Nature子刊等近30篇用户文章 | 12月用户文章

12月，联川客户总计在Nat Commun、Theranostics、Clinical Cancer Research、New Phytologist、Horticulture Research、J Cachexia Sarcopenia Muscle等杂志发表了近30篇文章，内容范围涵盖单细胞测序、m6A测序、全转录组测序、miRNA测序、降解组测序等多个方面，文章详情如下。

Reproductive phasiRNAs regulate reprogramming of gene expression and meiotic progression in rice

水稻生殖期phasiRNAs调控基因表达和减数分裂的重编程

发表单位：中山大学

发表期刊：Nature Communications

影响因子：11.329

技术手段：降解组、全转录组测序、miRNA测序

Single‐cell RNA sequencing and lipidomics reveal cell and lipid dynamics of fat infiltration in skeletal muscle

单细胞转录组+脂质组学揭示骨骼肌中脂肪浸润的细胞和脂质动态

发表单位：浙江大学

发表期刊：Journal of Cachexia, Sarcopenia and Muscle

影响因子：9.802

技术手段：单细胞转录组、转录组测序、非靶代谢组

Human oral microbiome dysbiosis as a novel non-invasive biomarker in detection of colorectal cancer

人类口腔微生物群失调作为一种新的非入侵生物标志物检测结直肠癌

发表单位：复旦大学，复旦大学上海医学院

发表期刊：Theranostics

影响因子：8.854

技术手段：16S测序

Gut microbiome components predict response to neoadjuvant chemoradiotherapy in locally advanced rectal cancer patients: a prospective, longitudinal study

肠道菌群预测局部晚期直肠癌新辅助放化疗的疗效

发表单位：复旦大学附属肿瘤医院

发表期刊：Clinical Cancer Research

影响因子：8.738

技术手段：16S测序

High CO₂‐ and pathogen‐driven expression of the carbonic anhydrase βCA3 confers basal immunity in tomato

碳酸酐酶βCA3在高浓度CO₂和病原体驱动下的高表达赋予番茄基础免疫力

发表单位：浙江大学

发表期刊：New Phytologist

影响因子：8.512

技术手段：转录组测序

Haemonchus contortus antigen identification and use of tropomyosin in ovine vaccine development

捻转血矛线虫抗原鉴定和原肌球蛋白在绵羊疫苗开发中的应用

发表单位：西弗吉尼亚大学

发表期刊：Advances in Parasitology

影响因子：7.137

技术手段：多肽芯片

Characterization of novel neutralizing mouse monoclonal antibody JM1-24-3 developed against MUC18 in metastatic melanoma

针对转移性黑素瘤针对MUC18开发的新型中和小鼠单克隆抗体JM1-24-3的表征

发表单位：安德森癌症中心

发表期刊：Journal of Experimental & Clinical Cancer Research

影响因子：7.068

deepEA: a containerized web server for interactive analysis of
epitranscriptome sequencingdeepEA：基于Web界面的RNA修饰测序数据整合分析平台发表单位：西北农林科技大学发表期刊：Plant Physiology影响因子：6.902技术手段：m6A测序，云平台

Association between circadian rhythm disruption and polycystic ovary syndrome

昼夜节律紊乱与多囊卵巢综合征的关系

发表单位：浙江大学

发表期刊：Fertility and Sterility

影响因子：6.312

技术手段：转录组测序

Tyrosine supplement ameliorates murine aGVHD by modulation of gut microbiome and metabolome

补充酪氨酸可调节肠道微生物组和代谢组从而改善小鼠急性移植物抗宿主病

发表单位：浙江大学医学院第一附属医院

发表期刊：EBioMedicine

影响因子：5.736

技术手段：16S测序、非靶代谢组

Transcriptomic and genetic approaches reveal an essential role of the NAC transcription factor SlNAP1 in the growth and defense response of tomato

转录组学和基因组方法揭示了NAC转录因子SlNAP1在番茄生长和防御响应中的重要作用

发表单位：浙江大学

发表期刊：Horticulture Research

影响因子：5.404

技术手段：转录组测序

The Pathogenic Effects of Fusobacterium nucleatum on the Proliferation, Osteogenic Differentiation, and Transcriptome of Osteoblasts

核梭杆菌对成骨细胞增殖、成骨分化和转录组的致病作用

发表单位：山东大学口腔医院

发表期刊：Frontiers in Cell and Developmental Biology

影响因子：5.186

技术手段：转录组测序

LncRNAs activate longevity regulation pathway due to aging of Leydig cells caused by DEHP exposure: A transcriptome-based study

LncRNA激活由DEHP暴露引起的睾丸间质细胞衰老导致的寿命调节通路：一项基于转录组的研究

发表单位：重庆儿童医院

发表期刊：Ecotoxicology and Environmental Safety

影响因子：4.872

技术手段：转录组测序

An Essential Role of Mitochondrial a-Ketoglutarate Dehydrogenase E2 in the Basal Immune Response Against Bacterial Pathogens in Tomato

线粒体a-酮戊二酸脱氢酶E2在番茄抗病原菌基础免疫应答中的重要作用

发表单位：浙江大学

发表期刊：Frontiers in Plant Science

影响因子：4.402

技术手段：非靶代谢组

Roles of DNA Methylation in Cold Priming in Tartary Buckwheat

DNA甲基化在苦荞冷激发中的作用

发表单位：兰州大学

发表期刊：Frontiers in Plant Science

影响因子：4.402

技术手段：转录组测序、BSA

Vm-milR37 contributes to pathogenicity by regulating glutathione peroxidase gene VmGP in Valsa mali

Vm-milR37通过调控谷胱甘肽过氧化物酶基因VmGP从而增强苹果树腐烂病菌的致病力

发表单位：西北农林科技大学

发表期刊：Molecular Plant Pathology

影响因子：4.326

技术手段：miRNA测序、降解组测序

Uncaria rhynchophylla ameliorates unpredictable chronic mild stress-induced depression in mice via activating 5-HT1A receptor: Insights from transcriptomics

钩藤通过激活5-HT1A受体改善小鼠不可预测的慢性轻度应激性抑郁:来自转录组学的见解

发表单位：大连医科大学

发表期刊：Phytomedicine

影响因子：4.268

技术手段：转录组测序、非靶代谢组

Gene‑regulatory network analysis of ankylosing spondylitis with a single‑cell chromatin accessible assay

单细胞染色质可分析强直性脊柱炎的基因调控网络

发表单位：深圳市人民医院

发表期刊：Scientifc Reports

影响因子：3.998

技术手段：单细胞ATAC

Integrated mRNA and small RNA sequencing for analyzing tea leaf spot pathogen Lasiodiplodia theobromae, under in vitro conditions and the course of infection

综合mRNA和小RNA测序在体外及侵染过程中分析茶叶斑病病原体可可毛色二孢菌

发表单位：贵州大学

发表期刊：Phytopathology

影响因子：3.234

技术手段：miRNA测序、转录组测序

Impacts of oral Vibrio mimicus double-targeted DNA vaccine on the gut microbiota in grass carps (Ctenopharyngodon idella) and correlations with intestinal mucosa innate immunity

口服拟弧菌双靶点DNA疫苗对草鱼肠道菌群的影响及其与肠黏膜先天免疫的相关性

发表单位：安徽农业大学

发表期刊：Aquaculture

影响因子：3.225

技术手段：16S测序

RGD-binding integrins mediated phagocytosis involved in the entry of Edwardsiella tarda into mudskipper MO/MФ

RGD结合的整联蛋白介导的吞噬作用参与了爱德华氏菌进入弹涂鱼的单核细胞/巨噬细胞

发表单位：宁波大学

发表期刊：Developmental and Comparative Immunology

影响因子：3.192

技术手段：转录组测序

Comparison of transcriptional change of B. melitensis M5-90 after macrophage infection highlights the role of ribosome gene L31 in virulence

小鼠巨噬细胞感染B.melitensis M5-90后的转录变化的比较，突出了核糖体基因L31在致病力中的作用

发表单位：中国农业科学院哈尔滨兽医研究所

发表期刊：Veterinary Microbiology

影响因子：3.03

技术手段：转录组测序

Physiological parameters and gut microbiome associated with different dietary lipid levels in hybrid yellow catfish (Tachysurus fulvidraco♀× Pseudobagrus vachellii♂)

杂交黄鲶鱼与不同饮食脂质水平相关的生理参数和肠道微生物群

发表单位：南京农业大学

发表期刊：Comparative Biochemistry and Physiology D-Genomics & Proteomics

影响因子：3.011

技术手段：16S测序

Anti-mastitis SNV identification of NFκB1 in Chinese Holstein cows and the possible anti-inflammation role of NFκB1/p105 in bovine MECs

中国荷斯坦奶牛抗乳腺炎SNV的鉴定及牛上皮细胞中NFκB1/p105的抗炎症作用

发表单位：西北农林科技大学

发表期刊：Acta Biochim Biophys Sin

影响因子：2.836

技术手段：转录组测序、miRNA测序

A strategic expression method of miR-29b and its anti-fibrotic effect based on RNAsequencing analysis

基于RNA序列分析的miR-29b战略表达方法及其抗纤维化作用

发表单位：马歇尔大学

发表期刊：Plos One

影响因子：2.74

技术手段：转录组测序

Statistical Analysis for Identifying Differentially MicroRNA in Serum Exosomes of Lead Workers

利用统计学分析鉴定铅工作者血清外泌体中差异microRNA

发表单位：华北理工大学

发表期刊：Journal of Healthcare Engineering

影响因子：1.803

技术手段：miRNA测序

A Biomarker Panel of Radiation-Upregulated miRNA as Signature for Ionizing Radiation Exposure

辐射上调的miRNA的生物标志物组作为电离辐射暴露的特征

发表单位：中国人民解放军军事医学科学院

发表期刊：Life

技术手段：miRNA芯片

Identification of microRNAs in response to low potassium stress in the shoots of Tibetan wild barley and cultivated

西藏野生大麦和栽培大麦芽对低钾胁迫响应的miRNA鉴定

发表单位：浙江大学

发表期刊：Current Plant Biology

技术手段：miRNA测序、降解组

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