联川生物在科研和医学服务领域深耕15年,是老牌的高通量技术服务公司。联川生物基于10x Genomics平台开展了包含单细胞(核)转录组、单细胞免疫组、单细胞ATAC、单细胞多组学,以及空间转录组等多种产品在内的全套科研解决方案。单细胞测序服务作为联川生物科研线主打产品之一,近些年来在国内外业务增量持续上升。为了满足更高通量的单细胞市场需求,联川生物与10x Genomics公司达成战略合作,于2021年9月引进Chromium X平台,仪器已正式到货落地联川实验室!目前实验技术人员正紧锣密鼓进行仪器性能的测试,我们近期将不间断给大家分享仪器运行的动态,敬请期待!
关于百万细胞通量的Chromium X平台,你是否还有很多问号??本期小编就来唠一唠,给您答疑解惑!随着单细胞测序技术的普及,目前科研和医学领域,需要更大规模和尽可能高的分辨率来分析细胞图谱。让大规模转化实验变得常规,这是市场的呼声,Chromium X,作为百万单细胞捕获的平台应运而生。就如同测序仪,从低通量到中等通量,再到高通量,这也是单细胞平台发展的趋势!
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在图谱研究领域,更是需要几十万甚至上百万细胞才能完整描绘出组织的细胞组成,包括细胞亚型、稀有细胞等。02
在免疫研究领域,TCR/BCR克隆亚型的丰富性,决定了只检测几千或几万个细胞是很难覆盖所有的克隆亚型信息的,需求更大通量细胞的捕获技术。03
在药物靶向筛选领域,百万级别的细胞捕获技术将会大大提升稀有细胞的检出率,解决药物筛选的通量和精度问题。
Chromium X与Chromium Controller的性能参数比较如下:
可以看出Chromium X(简称X)相较于原来的Chromium Controller(简称CC),重量大了好几倍。升级后的X有16个通道,每个通道最多可捕获2万个单细胞,相较于CC的8通道和捕获1万个细胞/通道,通量也翻了一倍。另外X还支持混样(CellPlex),一个通道理论上最多可以混12个样本,混样后每个通道可以拿到约4.6万个单个细胞,一张芯片可拿到百万个细胞。数据质量也得到更好保证,X的双细胞率降低至0.4%/1000个细胞。
X的单细胞捕获技术依然是基于Next GEM的微流控捕获原理,芯片体系得到了扩容,芯片中孔1加入Gel Beads(8孔),孔2A和2B加入Master Mix和细胞的混合体系(8孔+8孔), 3A和3B加入Oil(8孔+8孔)。反应过程与CC平台一样,细胞和反应试剂及Geal Beads被包裹在一个油滴里,每个油滴形成一个微反应体系,和细胞里的RNA被标记上相同的10x Barcode。需要指出的是,X平台兼容CC平台所有配套试剂,做到与CC平台试剂的完美嫁接。话句话说,以往在CC平台捕获得到的数据,后面批次样本实验平台更改为X平台,两批数据依然可以放在一起分析,实现无缝对接!
Chromium X兼容单细胞转录组(3’)、单细胞免疫组库(5’)、单细胞ATAC以及单细胞mRNA+ATAC多组学等应用,如下所示:
以PBMC样本为例,应用Chromium X与Chromium Controller两个平台开展的研究,在数据上显示了较好的一致性,如下所示:3’ Single Cell Gene Expression
5’ Single Cell Gene Expression
Single Cell ATAC
Single Cell Multiome ATAC + Gene Expression
目前,Chromium X已开机运行,技术人员正紧锣密鼓进行仪器性能的测试,欢迎老师们联系驻地销售,抢先体验升级版的平台!
杭州联川生物技术股份有限公司成立于2006年,是国内首批开展高通量测序服务的公司之一。公司拥有具有自主知识产权的µParaflo®微流体定制化芯片平台以及全球领先的基因合成平台,为全球各地的科研用户提供基因组、转录组、蛋白组、代谢组及最新的单细胞测序服务。联川生物的营销网络遍布全球,已经与100多个国家及地区的科研院校、医院、制药公司、农业育种公司建立起了长期的合作伙伴关系,累积产出SCI论文超过2600篇。近些年,联川生物将单细胞测序作为公司未来发展的战略方向,在组织解离和单细胞生信分析方面充分发挥自身优势,为客户提供优质的服务。转录组+脂质组学揭示骨骼肌中脂肪浸润的细胞和脂质动态 | 单细胞专题
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