查看原文
其他

零基础 | 单细胞多组学联合空间转录组高分文章美图速成班 开始招生!

交付中心-HBN 联川生物 2024-03-27

随着单细胞的逐渐价格平民化,越来越多的科研工作者将单细胞测序加入到了自己的课题中,并想尝试下自行分析单细胞数据。但是单细胞的数据量非常的庞大,能够得到的信息也非常的繁杂,那么如何从这一堆数据中挖出有效的数据呢


一般来说是由以下几个步骤:细胞鉴定,目的细胞的再分群和再鉴定以及后期的生物学故事挖掘。

关于细胞鉴定,我们一般通过2种方法,软件的自动化注释和人工marker鉴定。到目前为止marker的手动注释可以说被认为是细胞鉴定的金标准。此外还可以通过基因集打分的方式,通过细胞特异性表达的通路和特有的功能基因集合,求出目的细胞的所在cluster。

 

 

当我们细胞鉴定完成后,我们便要考虑计算处理前后对与细胞基因的差异来看细胞的功能发挥了什么变化,通过差异基因我们能够判断这个疾病或者生理过程起重要作用的通路是什么,判断治疗方案以及后期进⼀步实验的着力方向。此外,通过寻找高表达这个差异基因的细胞能在⼀定程度上辅助我们找到疾病特异性细胞,帮助我们后期进行进⼀步的验证试验。

此外,处理前后细胞间分化轨迹是如何的以及诱导细胞分化的驱动基因是啥也是非常值得关注的?monocle2是一款非常常见的拟时序分析软件,他利用单个细胞在细胞分化等生物学过程中的异步进展,将他们沿着响应的轨迹放置。通过拟时序分析,我们可以判定疾病发生过程中潜在的驱动基因以及疾病发生过程中起着致病作用的亚型细胞。

 

此外,细胞互作也是一个非常好的研究对象。细胞和细胞之间的互动是非常频繁的,其中起重要作用的就是分泌性蛋白,这些蛋白通过和其他细胞表面的膜受体结合并激活下游级联反应,完成信号的传递。

单细胞技术是单个细胞建库,能够全面统计到单个细胞的分泌蛋白以及受体基因的信息,基于此来进⼀步推测潜在的细胞互作信息,为解析生命过程中可能存在的分子机制提供重要的参考。

 

看完以上文字,你一定想,我不太懂代码,如何实现0代码基础来做以上分析呢?不要害怕,打开浏览器登陆一站式单细胞数据分析云平台--联川星云即可实现点击鼠标完成上述绘图。


当然如果你对代码比较感兴趣?联川生物单细胞多组学联合空间转录组高分文章美图速成班开课了!

本次课程的目的是让对单细胞充满兴趣,憧憬敲着代码就能作出精致美图的老师从更懂生物学的角度来挖掘有用数据。这次课程我们参考了众多高质量文章(包括CNS以及系列子刊),总结出一套简单易学可复现的数据分析以及展现方案,并从基础生物学逻辑的角度出发,弱化专业知识,让一个零基础的生信小白也能轻轻松松跟上节奏,画出CNS级别的文章图片。

此外,目前越来越多的文章开始了单细胞联合包括空间转录组在内的多组学分析实验来追求高分文章,联川生物在此正式将空间转录组的内容逐步纳入到整个培训班体系中,并逐步完善,本次我们将先纳入空间转录组和单细胞联合分析的思路讲解以及图例的讲解,非常欢迎大家参加。











报名须知

培训时间:2023年5月16-19日

培训费用:2000元(两人成团1800元)

上课方式:腾讯会议线上直播

课程定位:精品小班课


报名即可获得:

单细胞线上直播课程培训

+全部课程资料(软件安装包、课件、全套代码等)

+无限回看

+专业团队全程答疑

+联川星云两个月体验账号!


报名方式


付款方式

付款方式:银行对公转账(备注培训班)

户名:杭州联川生物技术股份有限公司

开户行:中国银行杭州市钱塘新区支行

账号:383158327308


点击下方图片进入云平台资料汇总:


所见即所得,绘图高规格联川云平台,让科研更自由


继续滑动看下一个
向上滑动看下一个

您可能也对以下帖子感兴趣

文章有问题?点此查看未经处理的缓存