不同样本的差异通路如何绘制热图？ | 生信快闪

摘要：本例是以通路的p值信息做热图，列名是样本或比较组，行名是通路，图例范围0~0.05，颜色越深p值越显著。可以优先研究在不同比较组中颜色深浅存在差异的通路。

绘制需求

以p值数据作为对象绘制热图：

1.不做聚类树；

2.不做数据处理，直接使用输入数据作图；

3.图例范围0-0.05；

4.颜色从0-0.05，由深至浅渐变。

输入文件

第一列：对应热图中的行名（根据您的需求而定，如：基因名、通路名、GO条目名......）。

第二列~末列：样本列，一列对应一个样本的数据信息，样本列的个数决定了热图的列数。

数据区域：除第一行和第一列的剩下单元格都是数据区域。可以是表达量、p值等任何您想展示的信息，根据您想表达的意义而定。本例是p值信息，表达的意义是通路显著性，可以优先研究在不同比较组中颜色深浅存在差异的通路。数据必须是数字，不能是文本，热图中的颜色渐变就是根据这些数字来决定的：默认最大值和最小值对应配色方案中的两个颜色，剩下的数据在中间过渡颜色中分配，从而实现数字到颜色的转换。

分析参数

在云平台云工具中绘制-热图：http://www.lc-bio.cn/overview/8?tools=Heatmap_V2.16

以下是在网页上需要设置的参数：

操作视频

辅助材料

云工具-热图：http://www.lc-bio.cn/overview/8?tools=Heatmap_V2.16

输入数据、输出结果、使用文档、操作视频等资料都统一放在联川生物云平台的“SOP-云平台”模块，供大家后续回顾：http://www.lc-bio.cn/admindetail/1125

云平台目前已开放注册，操作说明见：http://www.lc-bio.cn/admindetail/852

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