35篇10分+文章带你看懂翻译组 | 翻译组

前情回看

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经过前几期的介绍，小伙伴们对翻译组的由来、基本概念、生物学意义、检测方法是不是都有了一些自己的理解。接下来我们就要进入大家最感兴趣的部分，翻译组的研究思路分析。先别急，本期先从文章发表情况，来看看翻译组研究处在的阶段。看看采用Ribosome profiling（Ribo-seq）技术的翻译组研究都发表了哪些水平的文章，我们以2018年发表的文章为例。下面我们就一起看图说话。

图1 翻译组文章历年统计

数据来源：PubMed上使用关键词（"ribosome profiling" OR "Ribo-seq"）检索

翻译组文章从2008年的1篇起步，截止到发稿，已累计发表515篇研究文章。500多篇多吗？对比下我们无比熟悉的转录组（transcriptome），文章数已超过55000篇，翻译组不到它的百分之一。这样比较可能不太公平，我们来和目前的热点RNA甲基化（m6A）比（还不知道m6A的，可点击文末“阅读原文”了解详情），目前可以检索到近1000篇文章，也差不多是翻译组的两倍。在2017年，m6A文章数（123篇）正和2018年的翻译组相当（见图2）。翻译组研究显然还处在研究的早期，大有文章可做。从图1看翻译组发表文章的趋势，近5年文章数量是以年均20%的速度在快速增长。

图2 RNA甲基化(m6A)文章历年统计

数据来源：PubMed上使用关键词（m6A）检索

截止到发稿，2018年翻译组已发表文章122篇。在这122篇文章中，近30%的文章（35篇）超过10分，这还不算厉害的；这35篇文章中，超过一半（16篇）发表在Nature，Cell的主刊或子刊上，感觉我们找到了新的高分神器（见表1）。这些高分文章的研究对象主要集中在人，小鼠，果蝇，拟南芥，E. coli，酿酒酵母等物种上；研究领域包括翻译调控，RNA甲基化(m6A)与翻译的关系，细胞器如线粒体、叶绿体的翻译组，以及分析工具和数据库开发等。在这些高分研究中，最常见的研究技术组合是Ribo-seq+RNA-seq，也有和蛋白质组定量技术如SILAC、TMT，芯片，或是其他新技术如Rend-seq的组合。

表1 2018年翻译组10分+文章概览

尽管少于人和动物研究发表的文章数量，2018年在植物翻译组领域也有多篇高水平研究工作发表（见表2）。其中超过10分的有2篇文章，分别发表在Nat Plants（讨论绿藻和陆生植物叶绿体翻译的共性和差异）和NAR（讨论拟南芥线粒体翻译组）。发表在ACS Synth Biol上的文章，基于Ribo-seq和转录组数据，发现了拟南芥中非编码RNA编码的肽。

表2 2018年植物翻译组文章概览

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以上选取了2018年部分代表性的翻译组研究工作做了分析，后面会为大家做详细的案例解读，并提炼其中的翻译组研究思路。

需要表1，表2所列文献的小伙伴，可回复“翻译组高分文章”获取下载地址。

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