Journal of Proteomics | 联合蛋白质组学和转录组学技术鉴定白色霞水母刺蜇相关的毒素

 

联合蛋白质组学和转录组学技术鉴定白色霞水母刺蜇相关的毒素

Combined proteomics and transcriptomics identifies sting-related toxins of jellyfish Cyanea nozakii

发表年份：2016

发表期刊：Journal of Proteomics

影响因子：3.914

发表单位：中国科学院海洋研究所李鹏程课题组

关键词：水母，毒素，转录组，蛋白质组学

 

研究背景

近几十年来，水母蜇伤已成为威胁全球沿海地区人类健康和安全的严重问题。每年都会有数十万人被蜇伤，受害者将面临严重的痛苦，如瘙痒，肿胀，炎症，风疹甚至更严重的后果。白色霞水母是中国沿海广泛分布的一种含毒素水母。目前尚不清楚水母毒液中存在多少种类型的毒素，因此全面了解水母毒液组成，有助于有效治疗水母蜇伤。

研究方法

为进一步了解水母毒液组成，本研究利用转录组学和蛋白质组学整合分析技术对白色霞水母的毒液的组成进行了分析。

取样：活水母新鲜触手组织

研究发现

转录组学分析数据共获得4,608,524条reads；de novo组装后共得到40,434个unigenes。蛋白质组学分析数据中，总共产生了311,635个MS / MS光谱以及12,247个独特MS / MS光谱，最终鉴定到1556个同源蛋白质。确定了174种潜在的毒素蛋白质，其中27种蛋白质与有毒动物的毒素同源，包括磷脂酶A2，锌金属蛋白酶—整合素Agkistin，丝氨酸蛋白酶抑制剂，plancitoxin-1，阿特拉斯毒素Lt1a等。

本研究首次对白色霞水母的转录组学和毒液蛋白质组学进行了研究。研究结果对白色霞水母毒液组成有比较全面的了解。此外，本研究结果也可能对新生物活性蛋白的发现以及对水母蜇伤的有效治疗的发展非常有帮助。

图 四种水母的毒素蛋白质比较

参考文献

Li R, Yu H, Yue Y, et al. Combined proteomics and transcriptomics identifies sting-related toxins of jellyfish Cyanea nozakii.[J]. Journal of Proteomics, 2016, 148:57.

本研究中的转录组测序及蛋白质组学分析由联川生物提供

回复“白色霞水母+邮箱”即可获取原文

如需讨论，请留言给小编~

我们的技术专家会给您专业的答复哦~

---

相关阅读: