[凑个数] 香港仓鼠事件的一点更新
❶前言
❷ 帝国主义的反攻倒算!(大误)
❸ 今天的最新进展
简单来说,
在昨天更新之后,
仓鼠事件又有如下进展:
首先,第二轮环境采样结果:涉事宠物店29个仓鼠笼样本有5个阳性,仓库51个仓鼠笼样本有11个阳性;
然后,位于元朗的另一家宠物店仓鼠笼样本检出阳性;
再然后,到店中招的顾客,他们家的男主人也正式检出阳性;
以及,勘个误。昨天说到店的顾客母女俩一起中招,实际情况是只有母亲中招,女儿是阴性(不过这事儿不能赖我啊各位……官方通报用词是asymptomatic,所以咱以为女儿是无症状感染者来着
) 最后,等了两天的全基因组测序结果(全长序列)终于出来了,下面详细八卦。
——流调示意图走一个(以后不定期更新):
❹ 下面是重点……
在昨晚(2022年1月19日)放出初步的刺突蛋白S1区域序列之后,
今天下午,香港卫生署又放出了3份全长序列,
分别对应中招的三位人类感染者(店员桑、顾客阿姨和她老公)
——请品鉴:
然后根据知乎某大佬剧透,
阳性仓鼠的测序也搞完了,
环境样本则正在处理~
希望尽快能上线吧~
——请品鉴:
总之,根据现有消息,
店员桑和顾客夫妇的序列比对结果,有4个nt的差异;
顾客夫妇的序列则几乎完全一样;
然后店员桑和仓鼠的序列……有1个nt的差异
(仓鼠序列还没上线,这一条是知乎大佬剧透的)
所以这可就奇了怪了……
因为这种情况就等于说,
店员桑和顾客桑之间,
并没有发生人传人
但她们却实实在在地前后脚分别中招了……
其中,店员桑几乎可以确定是被仓鼠传染的~
所以,难道,
仓鼠传人的倒霉事件居然不止发生了一次……
而是有可能一前一后发生了两次
下面咱照例撸一撸演化树呗~
——请品鉴:
↑ 如上图,
红色小圆点代表香港这边的序列(女店员桑)。
正如知乎大佬剧透的那样,
荷兰上传的公开数据里头,
并没有发现相关序列,
(当然了,香港及周边那是更加没有)
亲缘关系最接近的,
(居然)是捷克上传的……
并且采样日期也比较晚近(12月8日)。
另外,简单搜索可知,
捷克刚好算是欧洲范围内仓鼠分布比较多的地方之一……
所以咱去请教了一下专业人士们,
对此,咱公众号的老熟人Peacock老师表示:
Peacock老师:
- and dont know if we have any molecular markers for hamster adaptation as sars2 viruses usually replicate in them without any need
翻译成人话(顺便加点料):
这演化树分支可真不短啊……
大概也许可能在仓鼠养殖场里头稳定蔓延了一段日子了吧?
(一个多月时间突变了7个nt,是挺长了)
另外不知道有没有可以对应仓鼠感染的适应性突变,
因为这玩意儿本来就超级易感的,
既然本来就能轻松复制,
何苦还搞个啥特征突变出来呢
(言下之意就是昨天提到那个罕见的D427G突变,很可能并不是仓鼠的标志突变,而只是单纯的巧合……)
总之,情况就是这么个情况:
香港那边发生了仓鼠传人,
这一点基本等于板上钉钉了~
(除非强行扯什么物传人……)
并且根据测序结果,
很有可能发生了两次独立的仓鼠传人事件。
然后这个序列在直接出口国荷兰并没有找到相关记录,
但如果真是仓鼠养殖场隐匿流行的话,
本来也没法指望找出啥特别相关的记录……
反而是居然能匹配到一个多月之前的捷克序列,
这倒是挺意外。
不过可能序列比对这条路就只能到此为止了……
因为正如Peacock老师所说,
仓鼠这货太易感了,
以至于说不定完全找不出啥标志突变~
或者用人话来说就是,
人类流行啥变异株,仓鼠那边就能流行一毛一样的变异株
掀桌啊!
❺ 例行贩焦
最后,贩卖一点不大相关的焦虑吧~
知乎那边,以及其他平台上,
似乎弥漫着一股鸵鸟党的思潮,
认为“宠物那么可爱!宠物一定不会传染人!”
——比如这样的:
……
……
醒醒吧~
GISAID上面各种跨物种传来传去的序列太多了……
比如说啊,
——拉脱维亚的猫传人请品鉴一下啊:
惊不惊喜意不意外?