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热心肠研究院推荐:《带你轻松做微生物组》

市场部 联川生物 2024-03-27
本文首发于热心肠研究院公众号

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2020年春,我们组织编写了《医学微生物组实战指南》,受到了许多微生物组研究人员,特别是博硕士研究生的好评和肯定。两年过去了,微生物组学正以更快地速度发展着,相关的研究发现和成果应用更是主刊的常客。关于微生物组学内涵和外延的认知每天都在被更新乃至改写。


不仅如此,随着单细胞测序在模式动植物中的应用不断拓展,最近Science也报道了单细胞测序技术在人类肠道菌群中的最新应用(Zheng et al. Science, 2022),微生物进入单细胞时代可能就在不远处。


《医学微生物组实战指南》


与之匹配的是,越来越多的人加入到微生物组研究者的行列中。作为国内主要的科技服务商,我们每天都能感受到研究人员对探索微生物组学奥秘的热情和强大动力,也时常遇见初学者在开启微生物组学研究时的茫然和困惑。虽然在网络上可以轻而易举地搜索到各式各样的微生物组信息,然而这些信息往往是零散和缺乏系统梳理的。

我们是不是可以做些事,来帮助初学者用更短的时间、更有效率的方式,学习并掌握当前微生物组研究的核心逻辑和思路,并把我们从数以万计微生物组项目中积累起来的经验分享出去,也许他们能因此走得更快,跑得更远。

一本既有理论知识又浓缩了大量实战经验的研究指南,是我们能想到的最好的帮助。为此,我们专门从实验中心和分析中心,召集了多位具有丰富一线经验的同事加入到研究指南的创作中。这些同事每天都在处理着各式各样的样本和数据分析问题,非常清楚初学者开展微生物组研究课题时会遇到的问题和易踩的坑。

经过数月潜心撰写,一本可以帮助研究人员快速入门与提高的工具书出版了,我们为它取名《带你轻松做微生物组》


《带你轻松做微生物组》封面


新书由五个章节组成

第一章微生物组学必备知识

帮助初学者搭建起微生物组学从实验到分析的知识框架。

第二章医学微生物组学

从实操(案例)出发,提炼医学微生物从单组学到多组学的研究思路和方法,特别从多角度阐释新热点——肿瘤微生物组的研究策略。

第三章环境微生物组学

从实操出发,对环境微生物组,特别是土壤、水体微生物组以及植物内生菌的研究思路、方法进行解析和归纳。

第四章微生物组学云工具

提供微生物组数据分析和图表绘制的高效工具。

特别章微生物组走入单细胞时代

有幸邀请到Science文章共一郑文山博士、李晓明博士,详细讲解微生物组单细胞测序新技术Microbe-seq,分享他们对单细胞微生物组学的深刻洞察和未来展望。


《带你轻松做微生物组》目录页


《带你轻松做微生物组》由近200页干货文章组成,内容尽可能做到深入浅出、图文并茂,分享的实战技法是研究人员直接能上手使用的。


《带你轻松做微生物组》内文部分


《带你轻松做微生物组》内文部分


《带你轻松做微生物组》内文部分



在本书的创作过程中,我们收到了本领域许多专家和学者的指导和帮助。多位专家还欣然接受了我们的邀请为本书作序。他们是怎样评价本书的。


 李丹宜博士

 热心肠研究院首席科学家

为了满足科研工作者、研究生学习微生物组和开展相关研究的需求,联川生物团队基于自身在微生物组数据分析和研究实战中大量积累的丰富经验,精心编撰了《带你轻松做微生物组》一书,为微生物组领域的研究者,特别是刚接触本领域的初学者,提供了一本非常系统化的指导工具书。这本书全面覆盖了微生物组研究中的常用概念、技术、研究策略、分析思路、结果解读、可视化、实用工具和数据库等多方面的内容和注意事项。


相较于他们2020年推出的《医学微生物组实战指南》,本书更注重基础知识、最新研究策略的梳理和介绍,并新增了环境微生物组的内容。在医学微生物组学部分,本书特别关注了目前的热点领域——肿瘤微生物组,并对其研究思路和进展进行了提炼和总结。除了提供大量的研究实例供读者参考,本书还特别整理了16个医学和环境微生物组数据库信息,以便读者查询。



 谢黎炜博士

 华南应用微生物国家重点实验室研究员

联川生物出版的《带你轻松做微生物组》一书覆盖了微生物组学的基础理论知识、医学和环境微生物组实践以及微生物组学工具的介绍和应用。

该书的第一章介绍了微生物组的常用术语解释、常规检测手段、数据分析方法以及常见结果解读等四部分,为微生物组学的初学者提供了非常完善的基础知识普及。同时,附带详尽的分析软件链接、方法解读以及相关案例分析。


第二、三章医学和环境微生物组由研究思路、研究方法和专业领域数据库等三部分组成,系统介绍了单组学和多组学结合的微生物组学研究设计思路,利用近三年发表的高水平学术论文作为案例,系统分析了微生物组成、结构、相对丰度和基因功能与宿主生理、疾病病理和环境生态之间的关系。


第四章系统介绍了联川生物云平台Omicstudio在微生物组学数据分析方面的应用,并为开展微生物组学研究的科研人员从样本采集、样本处理、数据分析、数据保存等方面提供了信息的普及和操作流程的介绍。

总之,该书作为微生物组学入门的工具书,为微生物组学研究领域的学生、临床医生、科研人员提供了系统的基础普及和信息梳理。



 张鑫博士

 宁波大学食品与药学学院副教授

联川生物是一家有着十多年科技服务经验的公司,做事非常踏实,在微生物组学项目上积累了丰富的经验。为满足研究人员系统学习微生物组以及实战的需求,他们把来自一线的实验和分析经验进行了系统整理,并将提炼出的内容编撰成了《带你轻松做微生物组》。


这本书注重微生物组学的基础知识的梳理,搭建起了从宏基因组学到宏代谢组学的知识框架。不仅如此,还将理论知识与微生物组实践相结合,重点阐释了医学微生物组学和环境微生物组学的研究思路和方法,这为研究生快速入门和提高,提供了针对性的指导。此外,还详细论述了新近研究热点肿瘤微生物组以及单细胞微生物组的相关内容。


整体而言,这是一本内容丰富、逻辑清晰、易于上手的微生物组学工具书,会给正在或即将开展微生物组研究的学生、临床医生以及科研人员提供有益的基础知识梳理和实战指导。


正如李丹宜博士所说的那样,我们希望借这本书,“为想要了解微生物组及其研究方法的人提供实实在在的帮助,也为推动我国的微生物组研究发展提供助力”。

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