RNAmod: m6A peak 注释神器

像诗像风也像秋

1引言

分享一个 m6A peak 在线注释 的强大在线工具 RNAmod。功能非常多,比如 peak 注释,Go/KEGG 富集分析,绘制 metagene plot,motif 富集等等。

网址:

https://bioinformatics.sc.cn/RNAmod/index.php

文章:

发了一篇 NAR:

可以单个样本也可多样本分析!

2基本使用

选择物种及上传我们的 peak 文件,直接粘贴也可:

然后是一些参数的选择,默认即可,最后 submit 提交等待:

会显示当前进行到哪一步了:

流程

结果

还可以打包下载所有的数据文件,对图不好看的还可以拿数据自己重新绘图哦!

3测试结果

我自己试了一个 peak 数据进行注释:

类型注释:

基因类型注释:

---

metegene-plot:

motif 富集:

通路富集结果:

其它富集:

其他的就不一一展示了。

下载结果

最后在这里下载:

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所以今天你学习了吗？

今天的分享就到这里了，敬请期待下一篇！

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