客之一，

日内瓦大学Isabella Eckerie老师的最新力作~

翻译成大白话就是，

Eckerie老师他们总共采样了384份拭子，包括：

• 118份未接种的杂牌毒株感染者拭子；
  

• 127份未接种的Delta感染者拭子；

• 121份已完全接种的Delta感染者拭子，
  

• 以及18份已完全接种的Omicron感染者拭子，

• 所有采检均在病例发病后五天内完成。
  

然后他们完全不嫌麻烦，

给384份拭子全部做了灶斑形成测定（focus-forming assay，FFA），

（FFA是定量测量活病毒载量的金标准之一，适用于CPE效应不大明显因而没法做斑块测定的病毒，比如Omicron）

接下来他们又横向比对了FFA结果和PCR检测结果……

结论简直可以说是颠覆认知，如下：

• PCR检测的CT值（也就是病毒RNA滴度），跟FFA培养出的活病毒载量相关性很低；或者翻译成人话就是——PCR检测的CT值不能说明感染者传染力强弱

• 作为验证，Eckerie老师他们又横向对比了杂牌毒株和Delta（在未接种感染者身上）的CT值，结果杂牌毒株们的CT值反而更低；但FFA结果则刚好相反，Delta的活病毒载量明显胜出

• 以及，Delta的FFA活病毒载量高峰出现在发病后第3-5天，而杂牌毒株们的FFA活病毒载量高峰则出现在发病后第0-2天。换句话说就是Delta的排毒时间更长；

• 最后，Eckerie老师他们比较了Delta和Omicron（在已接种感染者身上）的PCR检测CT值和FFA活病毒载量。结果两边基本打平，Delta还略微胜出一丢丢

——请品鉴：

↑ 上图左边是PCR检测的RNA拷贝数（log10），

右边则是FFA测定培养出来的活病毒载量（FFU/ml）。

蓝色圆点代表Delta，

橙色圆点则是Omicron。

（照惯例，绿色辅助线又是咱的灵魂画作）

所以……那些八字都没一撇就恶意抢跑的煞笔们呢？

要不要出来走两步？

你们不是号称Omicron传播快的原因在于

“上呼吸道复制效率高70倍”，

所以鼻子呼出的病毒载量更高吗？

看见没有？

现在Eckerie老师实锤显示，

Delta和Omicron的病毒载量基本一样的，

甚至Delta还略高一筹~

惊不惊喜意不意外？

所以啊，品鉴到最后，

以上两篇高质量预印本的结论，

居然不谋而合了~

Omicron摧枯拉朽席卷世界的主要原因，

正如咱一直强调的，

是免疫逃逸，

是免疫逃逸，

是免疫逃逸，

（以及代际间隔短）

而不是什么传染性强或者病毒载量高

重复一遍啊，

以上事实对国内来说，

说不定算得上是定心丸，

因为免疫逃逸这玩意儿，

它在国内基本没啥鸟用，

反正也完全逃不脱物理隔离的天罗地网……

但对众多打完疫苗随便浪的躺平党而言呢，

这玩意儿可能就要了亲命了~

……

……