为什么别人家的相关性图是那么sa,差异上下调有不同的颜色,我也想要,怎么办?不要羡慕,联川生物的云平台可以满足你,文献中的图形应有尽有,在这儿可以随意修改颜色,选择不同的图形展示。
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使用范围:所有两组学数据的相关性分析;不仅可以可以在线调整差异阈值;计算相关性系数;而且图形清楚地展示两组学中具有不同表达差异的信息,可以帮助老师快速找到与预期变化一致的候选基因。
输入文件的格式必须要与示例文件格式一致,可以点击下载示例文件按钮查看;(1)输入文件必须是表格xlsx,且必须含有3个sheet,默认sheet1是X轴作图数据,sheet2是Y轴作图数据;(2)sheet3中对应关系的顺序必须是第一列与sheet1中的第一列一致,第二列与sheet2中第一列一致;且标题也必须一致,否则会报错提示的。(3)输入文件的大小要求:每个sheet的行数必须小于3万行,否则会报错提示。(1)数据处理:这里的数据处理只是作图需求,为了图上的点更密集;后续的差异筛选依然是根据原始的FC值;
(2)差异阈值筛选:根据每个组学的情况设置差异条件;该阈值是判断差异信息,只有2组学同时差异才标记为yes,否则都标记为no。补充:2组学的FC和P值是互不影响的;当不筛选FC时,FC值可设置为0;当不筛选p值时,p值可设置为大于1的数值。简单的散点图,经典的箱线图,精准的分面图,多种选择,可以满足你所有的需求。高级功能分为2类:当图形选择为显示yes-no和显示差异上下调时,只有颜色模块,此时可以调整点的颜色;当选择显示分面时,可以调节显示需要的分面以及分面点的颜色。当图形选择为显示yes-no和显示差异上下调时,才能调整该模块的功能。参数调整完成后,可以下载所需要的格式保存,同时还可以修改保存文件的名字,另外保存为PPT的文件还可以在ppt中对图形进行修改,真的太棒了,所有你没想到的在这里都可以实现。表格中包含数据处理和差异统计2个sheet,其中数据处理中前4列是组学1的数据,中间4列是组学2的数据,后4列是差异结果。protein_Sig列:组学1同时满足FC和P的阈值才标记为yes,否则为no;mRNA_Sig列:组学2同时满足FC和P的阈值才标记为yes,否则为no;Sig列:两组学差异同时为yes则标记为yes,否则为no;up_up:两组学差异同为yes,组学1上调,组学2上调;up_down:两组学差异同为yes,组学1上调,组学2下调;down_down:两组学差异同为yes,组学1下调,组学2下调;down_up:两组学差异同为yes,组学1下调,组学2上调;no_no:包含两组学都不差异的和两组学中任意一组学不差异的;好了,到这里两组学相关关系图形的绘制已经介绍完毕,是不是很期待,那就赶快去点击联川生物云平台吧!