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不懂就问 || MS建模精品免费公开课答疑第二弹~


MS建模公开课课后解答第二期
终于来啦!
公开课上的内容都会了没
不会也没关系往下看
老师带着答案走来了

提问!回答!
 1  如何测出两个面之间的距离?

答:演示异质结时候只是演示方法,具体的界面间距请参考文献或者优化后的数据。如果指的是COF搭建层间距如何确定,粗搭时候层间距选择3.5A比较合理。
 2  我想问下如果建立异质结,2种材料的切面是如何选取的,何时取001面亦或者取010面110面这些面?
答:根据高倍投射,XRD,文献,晶习研究等证据去确定。
 3  老师关于异质结的计算能用CASTEP么?
答:能。
 4  需要考虑层间的相互作用么?
答:需要。
 5  uv与ABC有什么关系?
答:一个是对切面的一个是对三维结构的。
 6  怎么建把COF材料包裹在碳纳米管表面?
答:搭建结束后复制粘贴过去。
 7  2个物质复合,如何选取哪个晶体面?
答:根据高倍投射,XRD,文献,晶习研究等证据去确定。
 8  老师添加原子的小窗口从哪里调出来的啊?答:或者Build-addatoms。
 9  切成特定形状对计算有什么促进作用吗?
答:不是为了加速或者促进计算而且某个面,而是根据实验结果来且需要计算的面。
 10  超出盒子的分子不用删吗?
答:如果指的是非晶胞的搭建,不用在意因为盒子是周期性的,其实那些会到镜像的另一个盒子中,同样的当前盒子中肯定也有空间给旁边盒子中伸出的多出来的部分一定的空间。
 11  非晶晶胞需要优化吗?
答:需要,为了去除不合理接触。一般搭建时候AC模块调用合适的力场以及进行了优化了,那么就可以不用多此一举,直接进行界面吸附模型搭建就可以。
 12  如果是几个小分子分散在金属团簇旁怎么办。比如Au20与10个水分子?
答:如果是指构型构象搜索等内容,推荐使用卢天老师的Molclus,如果是想要金属团簇围上水的模型,可以将金属团簇放到水盒子中进行冻结了金属团簇的优化,然后使用Atom selection做出水包围金属的模型,选取时候注意使用select fragment。
 13  构建layer后左右出来怎么办?
答:使用Build layers里面的Layer detail里面的参数进行调节。
 14  聚合物吸附晶面,聚合物分子数和链长怎么选?
答:根据实际可接受的计算量等信息区确定。链越长越真实,但是如果因此削减了胞内链的数量就有些得不偿失了。千万不要做链长特别长,胞内只放几条链的那种计算。
 15  吸附模型中,真空层需预留多少再跑动力学?
答:理论上越高越好,个人建议最起码超过范德华截断距离1.5倍以上。


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